MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. cynodontis DSM 46306

Total Repeats: 13476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022438	CTC	2	6	579354	579359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_022438	GCC	2	6	579361	579366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_022438	CCG	2	6	579389	579394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_022438	CCG	2	6	581392	581397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_022438	GCC	2	6	581442	581447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_022438	AG	3	6	581493	581498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_022438	CGC	2	6	581512	581517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_022438	CCG	2	6	581613	581618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_022438	AG	3	6	582525	582530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_022438	CGGC	2	8	582534	582541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_022438	TGC	2	6	583546	583551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_022438	ATCGG	2	10	583552	583561	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3013	NC_022438	CTC	2	6	583564	583569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_022438	AGG	2	6	583594	583599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_022438	TTC	2	6	583600	583605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_022438	GAA	2	6	583670	583675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_022438	GCT	2	6	585188	585193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_022438	GCCC	2	8	585229	585236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3019	NC_022438	CGGC	2	8	585288	585295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_022438	TCG	2	6	585318	585323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_022438	CGA	2	6	585356	585361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_022438	CGAA	2	8	585370	585377	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_022438	CG	3	6	585392	585397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_022438	T	6	6	585430	585435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_022438	CGC	2	6	586747	586752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_022438	CTT	2	6	586766	586771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_022438	GAA	2	6	586796	586801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_022438	CG	3	6	587722	587727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_022438	CGG	2	6	587764	587769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_022438	GGC	2	6	587817	587822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_022438	CTT	2	6	587829	587834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_022438	CTC	2	6	587854	587859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_022438	GCG	2	6	587876	587881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_022438	CGA	2	6	588055	588060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_022438	CGC	2	6	588082	588087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_022438	ATG	2	6	588176	588181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_022438	GCG	2	6	588248	588253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_022438	CGC	2	6	588265	588270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_022438	GC	3	6	588269	588274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_022438	CGG	2	6	588331	588336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_022438	CGG	2	6	588366	588371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_022438	CAG	2	6	588373	588378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_022438	CGA	2	6	588390	588395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_022438	GCA	2	6	588459	588464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_022438	TCC	2	6	588571	588576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_022438	CGG	2	6	588653	588658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_022438	CGA	2	6	588659	588664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_022438	CGG	2	6	588671	588676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_022438	GGT	2	6	588757	588762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_022438	AGT	2	6	588766	588771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_022438	GGT	2	6	588781	588786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_022438	TGT	2	6	588787	588792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_022438	TGT	2	6	588856	588861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_022438	GCC	2	6	588893	588898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_022438	GGGC	2	8	588909	588916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_022438	TGC	2	6	588967	588972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_022438	CCCG	2	8	588997	589004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3058	NC_022438	TTG	2	6	589030	589035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_022438	GCG	2	6	589036	589041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_022438	ACCGC	2	10	589560	589569	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3061	NC_022438	TCG	2	6	589587	589592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_022438	ACT	2	6	589638	589643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_022438	TG	3	6	589670	589675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_022438	GGTG	2	8	589682	589689	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_022438	GGC	2	6	589692	589697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_022438	GGC	2	6	589710	589715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_022438	CCT	2	6	590471	590476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_022438	GC	4	8	590510	590517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_022438	CGGC	2	8	590611	590618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_022438	GCC	2	6	590636	590641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_022438	GCC	2	6	590645	590650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_022438	GC	3	6	590671	590676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_022438	GTC	2	6	590732	590737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_022438	CAG	2	6	590762	590767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_022438	GCC	2	6	590768	590773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_022438	GC	3	6	590800	590805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_022438	GAC	2	6	590837	590842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_022438	CGG	2	6	590853	590858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_022438	TCG	2	6	590868	590873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_022438	AGC	2	6	590874	590879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_022438	CGG	2	6	590899	590904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_022438	GC	3	6	590935	590940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_022438	CG	3	6	590960	590965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_022438	CCG	2	6	590979	590984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_022438	TGGGCG	2	12	590991	591002	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3086	