MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022112	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022112	TGTTTT	2	12	29975	29986	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022112	TTCTTT	2	12	51182	51193	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022112	AATGCC	2	12	55838	55849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022112	AACTGA	2	12	66103	66114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022112	CAGTCG	2	12	74299	74310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022112	GCAACC	2	12	82300	82311	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022112	GCTCAC	2	12	87444	87455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022112	TGATCT	2	12	87733	87744	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022112	GGAGAA	2	12	88024	88035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022112	AAAAAT	2	12	89209	89220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022112	CATTCT	2	12	146361	146372	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022112	AACTTT	2	12	147538	147549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022112	TCGCAG	2	12	148716	148727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022112	GTGAGC	2	12	153817	153828	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022112	GTGATG	2	12	169329	169340	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022112	GAATAA	2	12	174973	174984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022112	TCGCAG	2	12	184688	184699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022112	TGACAA	2	12	193548	193559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022112	ATCAAA	2	12	198240	198251	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022112	TAAAAA	2	12	198492	198503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022112	GGGCAA	2	12	251418	251429	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022112	TGGAAG	2	12	279583	279594	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022112	CGCAGG	2	12	279657	279668	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022112	CTGCGA	2	12	279672	279683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022112	TAAAAA	2	12	308328	308339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022112	TTAGGT	2	12	327421	327432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022112	ACAAAA	2	12	346302	346313	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022112	GTCATT	2	12	356054	356065	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022112	TTGTAA	2	12	373132	373143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022112	AATTTA	2	12	378605	378616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022112	ATATTG	2	12	386205	386216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022112	TCTTTT	2	12	387119	387130	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022112	CACCTT	2	12	397478	397489	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022112	TCGCAG	2	12	414563	414574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022112	CTCTAT	2	12	442213	442224	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022112	TGAAGA	2	12	455681	455692	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022112	ATTTGT	2	12	459291	459302	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022112	GCGTCA	2	12	464842	464853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022112	ATTGAA	2	12	468594	468605	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022112	CGATCA	2	12	468735	468746	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022112	ACCTGA	2	12	480388	480399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022112	GAAACG	2	12	547182	547193	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022112	CAAGGC	2	12	547921	547932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022112	TGCGAC	2	12	577896	577907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022112	AACAAA	2	12	584854	584865	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022112	ATATGA	2	12	601397	601408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022112	AACCGA	2	12	605586	605597	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022112	TCGCAC	2	12	611025	611036	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022112	AAAACA	2	12	616456	616467	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022112	ATGCTC	2	12	632715	632726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022112	TCGCAG	2	12	686630	686641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022112	TCGCAG	2	12	716522	716533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022112	AAAATA	2	12	719442	719453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022112	AACTTT	2	12	755001	755012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022112	TGGAAG	2	12	779293	779304	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022112	GCAGGT	2	12	779368	779379	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022112	CTGCGA	2	12	779382	779393	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022112	TGTTAT	2	12	780400	780411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022112	TATACT	2	12	785132	785143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022112	TGGAAG	2	12	798660	798671	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022112	CGCAGG	2	12	798734	798745	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022112	CTGCGA	2	12	798749	798760	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022112	TCGCAG	2	12	807063	807074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022112	CTGCGA	2	12	879838	879849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022112	ACACTG	2	12	930208	930219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022112	CAAGAA	2	12	1004258	1004269	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022112	TGAATT	2	12	1096294	1096305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022112	CCGACA	2	12	1105058	1105069	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022112	GAAAAG	2	12	1145931	1145942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022112	GCTGGT	2	12	1170269	1170280	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022112	AACGAA	2	12	1202547	1202558	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022112	TCCACC	2	12	1223365	1223376	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_022112	CCTTGA	2	12	1224921	1224932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022112	AAAAGG	2	12	1226035	1226046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022112	AGCGCA	2	12	1274802	1274813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022112	TGAAAA	2	12	1342094	1342105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022112	GATAGT	2	12	1360436	1360447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022112	TATTTT	2	12	1384620	1384631	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022112	TCGCAG	2	12	1394980	1394991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022112	AGGATG	2	12	1397114	1397125	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022112	TCGCAG	2	12	