MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 2713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000916	AG	3	6	695	700	50 %	0 %	50 %	0 %	15678032
2	NC_000916	AT	3	6	859	864	50 %	50 %	0 %	0 %	15678032
3	NC_000916	CA	3	6	1426	1431	50 %	0 %	0 %	50 %	15678033
4	NC_000916	AC	3	6	2973	2978	50 %	0 %	0 %	50 %	15678035
5	NC_000916	AC	3	6	4039	4044	50 %	0 %	0 %	50 %	15678037
6	NC_000916	AC	3	6	4676	4681	50 %	0 %	0 %	50 %	15678038
7	NC_000916	TA	3	6	5167	5172	50 %	50 %	0 %	0 %	15678039
8	NC_000916	TA	3	6	5500	5505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000916	AG	3	6	6876	6881	50 %	0 %	50 %	0 %	15678044
10	NC_000916	AC	3	6	8301	8306	50 %	0 %	0 %	50 %	15678047
11	NC_000916	AC	3	6	11651	11656	50 %	0 %	0 %	50 %	15678054
12	NC_000916	AC	3	6	12040	12045	50 %	0 %	0 %	50 %	15678055
13	NC_000916	AC	4	8	14499	14506	50 %	0 %	0 %	50 %	15678058
14	NC_000916	CA	3	6	15198	15203	50 %	0 %	0 %	50 %	15678059
15	NC_000916	GA	3	6	15402	15407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000916	CT	3	6	15736	15741	0 %	50 %	0 %	50 %	15678061
17	NC_000916	CT	3	6	15925	15930	0 %	50 %	0 %	50 %	15678061
18	NC_000916	AG	3	6	16033	16038	50 %	0 %	50 %	0 %	15678061
19	NC_000916	AT	3	6	16534	16539	50 %	50 %	0 %	0 %	15678063
20	NC_000916	AG	3	6	17827	17832	50 %	0 %	50 %	0 %	15678064
21	NC_000916	AG	3	6	17957	17962	50 %	0 %	50 %	0 %	15678064
22	NC_000916	AC	3	6	18305	18310	50 %	0 %	0 %	50 %	15678065
23	NC_000916	GA	3	6	18637	18642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000916	AT	3	6	19984	19989	50 %	50 %	0 %	0 %	15678068
25	NC_000916	GA	3	6	20603	20608	50 %	0 %	50 %	0 %	15678069
26	NC_000916	CA	3	6	20668	20673	50 %	0 %	0 %	50 %	15678069
27	NC_000916	AC	3	6	20762	20767	50 %	0 %	0 %	50 %	15678069
28	NC_000916	TA	3	6	21070	21075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000916	TC	3	6	21970	21975	0 %	50 %	0 %	50 %	15678072
30	NC_000916	CA	3	6	22767	22772	50 %	0 %	0 %	50 %	15678072
31	NC_000916	CA	3	6	23826	23831	50 %	0 %	0 %	50 %	15678074
32	NC_000916	GA	3	6	23927	23932	50 %	0 %	50 %	0 %	15678074
33	NC_000916	CA	3	6	24149	24154	50 %	0 %	0 %	50 %	15678074
34	NC_000916	AG	3	6	24593	24598	50 %	0 %	50 %	0 %	15678075
35	NC_000916	TG	3	6	25254	25259	0 %	50 %	50 %	0 %	15678075
36	NC_000916	AG	3	6	27613	27618	50 %	0 %	50 %	0 %	15678078
37	NC_000916	AC	3	6	27654	27659	50 %	0 %	0 %	50 %	15678078
38	NC_000916	CA	3	6	27764	27769	50 %	0 %	0 %	50 %	15678078
39	NC_000916	AT	3	6	28163	28168	50 %	50 %	0 %	0 %	15678078
40	NC_000916	CA	3	6	28855	28860	50 %	0 %	0 %	50 %	15678079
41	NC_000916	AG	3	6	30156	30161	50 %	0 %	50 %	0 %	15678080
42	NC_000916	AC	3	6	30469	30474	50 %	0 %	0 %	50 %	15678080
43	NC_000916	AG	3	6	30505	30510	50 %	0 %	50 %	0 %	15678080
44	NC_000916	AC	3	6	32375	32380	50 %	0 %	0 %	50 %	15678081
45	NC_000916	AT	3	6	32777	32782	50 %	50 %	0 %	0 %	15678082
46	NC_000916	GT	3	6	32889	32894	0 %	50 %	50 %	0 %	15678082
47	NC_000916	CA	3	6	32983	32988	50 %	0 %	0 %	50 %	15678082
48	NC_000916	AC	3	6	33318	33323	50 %	0 %	0 %	50 %	15678082
