MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002679	ACTT	2	8	188179	188186	25 %	50 %	0 %	25 %	13488239
502	NC_002679	AGAT	2	8	188190	188197	50 %	25 %	25 %	0 %	13488239
503	NC_002679	CCCA	3	12	188322	188333	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
504	NC_002679	TCAT	2	8	188627	188634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_002679	AGCC	2	8	188897	188904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_002679	ATCC	2	8	189227	189234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_002679	GATC	2	8	189882	189889	25 %	25 %	25 %	25 %	13488240
508	NC_002679	CGTC	2	8	190260	190267	0 %	25 %	25 %	50 %	13488240
509	NC_002679	TCGC	2	8	191358	191365	0 %	25 %	25 %	50 %	13488241
510	NC_002679	GCCT	2	8	191396	191403	0 %	25 %	25 %	50 %	13488241
511	NC_002679	CTGG	2	8	191420	191427	0 %	25 %	50 %	25 %	13488241
512	NC_002679	TCCT	2	8	192804	192811	0 %	50 %	0 %	50 %	13488242
513	NC_002679	AAGG	2	8	193277	193284	50 %	0 %	50 %	0 %	13488243
514	NC_002679	CGGA	2	8	193409	193416	25 %	0 %	50 %	25 %	13488243
515	NC_002679	CGGC	2	8	193726	193733	0 %	0 %	50 %	50 %	13488243
516	NC_002679	GAAG	2	8	194074	194081	50 %	0 %	50 %	0 %	13488243
517	NC_002679	CGGC	2	8	194158	194165	0 %	0 %	50 %	50 %	13488243
518	NC_002679	TCCT	2	8	195393	195400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_002679	CAGG	2	8	196123	196130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_002679	CTGG	2	8	196527	196534	0 %	25 %	50 %	25 %	13488244
521	NC_002679	TGAG	2	8	197744	197751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_002679	AGGC	2	8	198335	198342	25 %	0 %	50 %	25 %	13488245
523	NC_002679	AGCC	2	8	199711	199718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_002679	TAGA	2	8	200762	200769	50 %	25 %	25 %	0 %	13488123
525	NC_002679	CGAT	2	8	200889	200896	25 %	25 %	25 %	25 %	13488123
526	NC_002679	GACT	2	8	201054	201061	25 %	25 %	25 %	25 %	13488123
527	NC_002679	GCCA	2	8	201098	201105	25 %	0 %	25 %	50 %	13488123
528	NC_002679	TCGA	2	8	201601	201608	25 %	25 %	25 %	25 %	13488246
529	NC_002679	TGGA	2	8	202308	202315	25 %	25 %	50 %	0 %	13488246
530	NC_002679	GCCC	2	8	203077	203084	0 %	0 %	25 %	75 %	13488247
531	NC_002679	CCTC	2	8	203220	203227	0 %	25 %	0 %	75 %	13488247
532	NC_002679	CCCG	2	8	203876	203883	0 %	0 %	25 %	75 %	13488247
533	NC_002679	GGCG	2	8	204642	204649	0 %	0 %	75 %	25 %	13488248
534	NC_002679	GCAC	2	8	205235	205242	25 %	0 %	25 %	50 %	13488248
535	NC_002679	TAAT	2	8	205379	205386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_002679	GCAG	2	8	205620	205627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_002679	CCGC	2	8	205921	205928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
538	NC_002679	GTCC	2	8	206011	206018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_002679	ACGC	2	8	206342	206349	25 %	0 %	25 %	50 %	13488124
540	NC_002679	TACT	2	8	206646	206653	25 %	50 %	0 %	25 %	13488124
541	NC_002679	TCCT	2	8	206931	206938	0 %	50 %	0 %	50 %	13488125
542	NC_002679	CCCT	2	8	207816	207823	0 %	25 %	0 %	75 %	161621457
543	NC_002679	TGGC	2	8	208004	208011	0 %	25 %	50 %	25 %	161621457
544	NC_002679	CAGC	2	8	208930	208937	25 %	0 %	25 %	50 %	161621457
