MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 67017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002677	TCCG	2	8	26021	26028	0 %	25 %	25 %	50 %	15826883
502	NC_002677	CAG	2	6	26033	26038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826883
503	NC_002677	TC	3	6	26061	26066	0 %	50 %	0 %	50 %	15826883
504	NC_002677	TG	3	6	26134	26139	0 %	50 %	50 %	0 %	15826883
505	NC_002677	CTT	2	6	26140	26145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826883
506	NC_002677	TCG	2	6	26163	26168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826883
507	NC_002677	GTC	2	6	26189	26194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826883
508	NC_002677	GTAG	2	8	26227	26234	25 %	25 %	50 %	0 %	15826883
509	NC_002677	GCG	2	6	26340	26345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826883
510	NC_002677	GCAC	2	8	26361	26368	25 %	0 %	25 %	50 %	15826883
511	NC_002677	TCG	2	6	26406	26411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826883
512	NC_002677	GCG	2	6	26430	26435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826883
513	NC_002677	GCG	2	6	26463	26468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826883
514	NC_002677	ACC	2	6	26471	26476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826883
515	NC_002677	GGCGAG	2	12	26486	26497	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15826883
516	NC_002677	ATT	2	6	26528	26533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15826883
517	NC_002677	GC	3	6	26535	26540	0 %	0 %	50 %	50 %	15826883
518	NC_002677	GGA	2	6	26572	26577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15826883
519	NC_002677	TCC	2	6	26699	26704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15826884
520	NC_002677	GTC	2	6	26758	26763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826884
521	NC_002677	GTC	2	6	26782	26787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826884
522	NC_002677	CCG	2	6	26923	26928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826884
523	NC_002677	AC	3	6	27098	27103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_002677	GGT	2	6	27126	27131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_002677	GAT	2	6	27188	27193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826885
526	NC_002677	TTG	2	6	27255	27260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826885
527	NC_002677	GGT	2	6	27263	27268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826885
528	NC_002677	TCG	2	6	27274	27279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826885
529	NC_002677	AC	3	6	27340	27345	50 %	0 %	0 %	50 %	15826885
530	NC_002677	CGT	2	6	27430	27435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826885
531	NC_002677	CGTAGT	2	12	27529	27540	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15826885
532	NC_002677	CGGC	2	8	27543	27550	0 %	0 %	50 %	50 %	15826885
533	NC_002677	GTC	2	6	27625	27630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826885
534	NC_002677	TCC	2	6	27636	27641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15826885
535	NC_002677	GCC	2	6	27683	27688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826885
536	NC_002677	GTT	2	6	27712	27717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826885
537	NC_002677	CCG	2	6	27795	27800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826885
538	NC_002677	CTGG	2	8	27805	27812	0 %	25 %	50 %	25 %	15826885
539	NC_002677	ACC	2	6	27875	27880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826885
540	NC_002677	TGT	2	6	28017	28022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826885
541	NC_002677	AGC	2	6	28048	28053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826885
542	NC_002677	CCGCG	2	10	28081	28090	0 %	0 %	40 %	60 %	15826885
543	NC_002677	GTA	2	6	28112	28117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826885
544	NC_002677	GCCCT	2	10	28133	28142	0 %	20 %	20 %	60 %	15826885
545	NC_002677	GGT	2	6	28176	28181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826885
546	NC_002677	CGGG	2	8	28241	28248	0 %	0 %	75 %	25 %	15826885
547	NC_002677	ACA	2	6	28266	28271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826885
548	NC_002677	GAC	2	6	28322	28327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826885
549	NC_002677	TCT	2	6	28420	28425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826885
550	NC_002677	ATG	2	6	28449	28454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826885
551	NC_002677	CGC	2	6	28515	28520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826885
552	NC_002677	CTCGA	2	10	28587	28596	20 %	20 %	20 %	40 %	15826885
553	NC_002677	ATG	2	6	28807	28812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002677	CTA	2	6	28856	28861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_002677	GAT	2	6	28863	28868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_002677	TGA	2	6	28979	28984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826886
557	NC_002677	TTTG	2	8	29030	29037	0 %	75 %	25 %	0 %	15826886
558	NC_002677	AGT	2	6	29046	29051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826886
559	NC_002677	CTGG	2	8	29071	29078	0 %	25 %	50 %	25 %	15826886
560	NC_002677	TGA	2	6	29103	29108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826886
561	NC_002677	GTTG	2	8	29119	29126	0 %	50 %	50 %	0 %	15826886
562	NC_002677	GGGTGT	2	12	29145	29156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826886
563	NC_002677	GGT	2	6	29175	29180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826886