49	NC_000916	TG	3	6	34847	34852	0 %	50 %	50 %	0 %	15678084
50	NC_000916	AT	3	6	35122	35127	50 %	50 %	0 %	0 %	15678084
51	NC_000916	TG	3	6	35389	35394	0 %	50 %	50 %	0 %	15678085
52	NC_000916	GT	3	6	36554	36559	0 %	50 %	50 %	0 %	15678087
53	NC_000916	AT	3	6	36770	36775	50 %	50 %	0 %	0 %	15678088
54	NC_000916	AT	3	6	37458	37463	50 %	50 %	0 %	0 %	15678089
55	NC_000916	TA	3	6	37875	37880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000916	AT	3	6	37911	37916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000916	TA	3	6	38541	38546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000916	GT	3	6	38615	38620	0 %	50 %	50 %	0 %	15678091
59	NC_000916	CT	3	6	38680	38685	0 %	50 %	0 %	50 %	15678091
60	NC_000916	CT	3	6	38846	38851	0 %	50 %	0 %	50 %	15678091
61	NC_000916	CT	3	6	39092	39097	0 %	50 %	0 %	50 %	15678091
62	NC_000916	TG	3	6	39243	39248	0 %	50 %	50 %	0 %	15678091
63	NC_000916	GT	3	6	39313	39318	0 %	50 %	50 %	0 %	15678091
64	NC_000916	TA	3	6	39353	39358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000916	AC	3	6	39827	39832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_000916	TA	3	6	40126	40131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000916	AT	3	6	40388	40393	50 %	50 %	0 %	0 %	15678093
68	NC_000916	AT	3	6	42051	42056	50 %	50 %	0 %	0 %	15679902
69	NC_000916	CT	3	6	42234	42239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000916	TC	3	6	42681	42686	0 %	50 %	0 %	50 %	15678098
71	NC_000916	AT	3	6	42769	42774	50 %	50 %	0 %	0 %	15678098
72	NC_000916	AT	3	6	42792	42797	50 %	50 %	0 %	0 %	15678098
73	NC_000916	TG	3	6	43122	43127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000916	CT	3	6	44447	44452	0 %	50 %	0 %	50 %	15678101
75	NC_000916	TG	3	6	44802	44807	0 %	50 %	50 %	0 %	15678101
76	NC_000916	AT	3	6	45662	45667	50 %	50 %	0 %	0 %	15678102
77	NC_000916	AT	3	6	45789	45794	50 %	50 %	0 %	0 %	15678103
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85	NC_000916	AT	3	6	54283	54288	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
86	NC_000916	AT	3	6	54402	54407	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
87	NC_000916	AT	3	6	54421	54426	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
88	NC_000916	GC	3	6	54944	54949	0 %	0 %	50 %	50 %	15678115
89	NC_000916	AT	3	6	56223	56228	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
90	NC_000916	AG	3	6	56610	56615	50 %	0 %	50 %	0 %	15678115
91	NC_000916	GT	3	6	57075	57080	0 %	50 %	50 %	0 %	15678117
92	NC_000916	TA	3	6	57188	57193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000916	TA	3	6	57306	57311	50 %	50 %	0 %	0 %	15678118
94	NC_000916	CA	3	6	57695	57700	50 %	0 %	0 %	50 %	15678119
95	NC_000916	CT	3	6	57812	57817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_000916	AT	3	6	59204	59209	50 %	50 %	0 %	0 %	15678123
97	NC_000916	GC	3	6	59325	59330	0 %	0 %	50 %	50 %	15678123
98	NC_000916	AT	5	10	60574	60583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000916	AC	4	8	60876	60883	50 %	0 %	0 %	50 %	15678126
