MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 7227

< Previous123456789101112131415Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002679	TCCC	2	8	248208	248215	0 %	25 %	0 %	75 %	13488276
5002	NC_002679	GCCCC	2	10	248255	248264	0 %	0 %	20 %	80 %	13488276
5003	NC_002679	CGC	2	6	248317	248322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488276
5004	NC_002679	GTC	2	6	248369	248374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488276
5005	NC_002679	GAC	2	6	248526	248531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488277
5006	NC_002679	CGT	2	6	248535	248540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488277
5007	NC_002679	CCA	2	6	248564	248569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488277
5008	NC_002679	GC	3	6	248661	248666	0 %	0 %	50 %	50 %	13488277
5009	NC_002679	CTG	2	6	248809	248814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488277
5010	NC_002679	CGG	2	6	248868	248873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488277
5011	NC_002679	CTT	2	6	248923	248928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488277
5012	NC_002679	CGA	2	6	248934	248939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488277
5013	NC_002679	TCG	2	6	248990	248995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488277
5014	NC_002679	CAG	2	6	249001	249006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488277
5015	NC_002679	TCA	2	6	249029	249034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488277
5016	NC_002679	GTG	2	6	249049	249054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488277
5017	NC_002679	TCG	2	6	249074	249079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488277
5018	NC_002679	GGT	2	6	249096	249101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488277
5019	NC_002679	GC	3	6	249111	249116	0 %	0 %	50 %	50 %	13488277
5020	NC_002679	GCC	2	6	249222	249227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488277
5021	NC_002679	GTC	2	6	249272	249277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488277
5022	NC_002679	CGG	2	6	249334	249339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488277
5023	NC_002679	ATC	2	6	249420	249425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488278
5024	NC_002679	GTC	2	6	249426	249431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488278
5025	NC_002679	TTC	2	6	249444	249449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488278
5026	NC_002679	CGC	2	6	249629	249634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488278
5027	NC_002679	TGC	2	6	249676	249681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488278
5028	NC_002679	CGGT	2	8	249759	249766	0 %	25 %	50 %	25 %	13488278
5029	NC_002679	GAT	2	6	249767	249772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488278
5030	NC_002679	GGCGG	2	10	249918	249927	0 %	0 %	80 %	20 %	13488278
5031	NC_002679	CG	3	6	249935	249940	0 %	0 %	50 %	50 %	13488278
5032	NC_002679	CGT	2	6	249983	249988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488278
5033	NC_002679	GCC	2	6	249990	249995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488278
5034	NC_002679	CAC	3	9	250029	250037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488278
5035	NC_002679	CAT	2	6	250052	250057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488278
5036	NC_002679	TCC	2	6	250201	250206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488278
5037	NC_002679	TGA	2	6	250240	250245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488278
5038	NC_002679	CGT	2	6	250262	250267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488278
5039	NC_002679	GC	3	6	250287	250292	0 %	0 %	50 %	50 %	13488278
5040	NC_002679	AGA	2	6	250321	250326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488279
5041	NC_002679	TGC	2	6	250378	250383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
5042	NC_002679	CGG	2	6	250390	250395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488279
5043	NC_002679	CGC	2	6	250399	250404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488279
5044	NC_002679	GCC	2	6	250454	250459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488279
5045	NC_002679	CTTCGG	2	12	250460	250471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
5046	NC_002679	CGA	2	6	250499	250504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488279
5047	NC_002679	TTA	2	6	250532	250537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488279
5048	NC_002679	TCG	2	6	250591	250596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
5049	NC_002679	GCC	2	6	250617	250622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488279
5050	NC_002679	TGC	2	6	250654	250659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
5051	NC_002679	TCG	2	6	250693	250698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
5052	NC_002679	TTC	2	6	250716	250721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488279
5053	NC_002679	GTC	2	6	250740	250745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
5054	NC_002679	ATGG	2	8	250762	250769	25 %	25 %	50 %	0 %	13488279
5055	NC_002679	CG	3	6	250778	250783	0 %	0 %	50 %	50 %	13488279
5056	NC_002679	CG	3	6	250787	250792	0 %	0 %	50 %	50 %	13488279
5057	NC_002679	GC	3	6	250813	250818	0 %	0 %	50 %	50 %	13488279
5058	NC_002679	ATCT	2	8	250866	250873	25 %	50 %	0 %	25 %	13488279
5059	NC_002679	CTT	2	6	250905	250910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488279
5060	NC_002679	TCCT	2	8	250962	250969	0 %	50 %	0 %	50 %	13488279
5061	NC_002679	CG	4	8	251038	251045	0 %	0 %	50 %	50 %	13488279
5062	NC_002679	CATCGT	2	12	251069	251080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13488279
5063	NC_002679	GCCGTC	2	12	251088	251099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488279
5064	NC_002679	A	6	6	251169	251174	100 %	0 %	0 %	0 %	13488280
5065	NC_002679	TTG	2	6	251188	251193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488280
5066	NC_002679	CGC	2	6	251277	251282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488280
5067	NC_002679	CGA	2	6	251323	251328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488280
5068	NC_002679	CTG	2	6	251418	251423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488280
5069	NC_002679	CGA	2	6	251428	251433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488280
5070	NC_002679	CAGG	2	8	251447	251454	25 %	0 %	50 %	25 %	13488280
5071	NC_002679	GCT	2	6	251469	251474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488280
5072	NC_002679	TGG	2	6	251526	251531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488280
5073	NC_002679	GGC	2	6	251588	251593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
5074	NC_002679	TGC	2	6	251666	251671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488280
5075	NC_002679	CGG	2	6	251675	251680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
5076	NC_002679	CG	3	6	251727	251732	0 %	0 %	50 %	50 %	13488280
5077	NC_002679	CTTG	2	8	251741	251748	0 %	50 %	25 %	25 %	13488280
5078	NC_002679	GCC	2	6	251759	251764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488280
5079	NC_002679	CGG	2	6	251830	251835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
5080	NC_002679	CAT	2	6	251981	251986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488280
