MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listonella anguillarum M3 chromosome 2

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022224	CAGTA	2	10	596	605	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022224	TTATT	2	10	2232	2241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022224	GCTAA	2	10	25084	25093	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022224	CTAGA	2	10	30572	30581	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022224	TGAGA	2	10	46405	46414	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022224	GATAA	2	10	84648	84657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022224	CTTTC	2	10	85830	85839	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_022224	TGAAT	2	10	93702	93711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022224	ATGGC	2	10	94858	94867	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022224	AGAAA	2	10	107585	107594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022224	CTTAC	2	10	115398	115407	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_022224	GCGAT	2	10	116346	116355	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022224	CACCC	2	10	188102	188111	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_022224	TTGTT	2	10	200118	200127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022224	TATCC	2	10	226462	226471	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_022224	TAGCT	2	10	232807	232816	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022224	GGAAA	2	10	232856	232865	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022224	ACATT	2	10	233739	233748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022224	AAGCC	2	10	241682	241691	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022224	TTTTA	2	10	241751	241760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022224	CTTTT	2	10	249331	249340	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022224	CTCTT	2	10	254672	254681	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_022224	AGAGA	10	50	256239	256288	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022224	TAAAT	2	10	262654	262663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022224	TTTCG	2	10	265022	265031	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_022224	CATTT	2	10	278706	278715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022224	TACTC	2	10	287492	287501	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_022224	GCATT	2	10	287648	287657	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022224	TGACG	2	10	302642	302651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022224	CTAGG	2	10	302746	302755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022224	GCACC	2	10	306781	306790	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_022224	AATAA	2	10	312236	312245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022224	GAAAG	2	10	318049	318058	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022224	AAATG	2	10	340438	340447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022224	ATTCA	2	10	345034	345043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022224	CCAAA	2	10	345216	345225	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_022224	ATTTT	2	10	383016	383025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022224	AACAA	2	10	388833	388842	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022224	CTAAA	2	10	390475	390484	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022224	GAATT	2	10	410158	410167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022224	GGGTG	2	10	415186	415195	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022224	GTGAT	2	10	418145	418154	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022224	TATCC	2	10	432196	432205	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_022224	GAAAT	2	10	444836	444845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022224	TTTCA	2	10	444849	444858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022224	AACCT	2	10	454521	454530	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_022224	CCTAA	2	10	474411	474420	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_022224	ATCAC	2	10	479502	479511	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_022224	AAAGT	2	10	483047	483056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022224	TGAAA	2	10	483115	483124	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022224	AGCTA	2	10	483237	483246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022224	ATAAC	2	10	483298	483307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022224	GCCAT	2	10	505201	505210	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_022224	TATCC	2	10	530160	530169	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_022224	CAGGG	2	10	534436	534445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022224	AAATA	2	10	534925	534934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022224	AGGAT	2	10	538738	538747	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022224	CAAAT	2	10	539725	539734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022224	CCAAG	2	10	542523	542532	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_022224	GTTTT	2	10	551658	551667	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022224	AGGAT	2	10	555699	555708	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022224	TTTTC	2	10	557683	557692	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022224	ACCTC	2	10	563771	563780	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_022224	TTTAT	2	10	569544	569553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022224	GCATT	2	10	571459	571468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022224	GCACT	2	10	631541	631550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_022224	GTTTT	2	10	639299	639308	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022224	TGCTT	2	10	645381	645390	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022224	ATTTT	2	10	656983	656992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022224	ACAAG	2	10	657074	657083	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022224	AGAGA	2	10	673688	673697	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022224	CCATA	2	10	675955	675964	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_022224	CAAAA	2	10	682475	682484	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022224	TGAAA	2	10	686877	686886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022224	TTTAT	2	10	710347	710356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022224	GTCAT	3	15	718930	718944	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022224	AAGTT	2	10	719854	719863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022224	TTTTA	2	10	723199	723208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022224	TCATC	2	10	723986	723995	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_022224	AACCA	2	10	724736	724745	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_022224	TCCAT	2	10	725610	725619	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_022224	GCAGA	2	10	728058	728067	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022224	AACGC	2	10	728525	728534	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_022224	ACTAA	2	10	741770	741779	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022224	TAACG	2	10	752769	752778	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022224	AGAGA	2	10	777843	777852	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022224	AATCG	2	10	791719	791728	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022224	TAAAA	2	10	797542	797551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022224	GCTTT	2	10	803935	803944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022224	CTTTT	2	10	804134	804143	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022224	ACTGA	2	10	811458	811467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022224	GATAC	2	10	832184	832193	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022224	CAAGA	2	10	838341	838350	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022224	AGAGT	2	10	839465	839474	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022224	TTCAA	2	10	842583	842592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022224	TTTAA	2	10	851755	851764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022224	CCTTA	2	10	873732	873741	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_022224	CATTA	2	10	886482	886491	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022224	TGCGA	2	10	886492	886501	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022224	TAAAA	2	10	896007	896016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022224	TTGTG	2	10	899287	899296	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022224	TTGAG	2	10	909401	909410	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022224	CCAAA	2	10	932880	932889	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_022224	GTTTA	2	10	933719	933728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022224	CAGTA	2	10	941119	941128	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022224	TTTGG	2	10	941623	941632	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022224	ACTGA	2	10	945114	945123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022224	GTAAA	2	10	945245	945254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022224	GTTTT	2	10	953103	953112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022224	TTTAC	2	10	955253	955262	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022224	TCAGT	2	10	955384	955393	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022224	CTTAA	2	10	955516	955525	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022224	TGCAT	2	10	960687	960696	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022224	CACAT	2	10	969126	969135	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_022224	GCGTT	2	10	973421	973430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022224	TTTGG	2	10	975351	975360	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022224	TTGAA	2	10	976481	976490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022224	TTCAA	2	10	983926	983935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022224	ATTTG	2	10	984816	984825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022224	AGCAT	2	10	987030	987039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.