MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 2

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022123	TGT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022123	TCT	2	6	3802	3807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022123	ATA	2	6	3850	3855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022123	CAA	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022123	CCA	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_022123	ATC	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022123	AGT	2	6	4078	4083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022123	TCA	2	6	4160	4165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022123	AGG	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022123	ATG	2	6	4215	4220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022123	CAA	2	6	4322	4327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022123	ACA	2	6	8174	8179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022123	CTG	2	6	9146	9151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022123	CGA	2	6	9169	9174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022123	CAT	2	6	9202	9207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022123	ATT	2	6	9373	9378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022123	GGT	2	6	9421	9426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022123	CTT	2	6	9593	9598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022123	CGG	2	6	11502	11507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022123	GCC	2	6	11516	11521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_022123	CGC	2	6	11904	11909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_022123	CCA	2	6	11955	11960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_022123	CTG	2	6	13258	13263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022123	GAG	2	6	13292	13297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022123	CTT	2	6	14105	14110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022123	ACA	2	6	14185	14190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022123	TAA	2	6	14214	14219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022123	CTG	2	6	14222	14227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022123	AAG	2	6	14307	14312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022123	CTA	2	6	14326	14331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022123	ATG	2	6	14370	14375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022123	TAA	2	6	14444	14449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022123	ATT	2	6	15899	15904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022123	TAT	2	6	16089	16094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022123	CTG	2	6	16375	16380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022123	GAG	2	6	16409	16414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022123	TTG	2	6	16742	16747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022123	GGC	2	6	16798	16803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022123	TGG	2	6	16965	16970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022123	GAC	2	6	17022	17027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022123	CAG	2	6	17151	17156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022123	GAC	2	6	17220	17225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022123	CAG	2	6	17349	17354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022123	CTT	2	6	17376	17381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022123	TGA	2	6	18050	18055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022123	AGG	2	6	19044	19049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022123	AGG	2	6	20803	20808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022123	TTA	2	6	20809	20814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022123	TCA	3	9	22633	22641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022123	TCC	2	6	22678	22683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_022123	AAT	2	6	22715	22720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022123	GTT	2	6	22854	22859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022123	TTA	2	6	22860	22865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022123	GCG	2	6	22869	22874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022123	CTG	2	6	22998	23003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022123	CGT	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022123	CCA	2	6	23184	23189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_022123	GCC	2	6	23351	23356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_022123	CAA	2	6	23407	23412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022123	ACG	2	6	23419	23424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022123	GTA	2	6	23594	23599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022123	ACG	2	6	23641	23646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022123	CTC	2	6	23740	23745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022123	CAG	2	6	23774	23779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022123	ATT	2	6	23931	23936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022123	TAA	2	6	23955	23960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022123	GGA	2	6	24002	24007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022123	TGC	2	6	24475	24480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022123	TGA	2	6	26969	26974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022123	ATC	2	6	27025	27030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022123	TAT	2	6	28073	28078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022123	CAA	2	6	31990	31995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022123	TAA	2	6	32050	32055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022123	AGA	2	6	34499	34504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022123	CAA	2	6	34506	34511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022123	GAC	2	6	39187	39192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022123	GTA	2	6	39193	39198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022123	CTC	2	6	39237	39242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022123	TTA	2	6	39349	39354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022123	GGT	2	6	39396	39401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022123	GTG	2	6	39621	39626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022123	CGT	2	6	39665	39670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022123	CCA	2	6	39697	39702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_022123	AAC	2	6	39771	39776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022123	GGT	2	6	39783	39788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022123	TGT	2	6	39792	39797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022123	CAC	2	6	41006	41011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_022123	CTT	2	6	41197	41202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022123	CTG	2	6	41431	41436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022123	CTT	2	6	42324	42329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022123	TCT	2	6	42357	42362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022123	GCT	2	6	42416	42421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022123	TTG	2	6	42454	42459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022123	TAA	2	6	42465	42470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022123	ATT	2	6	42493	42498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022123	CTT	2	6	42663	42668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022123	ATC	2	6	42699	42704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022123	TGT	2	6	42826	42831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022123	CAT	2	6	42879	42884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022123	TGT	2	6	42908	42913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022123	AGT	2	6	42920	42925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022123	GGT	2	6	43060	43065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022123	TAT	2	6	43071	43076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022123	CCT	2	6	44231	44236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022123	TCA	2	6	44293	44298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022123	AGG	3	9	44335	44343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022123	ATT	2	6	46674	46679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022123	AAG	2	6	46682	46687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022123	GAA	2	6	46693	46698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022123	ATA	2	6	46701	46706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022123	TTC	2	6	46707	46712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022123	GGC	2	6	46845	46850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022123	ACC	2	6	46862	46867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_022123	ACC	2	6	46883	46888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_022123	ACC	2	6	46905	46910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_022123	CTT	3	9	46982	46990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022123	TCG	3	9	47041	47049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022123	ATA	2	6	47136	47141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022123	CTT	2	6	47162	47167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022123	AAT	2	6	49555	49560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022123	TTC	2	6	50965	50970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022123	GGT	2	6	51043	51048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022123	GGT	2	6	51065	51070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022123	GGT	2	6	51086	51091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022123	GCC	2	6	51103	51108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_022123	AAT	2	6	51144	51149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022123	AAG	2	6	52125	52130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022123	GGT	2	6	52157	52162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022123	TTG	2	6	52248	52253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022123	GAA	2	6	52296	52301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022123	ATC	2	6	52363	52368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022123	CTG	2	6	52375	52380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022123	TCG	2	6	52418	52423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022123	GAA	2	6	52431	52436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022123	CGG	2	6	52456	52461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022123	CTT	2	6	52490	52495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022123	TCA	2	6	52550	52555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022123	CTT	2	6	52599	52604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022123	ATA	2	6	52672	52677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022123	TTC	2	6	52684	52689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022123	TGT	2	6	53656	53661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022123	CTT	2	6	53711	53716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022123	AAG	2	6	54379	54384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022123	TAA	2	6	55363	55368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022123	ATG	2	6	55449	55454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022123	GGA	2	6	55468	55473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022123	ACC	2	6	55583	55588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_022123	TAT	2	6	56586	56591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022123	ATG	2	6	56656	56661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022123	GAA	2	6	56672	56677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022123	CGC	2	6	56769	56774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_022123	TCA	2	6	56822	56827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022123	CTT	2	6	56871	56876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_022123	GGC	2	6	57013	57018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_022123	AAT	2	6	57040	57045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022123	AAG	2	6	59103	59108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022123	CGT	2	6	59205	59210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_022123	TAA	2	6	59492	59497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022123	TAA	3	9	59526	59534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022123	GGT	2	6	59680	59685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022123	GCT	2	6	59813	59818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_022123	TCC	2	6	59826	59831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_022123	CAG	2	6	59925	59930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_022123	AGG	2	6	59934	59939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022123	GGT	2	6	60062	60067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022123	CAT	2	6	60068	60073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_022123	ATT	3	9	60429	60437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022123	AAT	2	6	61699	61704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022123	TTA	2	6	61757	61762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022123	TTA	2	6	61820	61825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022123	TCA	2	6	61964	61969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_022123	CAT	2	6	61980	61985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.