MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD

Total Repeats: 8226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022568	TTC	2	6	2806748	2806753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_022568	ATTT	2	8	2806760	2806767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_022568	TCC	2	6	2808407	2808412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_022568	T	6	6	2808454	2808459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_022568	ACA	2	6	2808463	2808468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_022568	A	6	6	2808468	2808473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_022568	TC	3	6	2808554	2808559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8008	NC_022568	T	6	6	2808561	2808566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_022568	T	6	6	2808579	2808584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_022568	A	6	6	2808618	2808623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_022568	TGC	2	6	2808723	2808728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_022568	TAA	2	6	2808861	2808866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_022568	GCAA	2	8	2808868	2808875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8014	NC_022568	TC	4	8	2810381	2810388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_022568	GGGA	2	8	2810404	2810411	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_022568	A	6	6	2813306	2813311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_022568	TCC	2	6	2814848	2814853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_022568	TAT	2	6	2814872	2814877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_022568	CTA	2	6	2814889	2814894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_022568	A	6	6	2814896	2814901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_022568	TCCC	2	8	2816050	2816057	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8022	NC_022568	TA	3	6	2816974	2816979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_022568	T	6	6	2816992	2816997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_022568	TAG	2	6	2819471	2819476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_022568	TCC	2	6	2822790	2822795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_022568	ATA	2	6	2822801	2822806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_022568	TGAA	2	8	2822815	2822822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_022568	A	6	6	2822831	2822836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_022568	ATC	2	6	2822844	2822849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_022568	CAC	2	6	2823727	2823732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_022568	CA	3	6	2823763	2823768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8032	NC_022568	A	6	6	2823777	2823782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_022568	ACC	2	6	2823834	2823839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_022568	ATT	2	6	2823897	2823902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_022568	TAAAA	2	10	2823940	2823949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_022568	CAC	2	6	2824033	2824038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_022568	CGC	2	6	2824094	2824099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_022568	T	7	7	2824137	2824143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_022568	TGT	3	9	2824146	2824154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8041	NC_022568	T	6	6	2824170	2824175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_022568	TCC	2	6	2824189	2824194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_022568	AAAT	2	8	2824226	2824233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_022568	AT	3	6	2824242	2824247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_022568	A	6	6	2824310	2824315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_022568	A	7	7	2824433	2824439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_022568	TTAACT	2	12	2824513	2824524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8048	NC_022568	ATTT	2	8	2824527	2824534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_022568	CCA	2	6	2824594	2824599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_022568	AT	3	6	2824619	2824624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_022568	A	6	6	2824644	2824649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_022568	CCA	2	6	2824721	2824726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_022568	T	7	7	2824744	2824750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_022568	ATAA	2	8	2824756	2824763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_022568	ATT	2	6	2824764	2824769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_022568	T	6	6	2824778	2824783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_022568	A	6	6	2825976	2825981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_022568	TTTA	2	8	2826015	2826022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_022568	TCA	2	6	2826027	2826032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8061	NC_022568	TA	3	6	2826056	2826061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_022568	A	6	6	2826094	2826099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_022568	TAA	2	6	2826657	2826662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_022568	ATT	2	6	2826683	2826688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_022568	AATT	2	8	2826717	2826724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_022568	TA	4	8	2826750	2826757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_022568	A	9	9	2826863	2826871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_022568	AC	3	6	2826882	2826887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_022568	TA	4	8	2828023	2828030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_022568	T	6	6	2828078	2828083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_022568	TAT	2	6	2828094	2828099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_022568	CAAA	2	8	2828110	2828117	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8073	NC_022568	CCAC	2	8	2828121	2828128	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8074	NC_022568	A	6	6	2828130	2828135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8077	NC_022568	A	6	6	2831091	2831096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_022568	TCC	2	6	2831098	2831103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_022568	T	6	6	2832402	2832407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_022568	CCT	2	6	2832411	2832416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8081	NC_022568	CTTT	2	8	2832440	2832447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8082	NC_022568	TAAA	2	8	2832452	2832459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_022568	A	7	7	2832499	2832505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_022568	TC	3	6	2832520	2832525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8085	NC_022568	A	6	6	2832527	2832532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_022568	CTC	2	6	2834477	2834482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_022568	AATT	2	8	2834488	2834495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_022568	TAG	2	6	2834554	2834559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_022568	A	6	6	2834640	2834645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_022568	TA	3	6	2836148	2836153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_022568	TAA	2	6	2836186	2836191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_022568	TTA	2	6	2836192	2836197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8094	NC_022568	GA	3	6	2836272	2836277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_022568	A	6	6	2839230	2839235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_022568	TCC	2	6	2839261	2839266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_022568	CTC	2	6	2840144	2840149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_022568	A	7	7	2840210	2840216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_022568	TTA	2	6	2840246	2840251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_022568	A	6	6	2840265	2840270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_022568	TCT	2	6	2842173	2842178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_022568	AAAT	2	8	2842219	2842226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_022568	TAAAA	2	10	2842304	2842313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_022568	A	7	7	2842310	2842316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_022568	CAAC	2	8	2842318	2842325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_022568	T	6	6	2843143	2843148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_022568	AAATC	2	10	2843190	2843199	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8109	NC_022568	T	6	6	2843222	2843227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_022568	A	6	6	2843234	2843239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_022568	TCCT	2	8	2844437	2844444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_022568	AT	3	6	2844470	2844475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_022568	A	6	6	2844557	2844562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_022568	TAGA	2	8	2844563	2844570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_022568	GCT	2	6	2844571	2844576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_022568	CTAT	2	8	2844591	2844598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_022568	TTC	2	6	2846299	2846304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_022568	TCC	2	6	2847444	2847449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_022568	AAG	2	6	2847481	2847486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_022568	TG	3	6	2848927	2848932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_022568	CTC	3	9	2850663	2850671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_022568	AAATGA	2	12	2850748	2850759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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8124	NC_022568	GTT	3	9	2850810	2850818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_022568	T	6	6	2850850	2850855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_022568	T	6	6	2851577	2851582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_022568	ATT	2	6	2851676	2851681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_022568	AAGTAT	2	12	2851685	2851696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_022568	TATC	2	8	2851985	2851992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8130	NC_022568	TGT	2	6	2854038	2854043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_022568	CTTT	2	8	2854091	2854098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8132	NC_022568	T	8	8	2854096	2854103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_022568	GTTT	2	8	2854116	2854123	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_022568	TTAG	2	8	2854130	2854137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_022568	TAT	2	6	2854520	2854525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8137	NC_022568	CTTT	2	8	2854606	2854613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.