MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris KW2

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022369	TAATAT	2	12	33673	33684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022369	TGAAAA	2	12	35030	35041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022369	TAAAAT	2	12	41425	41436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022369	TAAAAA	2	12	70214	70225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022369	AATAGC	2	12	103272	103283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022369	TAAAAA	2	12	126751	126762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022369	TTATTT	2	12	161440	161451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022369	TATAAA	2	12	165675	165686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022369	TGATTT	2	12	177896	177907	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022369	TAAAAA	2	12	207508	207519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022369	ATAAAA	2	12	211701	211712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022369	ATTCTA	2	12	253286	253297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022369	TTTAAA	2	12	285294	285305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022369	TTGTTT	2	12	311671	311682	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022369	ATTTTT	2	12	329747	329758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022369	TAAAAT	2	12	374311	374322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022369	TAAAAA	2	12	392256	392267	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022369	ATGAAA	2	12	416841	416852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022369	TTTTTA	2	12	421677	421688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022369	TTTTAA	2	12	427319	427330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022369	ACACCG	2	12	427412	427423	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022369	AAATTT	2	12	445212	445223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022369	TGTTTT	2	12	449485	449496	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022369	AAAATA	2	12	460836	460847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022369	TTATTT	2	12	461182	461193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022369	TGGAAG	2	12	504787	504798	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022369	TATAAT	2	12	534808	534819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022369	GGTTAA	2	12	571983	571994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022369	TGTTAA	2	12	582173	582184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022369	TAATTT	2	12	606363	606374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022369	ATTAAG	2	12	664425	664436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022369	AAAAAT	2	12	667406	667417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022369	AATAAA	2	12	700638	700649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022369	GTTTTT	2	12	707961	707972	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022369	TTATTT	2	12	731062	731073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022369	TTTTTA	2	12	787016	787027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022369	TCAAAA	2	12	790973	790984	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022369	AATTCA	2	12	827396	827407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022369	AAAATA	2	12	836723	836734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022369	AATCAA	2	12	858633	858644	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022369	AATTTA	2	12	864899	864910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022369	AAGCTT	2	12	866081	866092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022369	TATAAA	2	12	890055	890066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022369	ATAACC	2	12	896280	896291	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022369	TTTCTT	2	12	897375	897386	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022369	TAAATA	2	12	917399	917410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022369	TATAAG	2	12	991321	991332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022369	TTAAAA	2	12	1035610	1035621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022369	CTTTTC	2	12	1040098	1040109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022369	TTTTCC	2	12	1091918	1091929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022369	ATAAAA	2	12	1098785	1098796	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022369	TCTTTT	2	12	1098819	1098830	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022369	CTTTTT	2	12	1156148	1156159	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022369	ATTAGT	2	12	1166222	1166233	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022369	GAATAA	2	12	1168129	1168140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022369	TTAGAA	2	12	1168404	1168415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022369	ATTAAA	2	12	1189685	1189696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022369	TAAATA	2	12	1222341	1222352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022369	TAAAAA	2	12	1232018	1232029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022369	ATTTCT	2	12	1257556	1257567	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022369	TATTTT	2	12	1259550	1259561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022369	AATATT	2	12	1359390	1359401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022369	ATTTTT	2	12	1367375	1367386	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022369	ATTTTA	2	12	1377474	1377485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022369	TAAAAA	2	12	1390777	1390788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022369	CTTTTT	2	12	1400484	1400495	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022369	AAAATA	2	12	1451151	1451162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022369	TTTTTA	2	12	1456924	1456935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022369	ATTTAT	2	12	1458150	1458161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022369	CCTTCT	2	12	1463053	1463064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022369	TTCAAT	2	12	1482525	1482536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022369	TTTTAT	2	12	1538681	1538692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022369	ATATTA	2	12	1543597	1543608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022369	TAGAAA	2	12	1548831	1548842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022369	TATTTT	2	12	1605227	1605238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022369	ATTTAT	2	12	1608640	1608651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022369	TATATT	2	12	1615310	1615321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022369	ATCAAA	2	12	1625759	1625770	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022369	TTTACA	2	12	1626998	1627009	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022369	TAAAAA	2	12	1638714	1638725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022369	ATTTTT	2	12	1642322	1642333	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022369	TTTTTA	2	12	1658373	1658384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022369	TCTTTT	2	12	1673069	1673080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022369	TGTCAG	2	12	1683797	1683808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022369	CATTTT	2	12	1739963	1739974	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022369	TTTCGT	2	12	1752448	1752459	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022369	TAACAA	2	12	1758204	1758215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022369	TTTTGT	2	12	1844339	1844350	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022369	ATTTAT	2	12	1851192	1851203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022369	TTTCCG	2	12	1878311	1878322	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022369	TATTTG	2	12	1878385	1878396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022369	TTTTAT	2	12	1889944	1889955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022369	TTTTGC	2	12	1901895	1901906	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022369	TAAAAT	2	12	1917720	1917731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022369	TTTTTA	2	12	1924418	1924429	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022369	TTTCAT	2	12	1953451	1953462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022369	TATAAA	2	12	1957371	1957382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022369	TAAAAG	2	12	1969849	1969860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022369	TAAAAT	2	12	1976556	1976567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022369	AAAAGA	2	12	1989545	1989556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022369	TTGATT	2	12	2015951	2015962	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022369	TATCCT	2	12	2019216	2019227	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022369	TTTACA	2	12	2051165	2051176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022369	CTTCCA	2	12	2053432	2053443	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022369	AAAACA	2	12	2090451	2090462	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022369	ATAAAA	2	12	2094611	2094622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022369	TGGGAG	2	12	2101103	2101114	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022369	ACTTCC	2	12	2104044	2104055	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022369	TAAAAG	2	12	2125857	2125868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022369	TTTTTA	2	12	2133916	2133927	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022369	ACAATT	2	12	2144335	2144346	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022369	TTTTTA	2	12	2144468	2144479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022369	AAAAAT	2	12	2149893	2149904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022369	ATATTT	2	12	2204609	2204620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022369	TTCTTT	2	12	2210523	2210534	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_022369	TTTTTA	2	12	2213772	2213783	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022369	TTTCAT	2	12	2213817	2213828	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022369	TGATTT	2	12	2214525	2214536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022369	TAAATT	2	12	2236379	2236390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022369	TAAAAA	2	12	2269181	2269192	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022369	CTTCCA	2	12	2271328	2271339	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022369	ACCTAT	2	12	2287029	2287040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022369	TAAATA	2	12	2293106	2293117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022369	CTTCCA	2	12	2317034	2317045	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022369	ATGTTT	2	12	2361200	2361211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022369	GAAAAA	2	12	2373046	2373057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022369	CCCGAA	2	12	2397633	2397644	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022369	CTTCCA	2	12	2398052	2398063	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022369	CTTCCA	2	12	2421541	2421552	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.