545	NC_002679	CTTG	2	8	209241	209248	0 %	50 %	25 %	25 %	161621457
546	NC_002679	CCTC	2	8	209393	209400	0 %	25 %	0 %	75 %	161621457
547	NC_002679	AGCC	2	8	209620	209627	25 %	0 %	25 %	50 %	161621457
548	NC_002679	CCAA	2	8	210093	210100	50 %	0 %	0 %	50 %	161621457
549	NC_002679	GCTT	2	8	210140	210147	0 %	50 %	25 %	25 %	161621457
550	NC_002679	AGGT	2	8	210380	210387	25 %	25 %	50 %	0 %	161621457
551	NC_002679	GCTC	2	8	210735	210742	0 %	25 %	25 %	50 %	13488127
552	NC_002679	CCCT	2	8	211183	211190	0 %	25 %	0 %	75 %	13488127
553	NC_002679	TTGC	2	8	211534	211541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_002679	AGGA	2	8	211966	211973	50 %	0 %	50 %	0 %	13488128
555	NC_002679	GCCC	2	8	212547	212554	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
556	NC_002679	ATCG	2	8	213009	213016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_002679	CGCC	2	8	213215	213222	0 %	0 %	25 %	75 %	13488129
558	NC_002679	GCCA	2	8	213245	213252	25 %	0 %	25 %	50 %	13488129
559	NC_002679	CCGC	2	8	213421	213428	0 %	0 %	25 %	75 %	13488370
560	NC_002679	GTCC	2	8	213965	213972	0 %	25 %	25 %	50 %	13488249
561	NC_002679	GCAA	2	8	214339	214346	50 %	0 %	25 %	25 %	13488249
562	NC_002679	ACTC	2	8	215450	215457	25 %	25 %	0 %	50 %	13488250
563	NC_002679	GCTG	2	8	215630	215637	0 %	25 %	50 %	25 %	13488250
564	NC_002679	GCTG	2	8	215822	215829	0 %	25 %	50 %	25 %	13488250
565	NC_002679	AGCC	2	8	215885	215892	25 %	0 %	25 %	50 %	13488250
566	NC_002679	TCCG	2	8	215920	215927	0 %	25 %	25 %	50 %	13488250
567	NC_002679	CCCA	2	8	216029	216036	25 %	0 %	0 %	75 %	13488250
568	NC_002679	GATT	2	8	216839	216846	25 %	50 %	25 %	0 %	13488130
569	NC_002679	TGCG	2	8	217146	217153	0 %	25 %	50 %	25 %	13488130
570	NC_002679	GACA	2	8	217210	217217	50 %	0 %	25 %	25 %	13488130
571	NC_002679	CCAG	2	8	217353	217360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
572	NC_002679	GTCG	2	8	217864	217871	0 %	25 %	50 %	25 %	13488251
573	NC_002679	TCAG	2	8	217954	217961	25 %	25 %	25 %	25 %	13488251
574	NC_002679	GCAT	2	8	218055	218062	25 %	25 %	25 %	25 %	13488251
575	NC_002679	AGCA	2	8	218359	218366	50 %	0 %	25 %	25 %	13488251
576	NC_002679	GAAG	2	8	219038	219045	50 %	0 %	50 %	0 %	13488252
577	NC_002679	TGCC	2	8	219110	219117	0 %	25 %	25 %	50 %	13488252
578	NC_002679	GGTT	2	8	219336	219343	0 %	50 %	50 %	0 %	13488252
579	NC_002679	CTGG	2	8	219613	219620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
580	NC_002679	GCCG	2	8	219705	219712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_002679	CGAT	2	8	219969	219976	25 %	25 %	25 %	25 %	13488131
582	NC_002679	CGAC	2	8	220221	220228	25 %	0 %	25 %	50 %	13488131
583	NC_002679	CGAC	2	8	220485	220492	25 %	0 %	25 %	50 %	13488131
584	NC_002679	TCCA	2	8	220928	220935	25 %	25 %	0 %	50 %	13488131
585	NC_002679	CCGG	2	8	221980	221987	0 %	0 %	50 %	50 %	13488254
586	NC_002679	GCTG	2	8	223646	223653	0 %	25 %	50 %	25 %	13488133
587	NC_002679	AACG	2	8	223850	223857	50 %	0 %	25 %	25 %	13488133
588	NC_002679	AGCC	2	8	223986	223993	25 %	0 %	25 %	50 %	13488133
589	NC_002679	TCGG	2	8	224047	224054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
