MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	ATA	2	6	60	65	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001732	TCA	2	6	85	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_001732	TTA	2	6	108	113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001732	ATT	2	6	203	208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001732	AAC	2	6	259	264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_001732	TAT	2	6	298	303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
7	NC_001732	GAA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
8	NC_001732	ATA	3	9	425	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
9	NC_001732	ATG	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
10	NC_001732	ATG	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
11	NC_001732	GAA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
12	NC_001732	TTA	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
13	NC_001732	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
14	NC_001732	TTA	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
15	NC_001732	GAA	2	6	770	775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
16	NC_001732	AAT	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
17	NC_001732	TAA	2	6	867	872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
18	NC_001732	ACT	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954493
19	NC_001732	GAA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
20	NC_001732	TGA	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
21	NC_001732	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
22	NC_001732	TAT	2	6	1080	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954494
23	NC_001732	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954494
24	NC_001732	ATA	3	9	1238	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
25	NC_001732	TAC	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
26	NC_001732	TTG	2	6	1312	1317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954494
27	NC_001732	TTC	2	6	1331	1336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954494
28	NC_001732	ATA	2	6	1347	1352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
29	NC_001732	CCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954494
30	NC_001732	ATC	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
31	NC_001732	ATA	2	6	1447	1452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
32	NC_001732	TCA	3	9	1459	1467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
33	NC_001732	TCA	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954495
34	NC_001732	ACC	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954495
35	NC_001732	ACC	2	6	1704	1709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_001732	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_001732	ACT	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_001732	AGA	3	9	1948	1956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
39	NC_001732	AAC	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
40	NC_001732	GAA	3	9	2019	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
41	NC_001732	TTA	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
42	NC_001732	CAA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
43	NC_001732	TAT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
44	NC_001732	TTA	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
45	NC_001732	TCA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954496
46	NC_001732	ATG	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
47	NC_001732	TGA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
48	NC_001732	GAG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
49	NC_001732	CAA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
50	NC_001732	GAG	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
51	NC_001732	TGG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10954496
52	NC_001732	TTG	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
53	NC_001732	TTG	2	6	3147	3152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
54	NC_001732	GAT	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
55	NC_001732	TTG	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
56	NC_001732	AGA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
57	NC_001732	TAT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
58	NC_001732	GGA	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
59	NC_001732	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954489
60	NC_001732	GAA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954489
61	NC_001732	ATA	3	9	3301	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954489
62	NC_001732	ATC	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954489
63	NC_001732	AAC	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954489
64	NC_001732	AGA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954489
65	NC_001732	CTA	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_001732	ATT	2	6	3467	3472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001732	AGA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001732	ATG	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001732	TTA	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001732	ATT	2	6	3570	3575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001732	TGA	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001732	TAT	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954497
73	NC_001732	TCC	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954497
74	NC_001732	CTC	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954497
75	NC_001732	TTC	2	6	4075	4080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954497
76	NC_001732	AAT	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954497
77	NC_001732	ATT	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001732	AAC	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_001732	TAA	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001732	CAA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_001732	TTA	2	6	4679	4684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
82	NC_001732	CTT	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
83	NC_001732	ATC	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
84	NC_001732	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
85	NC_001732	CCT	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954498
86	NC_001732	AGT	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954498
87	NC_001732	TGT	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954498
88	NC_001732	TAA	2	6	5046	5051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
89	NC_001732	TGC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10954498
90	NC_001732	TAT	2	6	5268	5273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
91	NC_001732	GTG	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10954498
92	NC_001732	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
93	NC_001732	TCA	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
94	NC_001732	TCT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
95	NC_001732	CTT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
96	NC_001732	CTA	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
97	NC_001732	ATA	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
98	NC_001732	ACT	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
99	NC_001732	TCA	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
100	NC_001732	TAA	3	9	5784	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
101	NC_001732	TCT	2	6	5854	5859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
102	NC_001732	CCT	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954499