100	NC_000916	AT	3	6	61124	61129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000916	CT	3	6	61252	61257	0 %	50 %	0 %	50 %	15678127
102	NC_000916	AT	3	6	61771	61776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_000916	GA	3	6	63470	63475	50 %	0 %	50 %	0 %	15678129
107	NC_000916	AG	3	6	64835	64840	50 %	0 %	50 %	0 %	15678132
108	NC_000916	TA	3	6	65739	65744	50 %	50 %	0 %	0 %	15678132
109	NC_000916	CT	3	6	67205	67210	0 %	50 %	0 %	50 %	15678133
110	NC_000916	CA	3	6	67588	67593	50 %	0 %	0 %	50 %	15678133
111	NC_000916	GT	3	6	67599	67604	0 %	50 %	50 %	0 %	15678133
112	NC_000916	TA	3	6	68706	68711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000916	TA	3	6	69611	69616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000916	AT	3	6	70195	70200	50 %	50 %	0 %	0 %	15678138
115	NC_000916	TC	3	6	70325	70330	0 %	50 %	0 %	50 %	15678138
116	NC_000916	CA	3	6	70944	70949	50 %	0 %	0 %	50 %	15678139
117	NC_000916	AG	3	6	71051	71056	50 %	0 %	50 %	0 %	15678139
118	NC_000916	GT	3	6	71250	71255	0 %	50 %	50 %	0 %	15678140
119	NC_000916	TC	3	6	71480	71485	0 %	50 %	0 %	50 %	15678140
120	NC_000916	TG	3	6	71490	71495	0 %	50 %	50 %	0 %	15678140
121	NC_000916	TA	3	6	72072	72077	50 %	50 %	0 %	0 %	15678142
122	NC_000916	CA	3	6	72110	72115	50 %	0 %	0 %	50 %	15678142
123	NC_000916	AT	3	6	73174	73179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000916	TA	3	6	73271	73276	50 %	50 %	0 %	0 %	15678143
125	NC_000916	AG	3	6	73967	73972	50 %	0 %	50 %	0 %	15678144
126	NC_000916	AC	3	6	74065	74070	50 %	0 %	0 %	50 %	15678144
127	NC_000916	TA	3	6	75684	75689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000916	TA	3	6	75987	75992	50 %	50 %	0 %	0 %	15678147
129	NC_000916	TC	3	6	77401	77406	0 %	50 %	0 %	50 %	15678148
130	NC_000916	CA	3	6	77424	77429	50 %	0 %	0 %	50 %	15678148
131	NC_000916	CT	3	6	77470	77475	0 %	50 %	0 %	50 %	15678148
132	NC_000916	CT	3	6	78228	78233	0 %	50 %	0 %	50 %	15678150
133	NC_000916	AG	3	6	78391	78396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000916	GA	3	6	78522	78527	50 %	0 %	50 %	0 %	15678151
135	NC_000916	GC	3	6	79056	79061	0 %	0 %	50 %	50 %	15678151
136	NC_000916	TC	3	6	79089	79094	0 %	50 %	0 %	50 %	15678151
137	NC_000916	CT	3	6	79981	79986	0 %	50 %	0 %	50 %	15678152
138	NC_000916	TA	3	6	80128	80133	50 %	50 %	0 %	0 %	15678152
139	NC_000916	AT	3	6	81955	81960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000916	TC	3	6	82699	82704	0 %	50 %	0 %	50 %	15678155
141	NC_000916	AT	3	6	84322	84327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000916	TA	3	6	84395	84400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000916	TC	3	6	84608	84613	0 %	50 %	0 %	50 %	15678158
144	NC_000916	AG	3	6	85310	85315	50 %	0 %	50 %	0 %	15678159
145	NC_000916	AG	3	6	86454	86459	50 %	0 %	50 %	0 %	15678161
146	NC_000916	GA	3	6	87017	87022	50 %	0 %	50 %	0 %	15678161
147	NC_000916	AT	3	6	89052	89057	50 %	50 %	0 %	0 %	15678165
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