5081	NC_002679	GCC	2	6	252039	252044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488280
5082	NC_002679	ACC	2	6	252103	252108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488280
5083	NC_002679	TTCG	2	8	252164	252171	0 %	50 %	25 %	25 %	13488280
5084	NC_002679	CCGG	2	8	252245	252252	0 %	0 %	50 %	50 %	13488280
5085	NC_002679	GAT	2	6	252264	252269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488280
5086	NC_002679	GGC	2	6	252291	252296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
5087	NC_002679	GGC	2	6	252317	252322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
5088	NC_002679	AGA	2	6	252404	252409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488280
5089	NC_002679	GAA	2	6	252462	252467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_002679	CG	3	6	252496	252501	0 %	0 %	50 %	50 %	13488281
5091	NC_002679	TG	3	6	252505	252510	0 %	50 %	50 %	0 %	13488281
5092	NC_002679	TAG	2	6	252522	252527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488281
5093	NC_002679	CTG	2	6	252620	252625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
5094	NC_002679	TGC	2	6	252706	252711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
5095	NC_002679	GCT	2	6	252733	252738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
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5098	NC_002679	GCGA	2	8	252847	252854	25 %	0 %	50 %	25 %	13488281
5099	NC_002679	TCT	2	6	252859	252864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488281
5100	NC_002679	TCG	2	6	252924	252929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
5101	NC_002679	TCA	2	6	252960	252965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488281
5102	NC_002679	ATG	2	6	252968	252973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488281
5103	NC_002679	CCG	2	6	253027	253032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488281
5104	NC_002679	AAG	2	6	253034	253039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488281
5105	NC_002679	GAG	2	6	253058	253063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488281
5106	NC_002679	CAA	2	6	253103	253108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488281
5107	NC_002679	CCG	2	6	253115	253120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488281
5108	NC_002679	CGA	2	6	253128	253133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488281
5109	NC_002679	GCCA	2	8	253169	253176	25 %	0 %	25 %	50 %	13488281
5110	NC_002679	CGA	2	6	253201	253206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488281
5111	NC_002679	CGA	2	6	253242	253247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488281
5112	NC_002679	CG	4	8	253265	253272	0 %	0 %	50 %	50 %	13488281
5113	NC_002679	CAT	2	6	253309	253314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488281
5114	NC_002679	CGG	2	6	253318	253323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488281
5115	NC_002679	CTG	2	6	253409	253414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
5116	NC_002679	GCC	2	6	253433	253438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488281
5117	NC_002679	CCG	2	6	253485	253490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488281
5118	NC_002679	TCG	2	6	253560	253565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
5119	NC_002679	A	6	6	253642	253647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_002679	AGC	2	6	253675	253680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488282
5121	NC_002679	GGC	2	6	253751	253756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488282
5122	NC_002679	TGG	2	6	253832	253837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488282
5123	NC_002679	CAA	2	6	253934	253939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488282
5124	NC_002679	GGC	2	6	253955	253960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488282
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5144	NC_002679	TGG	2	6	254724	254729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488283
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5147	NC_002679	CTG	2	6	254993	254998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488284
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5183	NC_002679	GCC	2	6	256536	256541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488285
5184	NC_002679	CGTC	2	8	256547	256554	0 %	25 %	25 %	50 %	13488285
5185	NC_002679	CGA	2	6	256569	256574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488285
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5212	NC_002679	TCC	2	6	257540	257545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488361
5213	NC_002679	TGA	2	6	257575	257580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488287
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5228	NC_002679	ACC	2	6	258264	258269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488287
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5231	NC_002679	CCGG	2	8	258436	258443	0 %	0 %	50 %	50 %	13488288
5232	NC_002679	GGC	2	6	258449	258454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488288
5233	NC_002679	CACGC	2	10	258488	258497	20 %	0 %	20 %	60 %	13488288
5234	NC_002679	GA	3	6	258517	258522	50 %	0 %	50 %	0 %	13488288
5235	NC_002679	TGC	2	6	258565	258570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488288
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5238	NC_002679	GCG	2	6	258671	258676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488288
5239	NC_002679	GAA	2	6	258686	258691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488288
5240	NC_002679	GAC	2	6	258722	258727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488288
5241	NC_002679	GCG	2	6	258733	258738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488288
5242	NC_002679	GCC	2	6	258744	258749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488288
5243	NC_002679	CGA	2	6	258754	258759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488288
5244	NC_002679	TCA	2	6	258777	258782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488288
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5361	NC_002679	CGCC	2	8	264145	264152	0 %	0 %	25 %	75 %	13488135
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5442	NC_002679	GCGA	2	8	267799	267806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5480	NC_002679	ACGCA	2	10	269946	269955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5484	NC_002679	GAC	2	6	270141	270146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5486	NC_002679	CTC	2	6	270269	270274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5487	NC_002679	TCGG	2	8	270278	270285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5488	NC_002679	GAC	2	6	270288	270293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5493	NC_002679	AT	3	6	270656	270661	50 %	50 %	0 %	0 %	13488295
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5496	NC_002679	GCT	2	6	270901	270906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488295
5497	NC_002679	GC	3	6	270918	270923	0 %	0 %	50 %	50 %	13488295
5498	NC_002679	TCGC	2	8	271105	271112	0 %	25 %	25 %	50 %	13488295
5499	NC_002679	CG	3	6	271118	271123	0 %	0 %	50 %	50 %	13488295
5500	NC_002679	CTC	2	6	271140	271145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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