103	NC_001732	CAT	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
104	NC_001732	GAA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
105	NC_001732	ACT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
106	NC_001732	TGC	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10954499
107	NC_001732	CTT	2	6	6197	6202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
108	NC_001732	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
109	NC_001732	CCT	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954499
110	NC_001732	TAA	2	6	6416	6421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954499
111	NC_001732	TCA	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
112	NC_001732	CAT	2	6	6500	6505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
113	NC_001732	GCA	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10954499
114	NC_001732	GAA	2	6	6679	6684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
115	NC_001732	TTG	2	6	6941	6946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954499
116	NC_001732	TAC	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
117	NC_001732	ATC	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
118	NC_001732	ATT	2	6	7080	7085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954499
119	NC_001732	AGA	2	6	7122	7127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
120	NC_001732	ATT	2	6	7128	7133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954499
121	NC_001732	TTC	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
122	NC_001732	AGA	2	6	7243	7248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
123	NC_001732	CTT	2	6	7287	7292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
124	NC_001732	ACA	2	6	7354	7359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954499
125	NC_001732	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954499
126	NC_001732	TGT	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001732	TAT	2	6	7500	7505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001732	CTA	2	6	7590	7595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_001732	TAT	2	6	7600	7605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001732	AAG	2	6	7646	7651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001732	ATA	2	6	7724	7729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001732	AGA	2	6	7809	7814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954500
133	NC_001732	TTG	2	6	7823	7828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954500
134	NC_001732	AAC	2	6	7832	7837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954500
135	NC_001732	AGA	2	6	7842	7847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954500
136	NC_001732	AAC	2	6	7883	7888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954500
137	NC_001732	GAA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954500
138	NC_001732	ACA	2	6	7958	7963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954500
139	NC_001732	ATT	2	6	7965	7970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954500
140	NC_001732	ATA	2	6	8045	8050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954500
141	NC_001732	TAA	2	6	8081	8086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954500
142	NC_001732	GAA	2	6	8244	8249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954501
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149	NC_001732	TCA	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954502
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160	NC_001732	ATG	2	6	9580	9585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954503
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163	NC_001732	CAT	2	6	9665	9670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954503
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167	NC_001732	TCC	2	6	9951	9956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_001732	TTA	2	6	10106	10111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_001732	CTG	2	6	10355	10360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_001732	ATA	2	6	10483	10488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_001732	ATA	2	6	14449	14454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_001732	ATT	2	6	15432	15437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_001732	TTC	2	6	15453	15458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954506
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400	NC_001732	TAA	2	6	23946	23951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954510
401	NC_001732	TAA	2	6	23996	24001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954510
402	NC_001732	TAA	2	6	24006	24011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954510
403	NC_001732	ATT	2	6	24117	24122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954510
404	NC_001732	ACT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954510
405	NC_001732	TTA	2	6	24406	24411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954510
406	NC_001732	AAT	2	6	24428	24433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954510
407	NC_001732	CTT	2	6	24464	24469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954510
408	NC_001732	TAA	2	6	24491	24496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954510
409	NC_001732	TAA	2	6	24515	24520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954510
410	NC_001732	CTC	2	6	24581	24586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954510
411	NC_001732	TAT	2	6	24736	24741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_001732	CAA	2	6	24745	24750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_001732	TCT	2	6	24770	24775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_001732	TCT	2	6	25028	25033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954511
415	NC_001732	ACC	2	6	25055	25060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954511
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417	NC_001732	ATA	2	6	25135	25140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954512
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421	NC_001732	CAT	2	6	25345	25350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954512
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425	NC_001732	AAG	2	6	25538	25543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954512
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432	NC_001732	TCA	2	6	26217	26222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954512
433	NC_001732	ATA	2	6	26258	26263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954512
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440	NC_001732	ATC	2	6	26957	26962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954512
441	NC_001732	CCT	2	6	27015	27020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954512
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449	NC_001732	TAT	2	6	27722	27727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_001732	TTA	2	6	27785	27790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_001732	AAG	2	6	27856	27861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_001732	TAT	2	6	27955	27960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_001732	ATT	2	6	27964	27969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_001732	TAA	2	6	28034	28039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_001732	AAT	2	6	28040	28045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_001732	CTT	2	6	29819	29824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954515
494	NC_001732	CAA	2	6	29825	29830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954515
495	NC_001732	CAT	2	6	29864	29869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954515
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