564	NC_002677	AT	3	6	29381	29386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_002677	AG	3	6	29454	29459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_002677	TTC	2	6	29479	29484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_002677	GCA	2	6	29501	29506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_002677	CGC	2	6	29550	29555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_002677	GTTC	2	8	29560	29567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_002677	TCCG	2	8	29584	29591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
571	NC_002677	AGA	2	6	29681	29686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002677	TGT	2	6	29702	29707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_002677	TA	3	6	29767	29772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_002677	CGC	2	6	29795	29800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826887
575	NC_002677	TGT	2	6	29828	29833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826887
576	NC_002677	CACGAT	2	12	29847	29858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15826887
577	NC_002677	CGA	2	6	29885	29890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826887
578	NC_002677	GAT	2	6	29958	29963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826887
579	NC_002677	CGT	2	6	30050	30055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_002677	GA	3	6	30219	30224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_002677	ATTTT	2	10	30261	30270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_002677	GGT	2	6	30485	30490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826888
583	NC_002677	GTG	2	6	30570	30575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826888
584	NC_002677	TGG	2	6	30655	30660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_002677	CGAA	2	8	30677	30684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_002677	GCT	2	6	30924	30929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002677	CATT	2	8	30944	30951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_002677	CGG	2	6	31002	31007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_002677	GTA	2	6	31020	31025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_002677	CGG	2	6	31107	31112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_002677	GTG	2	6	31137	31142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_002677	CGCC	2	8	31147	31154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
593	NC_002677	TGT	2	6	31223	31228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_002677	TCG	2	6	31280	31285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_002677	CAG	2	6	31300	31305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_002677	GCT	2	6	31306	31311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_002677	CCA	2	6	31320	31325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_002677	GCA	2	6	31332	31337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_002677	CTGT	2	8	31391	31398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_002677	GCCAC	2	10	31424	31433	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
601	NC_002677	GCT	2	6	31463	31468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_002677	CCAG	2	8	31476	31483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
603	NC_002677	GC	3	6	31525	31530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_002677	CGG	2	6	31609	31614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_002677	CGG	2	6	31625	31630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_002677	GGC	2	6	31689	31694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_002677	ACA	2	6	31714	31719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_002677	GC	3	6	31742	31747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_002677	TGG	2	6	31768	31773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_002677	AAG	2	6	31865	31870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_002677	CGA	2	6	31935	31940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_002677	ACT	2	6	32023	32028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_002677	ATTC	2	8	32035	32042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_002677	TAG	2	6	32220	32225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_002677	GAC	2	6	32248	32253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_002677	CGC	2	6	32260	32265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_002677	CGG	2	6	32296	32301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_002677	GAA	2	6	32358	32363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_002677	CAG	2	6	32364	32369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_002677	CGC	2	6	32372	32377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_002677	CCG	2	6	32383	32388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_002677	CAG	2	6	32426	32431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_002677	CAC	2	6	32444	32449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_002677	CAG	2	6	32626	32631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_002677	AGA	2	6	32657	32662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_002677	CCGG	2	8	32718	32725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_002677	TCA	2	6	32739	32744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_002677	CGG	2	6	32764	32769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_002677	AG	3	6	32797	32802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_002677	CGCT	2	8	32803	32810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_002677	ATT	2	6	32856	32861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_002677	GCA	2	6	32896	32901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_002677	GC	3	6	32951	32956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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