MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listonella anguillarum M3 chromosome 2

Total Repeats: 473

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022224	TGTT	2	8	1507	1514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022224	TGTT	2	8	2640	2647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022224	ATCA	2	8	3037	3044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022224	ATTA	2	8	3478	3485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022224	TGAG	2	8	7118	7125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022224	TTTG	2	8	7181	7188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022224	TGAA	2	8	7205	7212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022224	ATTG	2	8	7216	7223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022224	TGTA	2	8	7938	7945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022224	TGTT	2	8	9250	9257	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022224	TTTG	2	8	10779	10786	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022224	CTTG	2	8	10965	10972	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022224	ATCA	2	8	13436	13443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022224	AGTT	2	8	13511	13518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022224	GATT	2	8	17071	17078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022224	TACA	2	8	17141	17148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022224	ACAA	2	8	17151	17158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022224	AGCA	2	8	17261	17268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022224	GACG	2	8	17871	17878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022224	GGGC	2	8	19945	19952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022224	TAAA	2	8	21271	21278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022224	GTTA	2	8	22127	22134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022224	TTAT	2	8	28797	28804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022224	CATT	2	8	28910	28917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022224	TGAG	2	8	28943	28950	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022224	CGAC	2	8	29372	29379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022224	TTCA	2	8	30583	30590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022224	TTAA	2	8	30958	30965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022224	CAAA	2	8	38808	38815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022224	TCCT	2	8	39613	39620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022224	TAGA	2	8	39642	39649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022224	TAAA	2	8	41709	41716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022224	ATTC	2	8	54120	54127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022224	TCAG	2	8	54161	54168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022224	TACT	2	8	55523	55530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022224	ACTT	2	8	56581	56588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022224	ATAA	2	8	56826	56833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022224	AAAT	2	8	62758	62765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022224	AAAT	2	8	62938	62945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022224	CGTT	2	8	64026	64033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022224	TTTG	2	8	64062	64069	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022224	ATTT	2	8	66776	66783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022224	ACTA	2	8	73443	73450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022224	AACA	2	8	74763	74770	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022224	TTTC	2	8	76865	76872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022224	TAAG	2	8	76923	76930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022224	GCGT	2	8	78094	78101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022224	TTTA	2	8	84561	84568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022224	TTGA	2	8	84600	84607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022224	CTGG	2	8	89426	89433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022224	AATG	2	8	90566	90573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022224	TCAA	2	8	94731	94738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022224	TCAC	2	8	95772	95779	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022224	GCTG	2	8	102853	102860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022224	TGCC	2	8	109508	109515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022224	ATGA	2	8	115673	115680	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022224	TCAG	2	8	115735	115742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022224	GAAC	2	8	116302	116309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022224	CAAA	2	8	116380	116387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022224	GCCA	2	8	116588	116595	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022224	CCAT	2	8	116862	116869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022224	GCTC	2	8	123800	123807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022224	CTTT	2	8	126515	126522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022224	ACTC	2	8	131239	131246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022224	AATG	2	8	131252	131259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022224	TTCT	3	12	131901	131912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_022224	ATAA	2	8	139226	139233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022224	CTGC	2	8	139381	139388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022224	GAAG	2	8	140385	140392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022224	AATT	2	8	140417	140424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022224	TAAT	2	8	140452	140459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022224	TTTG	2	8	147010	147017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022224	CATG	2	8	163244	163251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022224	CAAC	2	8	168921	168928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022224	TTAA	2	8	174034	174041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022224	GTCA	6	24	179888	179911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022224	GAAA	2	8	187781	187788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022224	GGCA	2	8	187905	187912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022224	TAAT	2	8	187921	187928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022224	GGGA	2	8	188129	188136	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022224	TAAT	2	8	188204	188211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022224	GCTC	2	8	188265	188272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022224	CCCA	2	8	188335	188342	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_022224	AATT	2	8	189264	189271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022224	AGTC	2	8	193221	193228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_022224	GCAA	2	8	200230	200237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022224	ATCA	2	8	200311	200318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022224	TTAT	2	8	200889	200896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022224	CATT	2	8	206007	206014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_022224	TATT	2	8	207583	207590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022224	TCAT	2	8	207591	207598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022224	AATC	2	8	208702	208709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022224	TTCA	2	8	222786	222793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022224	CTAT	2	8	222874	222881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022224	ATCA	2	8	222961	