MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_000916	ATA	2	6	220235	220240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678312
4502	NC_000916	CAG	2	6	220273	220278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678312
4503	NC_000916	TGA	2	6	220309	220314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678312
4504	NC_000916	AAT	2	6	220315	220320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678312
4505	NC_000916	TC	3	6	220333	220338	0 %	50 %	0 %	50 %	15678312
4506	NC_000916	GA	3	6	220352	220357	50 %	0 %	50 %	0 %	15678312
4507	NC_000916	AG	3	6	220388	220393	50 %	0 %	50 %	0 %	15678312
4508	NC_000916	TTC	2	6	220394	220399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678312
4509	NC_000916	AAG	2	6	220414	220419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678312
4510	NC_000916	CTT	2	6	220424	220429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678312
4511	NC_000916	ATA	2	6	220448	220453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678312
4512	NC_000916	A	6	6	220469	220474	100 %	0 %	0 %	0 %	15678312
4513	NC_000916	AAAC	2	8	220501	220508	75 %	0 %	0 %	25 %	15678312
4514	NC_000916	GCAG	2	8	220544	220551	25 %	0 %	50 %	25 %	15678312
4515	NC_000916	GCT	2	6	220687	220692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678312
4516	NC_000916	AGAGG	2	10	220699	220708	40 %	0 %	60 %	0 %	15678312
4517	NC_000916	GGA	2	6	220842	220847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678313
4518	NC_000916	TTCC	2	8	220878	220885	0 %	50 %	0 %	50 %	15678313
4519	NC_000916	GA	3	6	220959	220964	50 %	0 %	50 %	0 %	15678313
4520	NC_000916	CAG	2	6	220980	220985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678313
4521	NC_000916	TAA	2	6	221006	221011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678313
4522	NC_000916	TCA	2	6	221068	221073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4523	NC_000916	TCA	2	6	221132	221137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4524	NC_000916	CCT	2	6	221211	221216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678313
4525	NC_000916	ATC	2	6	221292	221297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4526	NC_000916	TCC	2	6	221324	221329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678313
4527	NC_000916	CAT	2	6	221342	221347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4528	NC_000916	GCA	2	6	221371	221376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678313
4529	NC_000916	AG	3	6	221433	221438	50 %	0 %	50 %	0 %	15678313
4530	NC_000916	AGG	2	6	221450	221455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678313
4531	NC_000916	TGA	2	6	221493	221498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678313
4532	NC_000916	CAT	2	6	221508	221513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4533	NC_000916	GCAG	2	8	221623	221630	25 %	0 %	50 %	25 %	15678313
4534	NC_000916	GGA	2	6	221691	221696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678313
4535	NC_000916	ATA	2	6	221704	221709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678313
4536	NC_000916	GAT	2	6	221740	221745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678313
4537	NC_000916	TGA	3	9	221790	221798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678313
4538	NC_000916	ATT	2	6	221808	221813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678313
4539	NC_000916	GAT	2	6	221921	221926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_000916	G	6	6	221958	221963	0 %	0 %	100 %	0 %	15678314
4541	NC_000916	TCA	2	6	222023	222028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678314
4542	NC_000916	CTT	2	6	222115	222120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678314
4543	NC_000916	TTC	2	6	222194	222199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678314
4544	NC_000916	CTGG	2	8	222201	222208	0 %	25 %	50 %	25 %	15678314
4545	NC_000916	GAGG	2	8	222231	222238	25 %	0 %	75 %	0 %	15678314
4546	NC_000916	TCT	2	6	222297	222302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678314
4547	NC_000916	AGA	2	6	222321	222326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678314
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4549	NC_000916	GAT	2	6	222386	222391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678314
4550	NC_000916	GGT	2	6	222392	222397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_000916	GT	3	6	222396	222401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_000916	ATT	2	6	222429	222434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678315
4553	NC_000916	GAT	2	6	222442	222447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678315
4554	NC_000916	AGG	2	6	222471	222476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678315
4555	NC_000916	TAT	2	6	222507	222512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678315
4556	NC_000916	GAA	2	6	222566	222571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678315
4557	NC_000916	ATG	2	6	222635	222640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678315
4558	NC_000916	GGC	2	6	222646	222651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678315
4559	NC_000916	GGGC	2	8	222852	222859	0 %	0 %	75 %	25 %	15678315
4560	NC_000916	GGA	2	6	223083	223088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678315