1427741	1427752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022112	CGAAAA	2	12	1427794	1427805	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022112	GATCAG	2	12	1428028	1428039	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022112	TCGCAG	2	12	1454269	1454280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022112	TTAGTT	2	12	1475565	1475576	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022112	TTTTGA	2	12	1521485	1521496	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022112	GCACGC	2	12	1535264	1535275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022112	AATGCT	2	12	1539803	1539814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022112	ACAGGT	2	12	1544750	1544761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022112	CAAAGC	2	12	1590544	1590555	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022112	CCTGCC	2	12	1681177	1681188	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022112	ATTAAA	2	12	1724118	1724129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022112	TCGCCA	2	12	1788498	1788509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022112	ATCAAA	2	12	1791054	1791065	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022112	TTACGA	2	12	1814640	1814651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022112	TCGCAG	2	12	1862696	1862707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022112	CACTTC	2	12	1862859	1862870	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022112	ATTGTT	2	12	1871458	1871469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022112	TCGCAG	2	12	1874857	1874868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022112	GACATG	2	12	1919496	1919507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022112	TAACCT	2	12	1930988	1930999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022112	CTTTCA	2	12	1933003	1933014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022112	ACGATT	2	12	1933105	1933116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022112	CCAAAT	2	12	1934931	1934942	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022112	GGACAA	2	12	1938932	1938943	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022112	GCCAAA	2	12	1939633	1939644	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022112	GATCTT	2	12	1998899	1998910	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022112	CATAAC	2	12	2010141	2010152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022112	CAATCA	2	12	2027704	2027715	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022112	ATGCCG	2	12	2068941	2068952	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022112	TCGCAG	2	12	2071226	2071237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022112	CATGAT	2	12	2097874	2097885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022112	TTGCTT	2	12	2098671	2098682	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022112	CTGCGA	2	12	2114474	2114485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022112	ATTTTA	2	12	2134893	2134904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022112	TCATTT	2	12	2142019	2142030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022112	GATATG	2	12	2147481	2147492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022112	ATTTAA	2	12	2156970	2156981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022112	AAATTG	2	12	2164603	2164614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022112	CATCAA	2	12	2209296	2209307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022112	GTGAGC	2	12	2239533	2239544	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022112	TTCGCA	2	12	2254060	2254071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022112	ACTGGA	2	12	2268654	2268665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022112	TAACAA	2	12	2293974	2293985	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022112	CATGAA	2	12	2303000	2303011	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022112	AATTTA	2	12	2305331	2305342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022112	GTCTTC	2	12	2336596	2336607	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022112	TAGGCA	2	12	2357933	2357944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022112	TTTAGA	2	12	2368065	2368076	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022112	CTTGTT	2	12	2381624	2381635	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022112	TACAGT	2	12	2390905	2390916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_022112	TTGATA	2	12	2400426	2400437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022112	GGCATC	2	12	2400575	2400586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022112	ACATAT	2	12	2406918	2406929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_022112	AACGGC	2	12	2478637	2478648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022112	TCGCAG	2	12	2488343	2488354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022112	TTTGAC	2	12	2499161	2499172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_022112	TCGCAG	2	12	2500257	2500268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022112	CCTGCG	2	12	2500272	2500283	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022112	CACTTC	2	12	2500344	2500355	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022112	CTGCGA	2	12	2524178	2524189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022112	TTTCAT	2	12	2539228	2539239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_022112	ATGACC	2	12	2590011	2590022	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022112	CTGCGA	2	12	2596212	2596223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_022112	CTGCGA	2	12	2596335	2596346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022112	CTGCGA	2	12	2631788	2631799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022112	TTTCAG	2	12	2635233	2635244	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_022112	CAGCAT	2	12	2638005	2638016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022112	TTCAAT	2	12	2645836	2645847	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_022112	CAGCAT	2	12	2706201	2706212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022112	TCGCAG	2	12	2748414	2748425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022112	TTTTCG	2	12	2761586	2761597	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_022112	TGATTC	2	12	2774648	2774659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_022112	TTCCTA	2	12	2796997	2797008	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_022112	ATTTCC	2	12	2811196	2811207	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_022112	GTGAGC	2	12	2837659	2837670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_022112	ATATCG	2	12	2889765	2889776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_022112	TTATAA	2	12	2897064	2897075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022112	TTTCTA	2	12	2920552	2920563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_022112	TACTGC	2	12	2920634	2920645	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.