MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	A	6	6	193	198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001732	T	6	6	419	424	0 %	100 %	0 %	0 %	10954493
3	NC_001732	A	6	6	792	797	100 %	0 %	0 %	0 %	10954493
4	NC_001732	T	6	6	1286	1291	0 %	100 %	0 %	0 %	10954494
5	NC_001732	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
6	NC_001732	T	6	6	2563	2568	0 %	100 %	0 %	0 %	10954496
7	NC_001732	A	6	6	2719	2724	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
8	NC_001732	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
9	NC_001732	A	6	6	3056	3061	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
10	NC_001732	A	6	6	3316	3321	100 %	0 %	0 %	0 %	10954489
11	NC_001732	T	8	8	3547	3554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001732	A	6	6	3680	3685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001732	A	6	6	3690	3695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001732	T	6	6	4066	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	10954497
15	NC_001732	T	6	6	4309	4314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001732	T	6	6	4448	4453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001732	A	6	6	4459	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001732	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
19	NC_001732	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
20	NC_001732	T	7	7	4923	4929	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
21	NC_001732	A	6	6	5530	5535	100 %	0 %	0 %	0 %	10954498
22	NC_001732	T	6	6	5880	5885	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
23	NC_001732	T	7	7	6468	6474	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
24	NC_001732	T	7	7	6524	6530	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
25	NC_001732	T	7	7	6581	6587	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
26	NC_001732	T	6	6	6612	6617	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
27	NC_001732	T	6	6	7264	7269	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
28	NC_001732	T	6	6	7342	7347	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
29	NC_001732	A	6	6	7729	7734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001732	A	6	6	7941	7946	100 %	0 %	0 %	0 %	10954500
31	NC_001732	A	7	7	7980	7986	100 %	0 %	0 %	0 %	10954500
32	NC_001732	A	6	6	8369	8374	100 %	0 %	0 %	0 %	10954501
33	NC_001732	A	6	6	8460	8465	100 %	0 %	0 %	0 %	10954501
34	NC_001732	A	6	6	8871	8876	100 %	0 %	0 %	0 %	10954502
35	NC_001732	A	6	6	9274	9279	100 %	0 %	0 %	0 %	10954503
36	NC_001732	A	6	6	9488	9493	100 %	0 %	0 %	0 %	10954503
37	NC_001732	T	6	6	10009	10014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001732	A	7	7	10024	10030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001732	A	6	6	10186	10191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001732	T	6	6	10455	10460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001732	T	6	6	10559	10564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001732	A	7	7	10610	10616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001732	A	6	6	10711	10716	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
44	NC_001732	A	6	6	10746	10751	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
45	NC_001732	A	6	6	10810	10815	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
46	NC_001732	A	6	6	11074	11079	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
47	NC_001732	T	6	6	11153	11158	0 %	100 %	0 %	0 %	10954504
48	NC_001732	A	7	7	11267	11273	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
49	NC_001732	A	6	6	12015	12020	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
50	NC_001732	A	6	6	12164	12169	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
51	NC_001732	A	7	7	12192	12198	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
52	NC_001732	A	6	6	12251	12256	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
53	NC_001732	A	6	6	12438	12443	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
54	NC_001732	T	6	6	12759	12764	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
55	NC_001732	T	7	7	12843	12849	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
56	NC_001732	A	6	6	12915	12920	100 %	0 %	0 %	0 %	18656943
57	NC_001732	A	7	7	13052	13058	100 %	0 %	0 %	0 %	18656943
58	NC_001732	T	6	6	13231	13236	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
59	NC_001732	T	6	6	13287	13292	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
60	NC_001732	T	6	6	13898	13903	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