222968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022224	ATAA	2	8	223831	223838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022224	TCAT	2	8	233760	233767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022224	AATA	2	8	241797	241804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022224	AAAT	2	8	247843	247850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022224	AATA	2	8	251726	251733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022224	TTAG	2	8	251764	251771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022224	TTGT	2	8	261783	261790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022224	TAAA	2	8	262635	262642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022224	ATGA	2	8	278658	278665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022224	ATTT	2	8	278832	278839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022224	GATA	2	8	279658	279665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022224	CTTG	2	8	280209	280216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022224	GGAA	2	8	284016	284023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022224	AACA	2	8	284479	284486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022224	TGAC	2	8	284700	284707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022224	CCTT	2	8	286204	286211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022224	TATT	2	8	287507	287514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022224	TGAC	2	8	294769	294776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022224	ATTC	2	8	294780	294787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022224	TAAA	2	8	298073	298080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022224	TCAT	2	8	299508	299515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022224	CAAT	2	8	299555	299562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022224	GATT	2	8	299621	299628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022224	CATT	2	8	299729	299736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022224	TAAA	2	8	302737	302744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022224	GCTG	2	8	306597	306604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022224	TTGT	2	8	306802	306809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022224	TTGC	2	8	306842	306849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022224	TAAT	2	8	306942	306949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022224	ATTA	2	8	306972	306979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022224	TCCG	2	8	308475	308482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022224	TATT	2	8	311146	311153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022224	TTAA	2	8	311211	311218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022224	GCTC	2	8	311281	311288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022224	ATAA	2	8	311558	311565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022224	TACA	2	8	312165	312172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022224	AACT	2	8	312325	312332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022224	CTAG	2	8	312756	312763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022224	TAAA	2	8	315195	315202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022224	CAAT	2	8	323175	323182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022224	GCTT	2	8	330117	330124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022224	TTGA	2	8	330199	330206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022224	TTGT	2	8	330622	330629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022224	AGTT	2	8	330714	330721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022224	AAGT	2	8	331015	331022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022224	ATTT	2	8	332078	332085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022224	TTAT	2	8	338030	338037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022224	AAAC	2	8	338053	338060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022224	TAAT	2	8	338375	338382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022224	AAAT	2	8	342428	342435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022224	TCGA	2	8	343894	343901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_022224	TAAC	2	8	343948	343955	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_022224	CCTT	2	8	344964	344971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022224	CAGC	2	8	345165	345172	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022224	ATTA	2	8	349229	349236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022224	CATC	2	8	349280	349287	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022224	ATGG	2	8	349513	349520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022224	ATAA	2	8	350853	350860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022224	TTAT	2	8	351677	351684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022224	CACT	2	8	351847	351854	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_022224	TGTC	2	8	353740	353747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_022224	TAAA	2	8	353787	353794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022224	ATGC	2	8	357433	357440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_022224	ATGC	2	8	357452	357459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_022224	AATA	2	8	357573	357580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022224	TAAT	2	8	359036	359043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022224	ATTA	2	8	359058	359065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022224	TTAT	2	8	362572	362579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022224	GAAT	2	8	371938	371945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022224	AATT	2	8	371955	371962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022224	GTTC	2	8	374525	374532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_022224	CATT	2	8	376731	376738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_022224	CATT	2	8	378194	378201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_022224	TAAA	2	8	379917	379924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022224	ATTT	2	8	380130	380137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022224	TAAT	2	8	380201	380208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022224	CCTA	2	8	386829	386836	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_022224	TTTG	2	8	388873	388880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022224	GATT	2	8	390485	390492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022224	CTTA	2	8	399520	399527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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177	NC_022224	TTAT	2	8	403424	403431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022224	AAAC	2	8	405543	405550	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_022224	AATT	2	8	405641	405648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_022224	AAAT	2	8	409272	409279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022224	TTAT	2	8	409281	409288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_022224	GCTG	2	8	412736	412743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_022224	GAAA	2	8	415011	415018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022224	TCCC	2	8	415161	415168	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
187	NC_022224	AATT	2	8	416238	416245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_022224	CGAG	2	8	443363	443370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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196	NC_022224	ATGT	2	8	454592	454599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_022224	CTAT	2	8	483078	483085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
204	NC_022224	CTAT	2	8	485694	485701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.