NC_022438	G	6	6	591052	591057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_022438	AGCG	2	8	591073	591080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_022438	ATG	2	6	591136	591141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_022438	GC	3	6	591149	591154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_022438	GC	3	6	591172	591177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_022438	GC	3	6	591194	591199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_022438	GCC	2	6	591215	591220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_022438	CGT	2	6	591224	591229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_022438	CGA	2	6	591264	591269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_022438	GA	3	6	591271	591276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_022438	TCGAG	2	10	591296	591305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3097	NC_022438	CAG	2	6	591306	591311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_022438	GGTCGA	2	12	591412	591423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3099	NC_022438	CGA	2	6	591427	591432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_022438	TCG	2	6	591435	591440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_022438	GCG	2	6	591500	591505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_022438	GTC	2	6	591625	591630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_022438	CTTT	2	8	592854	592861	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_022438	CCG	2	6	593719	593724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_022438	AGC	2	6	593737	593742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_022438	GGCGT	2	10	593743	593752	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_022438	GAG	2	6	593775	593780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_022438	TCC	2	6	593806	593811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_022438	TCC	2	6	593847	593852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_022438	GGA	2	6	593875	593880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_022438	GAG	2	6	593917	593922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_022438	GAG	2	6	593988	593993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_022438	GCA	2	6	594005	594010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_022438	TCG	2	6	597817	597822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_022438	GTC	2	6	597874	597879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_022438	GCT	2	6	599127	599132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_022438	CGG	2	6	599133	599138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_022438	GCC	2	6	599171	599176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_022438	GCC	2	6	599217	599222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_022438	CG	3	6	599226	599231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_022438	CAG	2	6	599269	599274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_022438	AGG	2	6	599279	599284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_022438	GT	3	6	600282	600287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_022438	TTG	2	6	600294	600299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_022438	CGT	2	6	600313	600318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_022438	GACG	2	8	600360	600367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_022438	ATT	2	6	600385	600390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_022438	CCGCG	2	10	600770	600779	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3129	NC_022438	C	6	6	600806	600811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3130	NC_022438	TGC	2	6	605480	605485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_022438	GTTG	2	8	605494	605501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_022438	AGG	2	6	605578	605583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_022438	TGC	2	6	605603	605608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_022438	CTC	2	6	605614	605619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_022438	GTC	2	6	605646	605651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_022438	GAC	2	6	605652	605657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_022438	TGC	2	6	605669	605674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_022438	GGC	2	6	605675	605680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3139	NC_022438	TCG	2	6	605723	605728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_022438	CAGCT	2	10	606610	606619	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3141	NC_022438	TCG	3	9	606682	606690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_022438	CGC	2	6	606695	606700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3143	NC_022438	CCG	2	6	606709	606714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3144	NC_022438	CAT	2	6	606767	606772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3148	NC_022438	G	7	7	607603	607609	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_022438	TCG	2	6	607957	607962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3150	NC_022438	TTC	2	6	607974	607979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3151	NC_022438	CTG	2	6	607986	607991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_022438	GCC	2	6	609810	609815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3155	NC_022438	GCC	2	6	612244	612249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3156	NC_022438	GC	4	8	614853	614860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3157	NC_022438	TTG	2	6	614900	614905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_022438	ACA	2	6	614914	614919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3161	NC_022438	CGG	2	6	619190	619195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3162	NC_022438	GT	3	6	619199	619204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_022438	CGG	2	6	620990	620995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3164	NC_022438	GCC	2	6	621493	621498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3165	NC_022438	CTC	2	6	622875	622880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3168	NC_022438	TAG	2	6	624079	624084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3170	NC_022438	TGCG	2	8	624180	624187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3171	NC_022438	CGCA	2	8	624188	624195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3174	NC_022438	CGT	2	6	625193	625198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3253	NC_022438	TCG	2	6	641370	641375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3255	NC_022438	TCC	2	6	641447	641452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3262	NC_022438	GTC	2	6	650281	650286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3264	NC_022438	C	6	6	650354	650359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3265	NC_022438	CCGG	2	8	650372	650379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3266	NC_022438	CA	3	6	650397	650402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3402	NC_022438	GGT	2	6	677144	677149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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