61	NC_001732	A	6	6	14246	14251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001732	A	7	7	14466	14472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001732	A	6	6	14479	14484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001732	T	6	6	14681	14686	0 %	100 %	0 %	0 %	10954505
65	NC_001732	G	6	6	14701	14706	0 %	0 %	100 %	0 %	10954505
66	NC_001732	T	6	6	14889	14894	0 %	100 %	0 %	0 %	10954505
67	NC_001732	T	6	6	15609	15614	0 %	100 %	0 %	0 %	10954506
68	NC_001732	G	6	6	16082	16087	0 %	0 %	100 %	0 %	10954506
69	NC_001732	T	6	6	16145	16150	0 %	100 %	0 %	0 %	10954506
70	NC_001732	A	7	7	16731	16737	100 %	0 %	0 %	0 %	10954490
71	NC_001732	T	7	7	16797	16803	0 %	100 %	0 %	0 %	10954490
72	NC_001732	A	6	6	16952	16957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001732	A	6	6	17143	17148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001732	A	6	6	17509	17514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001732	A	6	6	18329	18334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001732	A	6	6	18354	18359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001732	A	6	6	18374	18379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001732	A	6	6	18396	18401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001732	A	6	6	18424	18429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001732	A	6	6	18556	18561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001732	A	7	7	18681	18687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001732	A	6	6	19276	19281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001732	A	7	7	19466	19472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001732	A	6	6	19664	19669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_001732	A	6	6	20521	20526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001732	T	6	6	20787	20792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001732	A	6	6	21822	21827	100 %	0 %	0 %	0 %	10954508
90	NC_001732	A	6	6	21901	21906	100 %	0 %	0 %	0 %	10954508
91	NC_001732	A	6	6	22000	22005	100 %	0 %	0 %	0 %	10954508
92	NC_001732	T	6	6	22248	22253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001732	A	6	6	22341	22346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001732	T	6	6	23778	23783	0 %	100 %	0 %	0 %	10954510
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96	NC_001732	T	6	6	24478	24483	0 %	100 %	0 %	0 %	10954510
97	NC_001732	T	6	6	25150	25155	0 %	100 %	0 %	0 %	10954512
98	NC_001732	T	6	6	25698	25703	0 %	100 %	0 %	0 %	10954512
99	NC_001732	T	6	6	25793	25798	0 %	100 %	0 %	0 %	10954512
100	NC_001732	C	6	6	26127	26132	0 %	0 %	0 %	100 %	10954512
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102	NC_001732	T	7	7	26690	26696	0 %	100 %	0 %	0 %	10954512
103	NC_001732	C	6	6	27344	27349	0 %	0 %	0 %	100 %	10954512
104	NC_001732	A	7	7	27615	27621	100 %	0 %	0 %	0 %	10954512
105	NC_001732	A	6	6	28266	28271	100 %	0 %	0 %	0 %	10954513
106	NC_001732	A	6	6	28364	28369	100 %	0 %	0 %	0 %	10954513
107	NC_001732	A	7	7	28864	28870	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
108	NC_001732	A	7	7	28918	28924	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
109	NC_001732	A	6	6	28938	28943	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
110	NC_001732	A	6	6	28963	28968	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
111	NC_001732	A	6	6	28980	28985	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
112	NC_001732	A	6	6	29003	29008	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
113	NC_001732	T	6	6	29307	29312	0 %	100 %	0 %	0 %	10954515
114	NC_001732	T	6	6	29623	29628	0 %	100 %	0 %	0 %	10954515
115	NC_001732	T	6	6	29812	29817	0 %	100 %	0 %	0 %	10954515
116	NC_001732	T	6	6	29955	29960	0 %	100 %	0 %	0 %	10954515
117	NC_001732	A	6	6	29973	29978	100 %	0 %	0 %	0 %	10954515
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119	NC_001732	T	6	6	30841	30846	0 %	100 %	0 %	0 %	10954516
120	NC_001732	T	6	6	31510	31515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_001732	T	6	6	33661	33666	0 %	100 %	0 %	0 %	10954517
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135	NC_001732	T	6	6	34893	34898	0 %	100 %	0 %	0 %	10954517
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144	NC_001732	T	7	7	35791	35797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001732	T	6	6	35812	35817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001732	T	6	6	35915	35920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001732	T	6	6	35926	35931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.