590	NC_002679	GGCA	2	8	224344	224351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_002679	CGAT	2	8	224704	224711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
592	NC_002679	GCTT	2	8	225813	225820	0 %	50 %	25 %	25 %	13488257
593	NC_002679	CCCG	2	8	226088	226095	0 %	0 %	25 %	75 %	13488257
594	NC_002679	TCGA	2	8	226271	226278	25 %	25 %	25 %	25 %	13488257
595	NC_002679	GGCA	3	12	226613	226624	25 %	0 %	50 %	25 %	13488257
596	NC_002679	GCGG	2	8	227036	227043	0 %	0 %	75 %	25 %	13488258
597	NC_002679	GCAG	2	8	227445	227452	25 %	0 %	50 %	25 %	13488339
598	NC_002679	GTCG	2	8	227667	227674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_002679	GAAG	2	8	228316	228323	50 %	0 %	50 %	0 %	13488259
600	NC_002679	GAAG	2	8	228532	228539	50 %	0 %	50 %	0 %	13488259
601	NC_002679	TCGG	2	8	228908	228915	0 %	25 %	50 %	25 %	13488259
602	NC_002679	CGGC	2	8	228978	228985	0 %	0 %	50 %	50 %	13488259
603	NC_002679	GATC	2	8	229446	229453	25 %	25 %	25 %	25 %	13488261
604	NC_002679	CGAT	2	8	229915	229922	25 %	25 %	25 %	25 %	13488262
605	NC_002679	CGAG	2	8	230227	230234	25 %	0 %	50 %	25 %	13488262
606	NC_002679	CCTG	2	8	230894	230901	0 %	25 %	25 %	50 %	13488262
607	NC_002679	GGTT	2	8	231534	231541	0 %	50 %	50 %	0 %	13488262
608	NC_002679	ATCG	2	8	231827	231834	25 %	25 %	25 %	25 %	13488262
609	NC_002679	TCTT	2	8	232129	232136	0 %	75 %	0 %	25 %	13488262
610	NC_002679	GGGA	2	8	232137	232144	25 %	0 %	75 %	0 %	13488262
611	NC_002679	GGCA	2	8	232855	232862	25 %	0 %	50 %	25 %	13488263
612	NC_002679	CGAC	2	8	232908	232915	25 %	0 %	25 %	50 %	13488263
613	NC_002679	CTTG	2	8	233074	233081	0 %	50 %	25 %	25 %	13488264
614	NC_002679	CGAG	2	8	233163	233170	25 %	0 %	50 %	25 %	13488264
615	NC_002679	ACCG	2	8	233180	233187	25 %	0 %	25 %	50 %	13488264
616	NC_002679	TCGA	2	8	233594	233601	25 %	25 %	25 %	25 %	13488264
617	NC_002679	ATCG	2	8	233696	233703	25 %	25 %	25 %	25 %	13488264
618	NC_002679	GGTG	2	8	234092	234099	0 %	25 %	75 %	0 %	13488265
619	NC_002679	GGCC	2	8	234101	234108	0 %	0 %	50 %	50 %	13488265
620	NC_002679	TTCG	2	8	234260	234267	0 %	50 %	25 %	25 %	13488265
621	NC_002679	TCTT	2	8	234532	234539	0 %	75 %	0 %	25 %	13488265
622	NC_002679	GCTG	2	8	234609	234616	0 %	25 %	50 %	25 %	13488265
623	NC_002679	GCGG	2	8	234828	234835	0 %	0 %	75 %	25 %	13488265
624	NC_002679	CACC	2	8	235775	235782	25 %	0 %	0 %	75 %	13488266
625	NC_002679	GCGG	2	8	236085	236092	0 %	0 %	75 %	25 %	13488267
626	NC_002679	AGCG	2	8	236406	236413	25 %	0 %	50 %	25 %	13488267
627	NC_002679	GAAC	2	8	236540	236547	50 %	0 %	25 %	25 %	13488267
628	NC_002679	GCAG	2	8	237035	237042	25 %	0 %	50 %	25 %	13488268
629	NC_002679	GTGG	2	8	237610	237617	0 %	25 %	75 %	0 %	13488268
630	NC_002679	GATC	2	8	238737	238744	25 %	25 %	25 %	25 %	13488269
631	NC_002679	GCGG	2	8	238849	238856	0 %	0 %	75 %	25 %	13488269
632	NC_002679	CCCT	2	8	239077	239084	0 %	25 %	0 %	75 %	13488270
633	NC_002679	GTTG	2	8	239150	239157	0 %	50 %	50 %	0 %	13488270
634	NC_002679	CAGC	2	8	239171	239178	25 %	0 %	25 %	50 %	13488270
635	NC_002679	TGGG	2	8	239383	239390	0 %	25 %	75 %	0 %	13488270
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