MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 83444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000962	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
2	NC_000962	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607143
3	NC_000962	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
4	NC_000962	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
5	NC_000962	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607143
6	NC_000962	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
7	NC_000962	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
8	NC_000962	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
9	NC_000962	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
10	NC_000962	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
11	NC_000962	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
12	NC_000962	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607143
13	NC_000962	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
14	NC_000962	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607143
15	NC_000962	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
16	NC_000962	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607143
17	NC_000962	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607143
18	NC_000962	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
19	NC_000962	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
20	NC_000962	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
21	NC_000962	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
22	NC_000962	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607143
23	NC_000962	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
24	NC_000962	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
25	NC_000962	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_000962	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000962	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_000962	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_000962	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000962	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000962	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000962	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_000962	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_000962	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_000962	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
36	NC_000962	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
37	NC_000962	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
38	NC_000962	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
39	NC_000962	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
40	NC_000962	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15607144
41	NC_000962	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
42	NC_000962	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
43	NC_000962	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607144
44	NC_000962	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607144
45	NC_000962	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
46	NC_000962	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607144
47	NC_000962	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
48	NC_000962	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607144
49	NC_000962	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607144
50	NC_000962	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607144
51	NC_000962	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
52	NC_000962	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607144
53	NC_000962	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
54	NC_000962	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
55	NC_000962	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
56	NC_000962	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
57	NC_000962	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607145
58	NC_000962	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607145
59	NC_000962	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
60	NC_000962	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
61	NC_000962	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607145
62	NC_000962	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
63	NC_000962	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607145
64	NC_000962	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
65	NC_000962	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
66	NC_000962	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
67	NC_000962	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
68	NC_000962	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
69	NC_000962	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
70	NC_000962	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
71	NC_000962	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
72	NC_000962	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
73	NC_000962	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607145
74	NC_000962	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607145
75	NC_000962	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
76	NC_000962	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607146
77	NC_000962	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607146
78	NC_000962	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607146
79	NC_000962	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607146
80	NC_000962	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607146
81	NC_000962	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607146
82	NC_000962	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607146
83	NC_000962	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000962	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000962	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000962	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_000962	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000962	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
89	NC_000962	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
90	NC_000962	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
91	NC_000962	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
92	NC_000962	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
93	NC_000962	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
94	NC_000962	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
95	NC_000962	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
96	NC_000962	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
97	NC_000962	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
98	NC_000962	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448824735
99	NC_000962	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
100	NC_000962	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
101	NC_000962	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
102	NC_000962	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
103	NC_000962	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
104	NC_000962	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
105	NC_000962	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
106	NC_000962	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448824735
107	NC_000962	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448824735
108	NC_000962	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
109	NC_000962	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
110	NC_000962	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
111	NC_000962	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448824735
112	NC_000962	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
113	NC_000962	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
114	NC_000962	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448824735
115	NC_000962	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448824735
116	NC_000962	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
117	NC_000962	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448824735
118	NC_000962	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
119	NC_000962	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607148
120	NC_000962	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
121	NC_000962	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
122	NC_000962	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607148
123	NC_000962	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607148
124	NC_000962	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
125	NC_000962	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
126	NC_000962	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
127	NC_000962	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
128	NC_000962	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
129	NC_000962	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607148
130	NC_000962	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
131	NC_000962	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
132	NC_000962	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607148
133	NC_000962	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
134	NC_000962	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607148
135	NC_000962	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607148
136	NC_000962	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607148
137	NC_000962	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607148
138	NC_000962	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
139	NC_000962	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607148
140	NC_000962	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
141	NC_000962	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607148
142	NC_000962	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
143	NC_000962	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
144	NC_000962	GCG	2	6	8621	8626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
145	NC_000962	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607148
146	NC_000962	CGA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
147	NC_000962	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
148	NC_000962	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
149	NC_000962	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607148
150	NC_000962	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
151	NC_000962	CGT	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
152	NC_000962	CGG	2	6	8918	8923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
153	NC_000962	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
154	NC_000962	TCG	2	6	8962	8967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
155	NC_000962	CTT	2	6	8972	8977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607148
156	NC_000962	TTC	2	6	9006	9011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607148
157	NC_000962	ACC	2	6	9012	9017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607148
158	NC_000962	GCA	2	6	9080	9085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
159	NC_000962	ACG	2	6	9268	9273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
160	NC_000962	GAC	2	6	9306	9311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
161	NC_000962	CTG	3	9	9312	9320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
162	NC_000962	CGA	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
163	NC_000962	GCT	2	6	9431	9436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
164	NC_000962	CGT	2	6	9446	9451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
165	NC_000962	CTG	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
166	NC_000962	CGG	2	6	9536	9541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
167	NC_000962	CCG	2	6	9569	9574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607148
168	NC_000962	CGA	3	9	9605	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
169	NC_000962	CGG	2	6	9638	9643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
170	NC_000962	TGA	2	6	9709	9714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607148
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172	NC_000962	CGA	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
173	NC_000962	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_000962	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_000962	CGC	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607149
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195	NC_000962	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_000962	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_000962	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
199	NC_000962	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_000962	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
201	NC_000962	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
202	NC_000962	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
203	NC_000962	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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205	NC_000962	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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208	NC_000962	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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220	NC_000962	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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234	NC_000962	CAA	2	6	13735	13740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607153
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245	NC_000962	GGC	2	6	14415	14420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607154
246	NC_000962	TGG	2	6	14447	14452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607154
247	NC_000962	CAT	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607154
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252	NC_000962	GAA	2	6	14788	14793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607154
253	NC_000962	ACT	2	6	14870	14875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607154
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255	NC_000962	ACC	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116682
256	NC_000962	GCC	2	6	15034	15039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116682
257	NC_000962	GCA	2	6	15133	15138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116682
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259	NC_000962	AGC	2	6	15367	15372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116682
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261	NC_000962	CTG	2	6	15483	15488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116682
262	NC_000962	GAC	2	6	15502	15507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116682
263	NC_000962	TGA	2	6	15610	15615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57116682
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265	NC_000962	GAC	2	6	15659	15664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607156
266	NC_000962	CGG	2	6	15877	15882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607156
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382	NC_000962	TGC	2	6	22206	22211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607160
383	NC_000962	GAT	2	6	22213	22218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607160
384	NC_000962	TCA	2	6	22245	22250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607160
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386	NC_000962	GTC	3	9	22405	22413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607160
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399	NC_000962	GTC	2	6	23337	23342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607161
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