MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2253	NC_000962	TGCTGA	2	12	94828	94839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15607228
2254	NC_000962	TCG	2	6	94875	94880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607228
2255	NC_000962	GATCGC	2	12	94898	94909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15607228
2256	NC_000962	GCC	2	6	94914	94919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607228
2257	NC_000962	CGC	2	6	94937	94942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607228
2258	NC_000962	GCT	3	9	94943	94951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607228
2259	NC_000962	GGCG	2	8	94994	95001	0 %	0 %	75 %	25 %	15607228
2260	NC_000962	GCTTG	2	10	95108	95117	0 %	40 %	40 %	20 %	15607228
2261	NC_000962	CCG	2	6	95118	95123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607228
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2263	NC_000962	GCG	2	6	95196	95201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607228
2264	NC_000962	CTG	3	9	95202	95210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607228
2265	NC_000962	TGC	2	6	95254	95259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607228
2266	NC_000962	CGG	3	9	95269	95277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607228
2267	NC_000962	GC	3	6	95278	95283	0 %	0 %	50 %	50 %	15607228
2268	NC_000962	CGG	3	9	95308	95316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607228
2269	NC_000962	TGG	2	6	95323	95328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607228
2270	NC_000962	TCG	2	6	95332	95337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607228
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2280	NC_000962	AGATC	2	10	95619	95628	40 %	20 %	20 %	20 %	15607229
2281	NC_000962	CCG	2	6	95716	95721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607229
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2291	NC_000962	CGA	2	6	96322	96327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607229
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2303	NC_000962	CGC	2	6	96649	96654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607229
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2323	NC_000962	CCTG	2	8	97678	97685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2324	NC_000962	GCGA	2	8	97722	97729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2325	NC_000962	CCG	2	6	97735	97740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2342	NC_000962	CGG	2	6	98430	98435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2343	NC_000962	ACC	2	6	98449	98454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2344	NC_000962	GAC	2	6	98561	98566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607232
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2363	NC_000962	CGGCG	2	10	99200	99209	0 %	0 %	60 %	40 %	15607232
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2366	NC_000962	CGGCG	2	10	99327	99336	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2367	NC_000962	GCC	2	6	99347	99352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2368	NC_000962	CGA	2	6	99391	99396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2369	NC_000962	ACCG	2	8	99445	99452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2370	NC_000962	TGC	2	6	99503	99508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2371	NC_000962	GC	3	6	99507	99512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2372	NC_000962	GTT	2	6	99566	99571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_000962	CG	4	8	99615	99622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2374	NC_000962	GCC	2	6	99640	99645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2375	NC_000962	CAG	2	6	99765	99770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607233
2376	NC_000962	GCC	3	9	99825	99833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607233
2377	NC_000962	GCT	2	6	99869	99874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607233
2378	NC_000962	CGAT	2	8	99878	99885	25 %	25 %	25 %	25 %	15607233
2379	NC_000962	CGG	2	6	99920	99925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607233
2380	NC_000962	GTC	2	6	99972	99977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607233
2381	NC_000962	ACCG	2	8	100049	100056	25 %	0 %	25 %	50 %	15607233
2382	NC_000962	ATCG	2	8	100089	100096	25 %	25 %	25 %	25 %	15607233
2383	NC_000962	CCG	2	6	100141	100146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607233
2384	NC_000962	GGT	2	6	100152	100157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607233
2385	NC_000962	CTA	2	6	100175	100180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607233
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2387	NC_000962	CGG	2	6	100250	100255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607233
2388	NC_000962	GCGGT	2	10	100276	100285	0 %	20 %	60 %	20 %	15607233
2389	NC_000962	CG	3	6	100329	100334	0 %	0 %	50 %	50 %	15607233
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2468	NC_000962	GTG	2	6	103674	103679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2469	NC_000962	GTC	4	12	103722	103733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607236
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2475	NC_000962	GTG	2	6	103938	103943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607236
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2480	NC_000962	GC	4	8	104279	104286	0 %	0 %	50 %	50 %	15607236
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2490	NC_000962	TCG	2	6	104599	104604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607236
2491	NC_000962	CGG	2	6	104642	104647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607236
2492	NC_000962	CGG	2	6	104672	104677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2493	NC_000962	GCGGTG	2	12	104744	104755	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2494	NC_000962	GGCTT	2	10	104809	104818	0 %	40 %	40 %	20 %	15607237
2495	NC_000962	CGGC	2	8	104830	104837	0 %	0 %	50 %	50 %	15607237
2496	NC_000962	GC	3	6	104870	104875	0 %	0 %	50 %	50 %	15607237
2497	NC_000962	GCC	2	6	104886	104891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607237
2498	NC_000962	TTC	2	6	104895	104900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607237
2499	NC_000962	GTTG	2	8	104921	104928	0 %	50 %	50 %	0 %	15607237
2500	NC_000962	GCC	2	6	104944	104949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607237

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