MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 164482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_002678	GAG	2	6	42954	42959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470370
1003	NC_002678	CAC	2	6	42995	43000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470370
1004	NC_002678	CGC	2	6	43009	43014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470370
1005	NC_002678	GCG	2	6	43070	43075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470370
1006	NC_002678	CGA	2	6	43076	43081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1007	NC_002678	GGTCC	2	10	43084	43093	0 %	20 %	40 %	40 %	13470370
1008	NC_002678	AGT	2	6	43098	43103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470370
1009	NC_002678	CAG	2	6	43106	43111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1010	NC_002678	GGC	2	6	43145	43150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470370
1011	NC_002678	CTT	2	6	43163	43168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470370
1012	NC_002678	GCA	2	6	43252	43257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1013	NC_002678	TCG	2	6	43272	43277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1014	NC_002678	TTCCTT	2	12	43334	43345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470370
1015	NC_002678	GCA	2	6	43354	43359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1016	NC_002678	CAT	2	6	43391	43396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470370
1017	NC_002678	CTC	2	6	43415	43420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470370
1018	NC_002678	GTCGAG	2	12	43436	43447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13470370
1019	NC_002678	CCG	2	6	43483	43488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470370
1020	NC_002678	GGCC	2	8	43498	43505	0 %	0 %	50 %	50 %	13470370
1021	NC_002678	AGGC	2	8	43554	43561	25 %	0 %	50 %	25 %	13470370
1022	NC_002678	TCG	2	6	43617	43622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1023	NC_002678	GTC	2	6	43628	43633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1024	NC_002678	TGG	2	6	43651	43656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470370
1025	NC_002678	CGC	2	6	43657	43662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470370
1026	NC_002678	GAC	2	6	43697	43702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1027	NC_002678	CGG	2	6	43759	43764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470370
1028	NC_002678	CCG	2	6	43854	43859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470370
1029	NC_002678	CGA	2	6	43879	43884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1030	NC_002678	GGT	2	6	43900	43905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470370
1031	NC_002678	GC	3	6	43909	43914	0 %	0 %	50 %	50 %	13470370
1032	NC_002678	AGCGC	2	10	43918	43927	20 %	0 %	40 %	40 %	13470370
1033	NC_002678	CGC	2	6	43934	43939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470370
1034	NC_002678	GCC	2	6	43979	43984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470370
1035	NC_002678	CGC	2	6	43994	43999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470370
1036	NC_002678	GGT	2	6	44026	44031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470370
1037	NC_002678	GAC	2	6	44051	44056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1038	NC_002678	TCGCCG	2	12	44061	44072	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13470370
1039	NC_002678	CGT	2	6	44123	44128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470370
1040	NC_002678	CTT	2	6	44147	44152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470370
1041	NC_002678	GCG	2	6	44323	44328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_002678	A	6	6	44406	44411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002678	CAA	2	6	44421	44426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_002678	TGA	2	6	44429	44434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_002678	GGGT	2	8	44438	44445	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_002678	CAAG	2	8	44584	44591	50 %	0 %	25 %	25 %	13470371
1047	NC_002678	AAGA	2	8	44594	44601	75 %	0 %	25 %	0 %	13470371
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1049	NC_002678	ACC	2	6	44642	44647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470371
1050	NC_002678	AAG	2	6	44681	44686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470371
1051	NC_002678	AGG	2	6	44706	44711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470371
1052	NC_002678	TCG	2	6	44787	44792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470372
1053	NC_002678	AGG	2	6	44793	44798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470372
1054	NC_002678	CGC	2	6	44830	44835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1055	NC_002678	CGGC	2	8	44889	44896	0 %	0 %	50 %	50 %	13470372
1056	NC_002678	CTCGTC	2	12	44903	44914	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13470372
1057	NC_002678	AGCC	2	8	45025	45032	25 %	0 %	25 %	50 %	13470372
1058	NC_002678	CTGGC	2	10	45096	45105	0 %	20 %	40 %	40 %	13470372
1059	NC_002678	CAG	2	6	45137	45142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470372
1060	NC_002678	GCC	2	6	45152	45157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1061	NC_002678	TCA	2	6	45160	45165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470372
1062	NC_002678	AGCC	2	8	45213	45220	25 %	0 %	25 %	50 %	13470372
1063	NC_002678	GCC	2	6	45234	45239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1064	NC_002678	GCC	2	6	45254	45259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1065	NC_002678	CGA	2	6	45262	45267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470372
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1067	NC_002678	GCAA	2	8	45291	45298	50 %	0 %	25 %	25 %	13470372
1068	NC_002678	TCG	2	6	45309	45314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470372
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1071	NC_002678	CG	3	6	45372	45377	0 %	0 %	50 %	50 %	13470372
1072	NC_002678	CGG	2	6	45394	45399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470372
