MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_000962	GCT	2	6	4381074	4381079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611031
109002	NC_000962	GCA	3	9	4381100	4381108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611031
109003	NC_000962	CGG	2	6	4381130	4381135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611031
109004	NC_000962	GATC	2	8	4381325	4381332	25 %	25 %	25 %	25 %	15611031
109005	NC_000962	TGC	2	6	4381364	4381369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611031
109006	NC_000962	CAG	2	6	4381383	4381388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611031
109007	NC_000962	CGT	2	6	4381394	4381399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611031
109008	NC_000962	GT	3	6	4381407	4381412	0 %	50 %	50 %	0 %	15611031
109009	NC_000962	CCG	2	6	4381423	4381428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611031
109010	NC_000962	ACC	2	6	4381453	4381458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611031
109011	NC_000962	CCG	2	6	4381484	4381489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611031
109012	NC_000962	CGG	2	6	4381592	4381597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611031
109013	NC_000962	CCG	2	6	4381619	4381624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611031
109014	NC_000962	CG	3	6	4381639	4381644	0 %	0 %	50 %	50 %	15611031
109015	NC_000962	GC	3	6	4381683	4381688	0 %	0 %	50 %	50 %	15611031
109016	NC_000962	GAT	2	6	4381716	4381721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611031
109017	NC_000962	AGC	2	6	4381762	4381767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611031
109018	NC_000962	ATC	2	6	4381768	4381773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611031
109019	NC_000962	CGG	2	6	4381778	4381783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611031
109020	NC_000962	CCA	2	6	4381790	4381795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611031
109021	NC_000962	GCG	2	6	4381816	4381821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611031
109022	NC_000962	GTC	2	6	4381833	4381838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611031
109023	NC_000962	CGC	2	6	4381869	4381874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611031
109024	NC_000962	GCC	2	6	4381880	4381885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611031
109025	NC_000962	GCG	2	6	4381961	4381966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611032
109026	NC_000962	CTG	2	6	4381976	4381981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611032
109027	NC_000962	CGG	2	6	4382008	4382013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611032
109028	NC_000962	TGA	2	6	4382041	4382046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611032
109029	NC_000962	CTG	2	6	4382142	4382147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611032
109030	NC_000962	CG	3	6	4382157	4382162	0 %	0 %	50 %	50 %	15611032
109031	NC_000962	TGGCGT	2	12	4382185	4382196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15611032
109032	NC_000962	CCA	2	6	4382218	4382223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611032
109033	NC_000962	CG	3	6	4382250	4382255	0 %	0 %	50 %	50 %	15611032
109034	NC_000962	CGC	2	6	4382297	4382302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611032
109035	NC_000962	GTC	2	6	4382341	4382346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611032
109036	NC_000962	CGG	2	6	4382353	4382358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611032
109037	NC_000962	GCAGCC	2	12	4382380	4382391	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15611032
109038	NC_000962	CG	3	6	4382418	4382423	0 %	0 %	50 %	50 %	15611032
109039	NC_000962	GGC	2	6	4382450	4382455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611032
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109041	NC_000962	GT	3	6	4382488	4382493	0 %	50 %	50 %	0 %	15611032
109042	NC_000962	GGC	2	6	4382519	4382524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611032
109043	NC_000962	GATC	2	8	4382563	4382570	25 %	25 %	25 %	25 %	15611032
109044	NC_000962	GCC	2	6	4382577	4382582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611032
109045	NC_000962	GCG	2	6	4382634	4382639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611032
109046	NC_000962	CGC	2	6	4382654	4382659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611032
109047	NC_000962	CTG	2	6	4382705	4382710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611032
109048	NC_000962	GCG	2	6	4382716	4382721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611032
109049	NC_000962	CGC	2	6	4382743	4382748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611032
109050	NC_000962	GACCA	2	10	4382886	4382895	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109051	NC_000962	ACT	2	6	4382958	4382963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109052	NC_000962	GTC	2	6	4383016	4383021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611033
109053	NC_000962	CAA	2	6	4383030	4383035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611033
109054	NC_000962	CGTCG	2	10	4383041	4383050	0 %	20 %	40 %	40 %	15611033
109055	NC_000962	ACC	2	6	4383059	4383064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611033
109056	NC_000962	GTC	2	6	4383070	4383075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611033
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109060	NC_000962	GTC	2	6	4383312	4383317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611033
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109082	NC_000962	CGC	2	6	4384074	4384079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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109102	NC_000962	TGC	2	6	4384787	4384792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611035
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109116	NC_000962	CCGGC	2	10	4385118	4385127	0 %	0 %	40 %	60 %	15611035
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109463	NC_000962	CTG	2	6	4399531	4399536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611046
109464	NC_000962	ATCGGC	2	12	4399537	4399548	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15611046
109465	NC_000962	TGC	2	6	4399554	4399559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611046
109466	NC_000962	TGG	2	6	4399568	4399573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611046
109467	NC_000962	CTG	2	6	4399576	4399581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611046
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109481	NC_000962	CCG	2	6	4399985	4399990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611046
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109485	NC_000962	CTG	2	6	4400065	4400070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611046
109486	NC_000962	ACC	2	6	4400092	4400097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611046
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109489	NC_000962	GCCA	2	8	4400166	4400173	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109490	NC_000962	GCC	2	6	4400188	4400193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611047
109491	NC_000962	GCT	2	6	4400254	4400259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611047
109492	NC_000962	GCC	2	6	4400261	4400266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611047
109493	NC_000962	GTT	2	6	4400299	4400304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611047
109494	NC_000962	CCG	2	6	4400305	4400310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611047
109495	NC_000962	TCA	2	6	4400311	4400316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611047
109496	NC_000962	CG	3	6	4400335	4400340	0 %	0 %	50 %	50 %	15611047
109497	NC_000962	CGA	2	6	4400368	4400373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611047
109498	NC_000962	GCC	2	6	4400432	4400437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611047
109499	NC_000962	CAG	2	6	4400440	4400445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611047
109500	NC_000962	AGA	2	6	4400521	4400526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611047

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