MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 9665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022112	CA	3	6	385512	385517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_022112	TAA	2	6	385548	385553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_022112	TA	3	6	385558	385563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_022112	GAT	2	6	385623	385628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_022112	ATA	2	6	385638	385643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_022112	TTC	2	6	385691	385696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_022112	T	7	7	385711	385717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_022112	AAT	2	6	385731	385736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_022112	AAT	2	6	385818	385823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_022112	ATT	2	6	385849	385854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_022112	GAC	2	6	385881	385886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_022112	ATA	2	6	385917	385922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_022112	TGT	2	6	385928	385933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_022112	AAG	2	6	386033	386038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_022112	T	6	6	386100	386105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_022112	TTA	2	6	386111	386116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_022112	A	7	7	386153	386159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_022112	CTGC	2	8	386197	386204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_022112	ATATTG	2	12	386205	386216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_022112	TCTTTT	2	12	387119	387130	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1521	NC_022112	TTC	2	6	387147	387152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_022112	CTG	2	6	387180	387185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_022112	TAA	2	6	387353	387358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_022112	TCA	2	6	387401	387406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_022112	T	6	6	387413	387418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_022112	TAG	2	6	387463	387468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_022112	ACT	2	6	387490	387495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_022112	CAC	2	6	387604	387609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_022112	GGA	2	6	387635	387640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_022112	ATTT	2	8	387718	387725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_022112	CTTT	2	8	387745	387752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_022112	TA	3	6	387779	387784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_022112	A	6	6	387813	387818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_022112	ACG	2	6	387848	387853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_022112	CA	3	6	387870	387875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_022112	CAA	2	6	387921	387926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_022112	CAC	2	6	387936	387941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_022112	ATG	2	6	388074	388079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_022112	ATC	2	6	388100	388105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_022112	CG	3	6	388129	388134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_022112	TAC	2	6	388161	388166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_022112	TAC	2	6	388197	388202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_022112	CTT	2	6	388967	388972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_022112	TAT	2	6	388973	388978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_022112	ACT	2	6	389013	389018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_022112	GAG	2	6	389030	389035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_022112	AACC	2	8	389056	389063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_022112	ATT	2	6	389098	389103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_022112	ACC	2	6	389128	389133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_022112	ACT	2	6	389152	389157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_022112	A	7	7	389197	389203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_022112	CCT	2	6	389236	389241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_022112	TA	3	6	389300	389305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_022112	AT	4	8	389330	389337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_022112	GAAA	2	8	389430	389437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_022112	TGT	2	6	389498	389503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_022112	TCAAA	2	10	389571	389580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1559	NC_022112	AAT	2	6	389605	389610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022112	T	6	6	389615	389620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_022112	ATT	2	6	389652	389657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_022112	T	7	7	389656	389662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_022112	AGT	2	6	389720	389725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_022112	T	6	6	389736	389741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_022112	GAG	2	6	389742	389747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_022112	AAT	2	6	389750	389755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_022112	CACAA	2	10	391481	391490	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_022112	TGA	2	6	391568	391573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_022112	TAA	2	6	391597	391602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_022112	TTG	2	6	392054	392059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_022112	GTT	2	6	392125	392130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_022112	TGT	2	6	392135	392140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_022112	ACA	2	6	392166	392171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1575	NC_022112	TTG	2	6	392308	392313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_022112	ATCA	2	8	392355	392362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_022112	TAA	2	6	392371	392376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_022112	AAG	2	6	392436	392441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1580	NC_022112	GTT	2	6	392517	392522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_022112	GAA	2	6	393432	393437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_022112	ATC	2	6	393492	393497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_022112	TTG	2	6	393533	393538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_022112	TTGTG	2	10	397425	397434	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_022112	CACCTT	2	12	397478	397489	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_022112	TGG	2	6	397544	397549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_022112	CAA	2	6	397559	397564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1591	NC_022112	GAA	2	6	397595	397600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_022112	CTG	2	6	398526	398531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1594	NC_022112	GGC	2	6	398546	398551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_022112	GTAA	2	8	398564	398571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_022112	TGT	2	6	401767	401772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_022112	CTTT	2	8	401852	401859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_022112	ACA	2	6	401881	401886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_022112	CAA	2	6	401903	401908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_022112	TAT	2	6	401938	401943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_022112	CAAA	2	8	401951	401958	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_022112	A	7	7	401986	401992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_022112	GGA	2	6	404996	405001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_022112	TCAG	2	8	406509	406516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_022112	ACA	2	6	408249	408254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_022112	TGT	2	6	408276	408281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_022112	AGAA	2	8	408518	408525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_022112	GAT	2	6	409398	409403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_022112	GAT	2	6	409523	409528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_022112	TTA	2	6	409551	409556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1620	NC_022112	A	6	6	409696	409701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_022112	T	6	6	409716	409721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_022112	A	6	6	409739	409744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022112	TTTTG	2	10	409806	409815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_022112	TAT	2	6	410147	410152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_022112	AT	3	6	410562	410567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_022112	GCT	2	6	410571	410576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_022112	ATG	2	6	410578	410583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_022112	GTT	2	6	410590	410595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_022112	TGC	2	6	410673	410678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1635	NC_022112	ACC	2	6	413320	413325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_022112	TTA	2	6	413372	413377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_022112	TTG	2	6	413414	413419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_022112	AG	3	6	413432	413437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_022112	AGGG	2	8	413464	413471	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1654	NC_022112	AGA	2	6	421273	421278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1656	NC_022112	CA	3	6	421367	421372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1908	NC_022112	CGC	2	6	505232	505237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1909	NC_022112	TTG	2	6	505341	505346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_022112	TGC	2	6	507276	507281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1911	NC_022112	ATG	2	6	507341	507346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1912	NC_022112	TCC	2	6	513902	513907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1913	NC_022112	GTA	2	6	513928	513933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_022112	TG	3	6	513953	513958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_022112	TTGT	2	8	513982	513989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1922	NC_022112	AAC	2	6	514221	514226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1923	NC_022112	TCAA	2	8	514297	514304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1928	NC_022112	GTT	2	6	520034	520039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1930	NC_022112	AGC	2	6	520122	520127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1936	NC_022112	AAT	2	6	523073	523078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_022112	GAAA	2	8	523430	523437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1938	NC_022112	TTGA	2	8	523474	523481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_022112	GGC	2	6	523488	523493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1941	NC_022112	TCA	2	6	525057	525062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1943	NC_022112	TCC	2	6	526645	526650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1949	NC_022112	AAG	2	6	531908	531913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_022112	A	6	6	531984	531989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_022112	CTGA	2	8	532061	532068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1954	NC_022112	AT	3	6	532113	532118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1962	NC_022112	TGA	2	6	534278	534283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1964	NC_022112	ATT	2	6	534951	534956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_022112	A	6	6	535079	535084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_022112	GAT	2	6	535095	535100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1979	NC_022112	A	6	6	538354	538359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1997	NC_022112	A	6	6	541934	541939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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