1073	NC_002678	GTC	2	6	45405	45410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470372
1074	NC_002678	ATC	2	6	45444	45449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470372
1075	NC_002678	GC	3	6	45463	45468	0 %	0 %	50 %	50 %	13470372
1076	NC_002678	TCG	2	6	45501	45506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470372
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1079	NC_002678	AGGTG	2	10	45568	45577	20 %	20 %	60 %	0 %	13470372
1080	NC_002678	GCG	2	6	45612	45617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470372
1081	NC_002678	CGC	2	6	45620	45625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1082	NC_002678	CCG	2	6	45631	45636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1083	NC_002678	CGG	2	6	45667	45672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470372
1084	NC_002678	GCCA	2	8	45693	45700	25 %	0 %	25 %	50 %	13470372
1085	NC_002678	GAT	2	6	45763	45768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470372
1086	NC_002678	CAA	2	6	45796	45801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470372
1087	NC_002678	GCC	2	6	45825	45830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1088	NC_002678	GC	3	6	45921	45926	0 %	0 %	50 %	50 %	13470372
1089	NC_002678	CGC	2	6	45958	45963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1090	NC_002678	GCA	2	6	45982	45987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470372
1091	NC_002678	AGT	2	6	46016	46021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470372
1092	NC_002678	GCG	2	6	46048	46053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470372
1093	NC_002678	GCC	2	6	46136	46141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470372
1094	NC_002678	ATCA	2	8	46212	46219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_002678	AGAA	2	8	46253	46260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_002678	CCG	2	6	46345	46350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470373
1097	NC_002678	TCGC	2	8	46370	46377	0 %	25 %	25 %	50 %	13470373
1098	NC_002678	GCC	2	6	46413	46418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470373
1099	NC_002678	TGAC	2	8	46434	46441	25 %	25 %	25 %	25 %	13470373
1100	NC_002678	CGAT	2	8	46560	46567	25 %	25 %	25 %	25 %	13470374
1101	NC_002678	GGC	2	6	46634	46639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470374
1102	NC_002678	CACC	2	8	46733	46740	25 %	0 %	0 %	75 %	13470374
1103	NC_002678	CTG	2	6	46777	46782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470374
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1105	NC_002678	CGCA	2	8	46925	46932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_002678	CAG	2	6	46979	46984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_002678	GAA	2	6	47027	47032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_002678	CGAGC	2	10	47051	47060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1109	NC_002678	GGCC	2	8	47116	47123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_002678	CAC	2	6	47141	47146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_002678	TGCG	2	8	47226	47233	0 %	25 %	50 %	25 %	13470375
1112	NC_002678	TCA	2	6	47247	47252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470375
1113	NC_002678	GCC	2	6	47314	47319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470375
1114	NC_002678	CAG	2	6	47461	47466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470375
1115	NC_002678	GCG	3	9	47537	47545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_002678	GAAA	2	8	47596	47603	75 %	0 %	25 %	0 %	13470376
1117	NC_002678	TGC	2	6	47653	47658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470376
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1119	NC_002678	TTG	2	6	47734	47739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470376
1120	NC_002678	GGCG	2	8	47849	47856	0 %	0 %	75 %	25 %	13470376
1121	NC_002678	TTG	2	6	47878	47883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470376
1122	NC_002678	TCG	2	6	47918	47923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470376
1123	NC_002678	GC	3	6	47969	47974	0 %	0 %	50 %	50 %	13470376
1124	NC_002678	GCA	2	6	47993	47998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470376
1125	NC_002678	CTC	2	6	48018	48023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470376
1126	NC_002678	ACC	2	6	48040	48045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470376
1127	NC_002678	CGA	2	6	48050	48055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470376
1128	NC_002678	CGG	3	9	48138	48146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470376
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1257	NC_002678	TG	3	6	53892	53897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_002678	TCA	2	6	53920	53925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_002678	GA	3	6	53927	53932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_002678	TCA	2	6	54013	54018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1385	NC_002678	GAT	2	6	59647	59652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470390
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1483	NC_002678	GCC	2	6	63847	63852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470395
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1491	NC_002678	CG	3	6	64204	64209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1492	NC_002678	CGATTG	2	12	64244	64255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13470396
1493	NC_002678	CCA	2	6	64286	64291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470396
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1495	NC_002678	GAT	2	6	64399	64404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470396
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1497	NC_002678	CGAGG	2	10	64461	64470	20 %	0 %	60 %	20 %	13470396
1498	NC_002678	GCC	2	6	64474	64479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470396
1499	NC_002678	TGC	2	6	64530	64535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470396
1500	NC_002678	GAT	2	6	64536	64541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470396

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