MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_000916	AT	3	6	95075	95080	50 %	50 %	0 %	0 %	15678171
2003	NC_000916	TGC	2	6	95088	95093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678171
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2005	NC_000916	G	6	6	95198	95203	0 %	0 %	100 %	0 %	15678171
2006	NC_000916	ATG	2	6	95204	95209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678171
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2129	NC_000916	TGA	2	6	100865	100870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678179
2130	NC_000916	CTC	2	6	100992	100997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678179
2131	NC_000916	ATA	2	6	101064	101069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678179
2132	NC_000916	TCC	2	6	101095	101100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678179
2133	NC_000916	GAT	2	6	101105	101110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678179
2134	NC_000916	TGA	2	6	101129	101134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678179
2135	NC_000916	CATG	2	8	101174	101181	25 %	25 %	25 %	25 %	15678179
2136	NC_000916	TGT	2	6	101306	101311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678179
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2142	NC_000916	CAT	2	6	101714	101719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678179
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2144	NC_000916	GATG	2	8	101795	101802	25 %	25 %	50 %	0 %	15678179
2145	NC_000916	TGA	2	6	101822	101827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678179
2146	NC_000916	GAG	2	6	101837	101842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678179
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2167	NC_000916	TA	3	6	102865	102870	50 %	50 %	0 %	0 %	15678182
2168	NC_000916	TA	3	6	102877	102882	50 %	50 %	0 %	0 %	15678182
2169	NC_000916	AT	3	6	102891	102896	50 %	50 %	0 %	0 %	15678182
2170	NC_000916	AT	3	6	102906	102911	50 %	50 %	0 %	0 %	15678182
2171	NC_000916	AG	3	6	102913	102918	50 %	0 %	50 %	0 %	15678182
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2175	NC_000916	ATT	2	6	103150	103155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2177	NC_000916	TAT	2	6	103179	103184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2178	NC_000916	TCT	2	6	103198	103203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2181	NC_000916	TAA	2	6	103329	103334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2182	NC_000916	CGGA	2	8	103434	103441	25 %	0 %	50 %	25 %	15678183
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2199	NC_000916	TAC	2	6	104270	104275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678185
2200	NC_000916	ATG	2	6	104285	104290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678185
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2217	NC_000916	CAAC	2	8	105203	105210	50 %	0 %	0 %	50 %	15678186
2218	NC_000916	TCC	2	6	105215	105220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678186
2219	NC_000916	GAG	3	9	105244	105252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678186
2220	NC_000916	CAG	2	6	105257	105262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678186
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2222	NC_000916	AAGGG	2	10	105418	105427	40 %	0 %	60 %	0 %	15678187
2223	NC_000916	GAC	2	6	105471	105476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678187
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2233	NC_000916	ACG	2	6	106108	106113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678188
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2238	NC_000916	CTC	2	6	106197	106202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678188
2239	NC_000916	CTT	2	6	106301	106306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678188
2240	NC_000916	GGA	2	6	106338	106343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678188
2241	NC_000916	AGGA	2	8	106404	106411	50 %	0 %	50 %	0 %	15678188
2242	NC_000916	GCA	2	6	106422	106427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678188
2243	NC_000916	GACA	2	8	106475	106482	50 %	0 %	25 %	25 %	15678188
2244	NC_000916	CAACGT	2	12	106511	106522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15678188
2245	NC_000916	CTA	2	6	106571	106576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678188
2246	NC_000916	GGAA	2	8	106636	106643	50 %	0 %	50 %	0 %	15678188
2247	NC_000916	ATC	2	6	106690	106695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2248	NC_000916	CT	3	6	106696	106701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2249	NC_000916	T	7	7	106706	106712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2250	NC_000916	TCAGA	2	10	106731	106740	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2251	NC_000916	GGC	2	6	106741	106746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_000916	T	8	8	106752	106759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_000916	ATC	2	6	106762	106767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2254	NC_000916	GGC	2	6	106786	106791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_000916	T	8	8	106797	106804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2373	NC_000916	GTT	2	6	112954	112959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678196
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