MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid small ECE

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001733	AT	3	6	39	44	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001733	AT	3	6	797	802	50 %	50 %	0 %	0 %	10954533
3	NC_001733	CT	3	6	1593	1598	0 %	50 %	0 %	50 %	10954534
4	NC_001733	TA	4	8	1660	1667	50 %	50 %	0 %	0 %	10954534
5	NC_001733	AT	3	6	2202	2207	50 %	50 %	0 %	0 %	10954534
6	NC_001733	AT	3	6	2709	2714	50 %	50 %	0 %	0 %	10954534
7	NC_001733	TA	3	6	2777	2782	50 %	50 %	0 %	0 %	10954534
8	NC_001733	CT	3	6	2875	2880	0 %	50 %	0 %	50 %	10954534
9	NC_001733	AC	3	6	2917	2922	50 %	0 %	0 %	50 %	10954534
10	NC_001733	CT	3	6	3424	3429	0 %	50 %	0 %	50 %	10954534
11	NC_001733	AT	3	6	4162	4167	50 %	50 %	0 %	0 %	10954534
12	NC_001733	AT	3	6	5023	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	10954535
13	NC_001733	TA	3	6	6325	6330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001733	TC	3	6	7940	7945	0 %	50 %	0 %	50 %	10954539
15	NC_001733	AT	3	6	8004	8009	50 %	50 %	0 %	0 %	10954539
16	NC_001733	TC	3	6	8339	8344	0 %	50 %	0 %	50 %	10954539
17	NC_001733	TC	3	6	8893	8898	0 %	50 %	0 %	50 %	10954540
18	NC_001733	TC	3	6	9195	9200	0 %	50 %	0 %	50 %	10954540
19	NC_001733	GT	3	6	9369	9374	0 %	50 %	50 %	0 %	10954540
20	NC_001733	AT	3	6	9526	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	10954540
21	NC_001733	CT	3	6	9743	9748	0 %	50 %	0 %	50 %	10954540
22	NC_001733	TC	3	6	9750	9755	0 %	50 %	0 %	50 %	10954540
23	NC_001733	AT	4	8	10082	10089	50 %	50 %	0 %	0 %	10954540
24	NC_001733	GT	3	6	10366	10371	0 %	50 %	50 %	0 %	10954540
25	NC_001733	AC	3	6	10683	10688	50 %	0 %	0 %	50 %	10954540
26	NC_001733	TC	3	6	10880	10885	0 %	50 %	0 %	50 %	10954540
27	NC_001733	TC	3	6	10943	10948	0 %	50 %	0 %	50 %	10954540
28	NC_001733	CT	3	6	11308	11313	0 %	50 %	0 %	50 %	10954540
29	NC_001733	TA	3	6	11629	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	10954540
30	NC_001733	CT	3	6	11694	11699	0 %	50 %	0 %	50 %	10954540
31	NC_001733	AT	3	6	11731	11736	50 %	50 %	0 %	0 %	10954540
32	NC_001733	TA	3	6	12227	12232	50 %	50 %	0 %	0 %	10954541
33	NC_001733	TA	3	6	12348	12353	50 %	50 %	0 %	0 %	10954541
34	NC_001733	TA	4	8	12466	12473	50 %	50 %	0 %	0 %	10954541
35	NC_001733	AC	3	6	12484	12489	50 %	0 %	0 %	50 %	10954541
36	NC_001733	TA	3	6	12580	12585	50 %	50 %	0 %	0 %	10954541
37	NC_001733	AC	4	8	13065	13072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_001733	TA	3	6	13222	13227	50 %	50 %	0 %	0 %	10954542
39	NC_001733	TC	3	6	14715	14720	0 %	50 %	0 %	50 %	161579527
40	NC_001733	AT	3	6	14832	14837	50 %	50 %	0 %	0 %	161579527
41	NC_001733	AT	3	6	15048	15053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001733	AT	3	6	15627	15632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001733	AT	3	6	15664	15669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001733	AT	3	6	15694	15699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001733	AG	3	6	16241	16246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.