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4562	NC_000916	CTG	2	6	223174	223179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678316
4563	NC_000916	AGG	2	6	223191	223196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678316
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4565	NC_000916	GGA	2	6	223332	223337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678316
4566	NC_000916	TGA	2	6	223357	223362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678316
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4568	NC_000916	TCCA	2	8	223474	223481	25 %	25 %	0 %	50 %	15678316
4569	NC_000916	CGG	2	6	223512	223517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678316
4570	NC_000916	TTCT	2	8	223586	223593	0 %	75 %	0 %	25 %	15678316
4571	NC_000916	AT	3	6	223668	223673	50 %	50 %	0 %	0 %	15678316
4572	NC_000916	G	6	6	223680	223685	0 %	0 %	100 %	0 %	15678316
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4574	NC_000916	TGG	2	6	223811	223816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678316
4575	NC_000916	ATGA	2	8	223817	223824	50 %	25 %	25 %	0 %	15678316
4576	NC_000916	GGA	2	6	223901	223906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678316
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4578	NC_000916	CCAGT	2	10	223971	223980	20 %	20 %	20 %	40 %	15678316
4579	NC_000916	TCA	2	6	224028	224033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678316
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4582	NC_000916	GAA	2	6	224168	224173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678317
4583	NC_000916	CA	3	6	224198	224203	50 %	0 %	0 %	50 %	15678317
4584	NC_000916	TCT	2	6	224205	224210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678317
4585	NC_000916	GA	3	6	224252	224257	50 %	0 %	50 %	0 %	15678317
4586	NC_000916	AGAT	2	8	224274	224281	50 %	25 %	25 %	0 %	15678317
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4588	NC_000916	AGAT	2	8	224316	224323	50 %	25 %	25 %	0 %	15678317
4589	NC_000916	GAG	2	6	224366	224371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4590	NC_000916	GGGAG	2	10	224384	224393	20 %	0 %	80 %	0 %	15678317
4591	NC_000916	GAT	2	6	224437	224442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
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4593	NC_000916	C	6	6	224593	224598	0 %	0 %	0 %	100 %	15678317
4594	NC_000916	CAT	2	6	224628	224633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678317
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4596	NC_000916	TCT	2	6	224727	224732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678317
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4599	NC_000916	GA	3	6	224933	224938	50 %	0 %	50 %	0 %	15678317
4600	NC_000916	TGA	2	6	224953	224958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
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4603	NC_000916	GAG	2	6	225038	225043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4604	NC_000916	CAT	2	6	225192	225197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678317
4605	NC_000916	GAG	2	6	225251	225256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4606	NC_000916	AG	3	6	225283	225288	50 %	0 %	50 %	0 %	15678317
4607	NC_000916	TGA	2	6	225300	225305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
4608	NC_000916	GAA	2	6	225365	225370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678317
4609	NC_000916	CGC	2	6	225371	225376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678317
4610	NC_000916	AT	3	6	225378	225383	50 %	50 %	0 %	0 %	15678317
4611	NC_000916	TGA	2	6	225411	225416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
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4613	NC_000916	GAGG	2	8	225478	225485	25 %	0 %	75 %	0 %	15678317
4614	NC_000916	GAT	2	6	225542	225547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
4615	NC_000916	CAT	2	6	225565	225570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678317
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4618	NC_000916	CCAT	2	8	225680	225687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_000916	TGT	2	6	225791	225796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678318
4620	NC_000916	GAC	2	6	226050	226055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678318
4621	NC_000916	CCA	2	6	226148	226153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678318
4622	NC_000916	CAT	2	6	226177	226182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678318
4623	NC_000916	TTA	2	6	226208	226213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_000916	TCAA	2	8	226216	226223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_000916	A	6	6	226238	226243	100 %	0 %	0 %	0 %	15678319
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4753	NC_000916	AG	3	6	231873	231878	50 %	0 %	50 %	0 %	15678324
4754	NC_000916	ATA	2	6	231891	231896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678324
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4768	NC_000916	GA	3	6	232362	232367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4834	NC_000916	T	7	7	236487	236493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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