MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 9665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022112	TCGT	2	8	125799	125806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_022112	GAG	2	6	125920	125925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022112	T	6	6	127262	127267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022112	GCT	2	6	127272	127277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_022112	TGG	2	6	127292	127297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022112	T	7	7	127301	127307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022112	CAT	2	6	127320	127325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_022112	AGG	2	6	127377	127382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022112	CGT	2	6	127390	127395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022112	GAT	2	6	127485	127490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022112	AT	3	6	127489	127494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022112	CA	3	6	129864	129869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_022112	ACC	2	6	129873	129878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_022112	GGT	2	6	129900	129905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022112	T	6	6	129905	129910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022112	ATC	2	6	132355	132360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_022112	CGT	2	6	132420	132425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_022112	TGAC	2	8	132431	132438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_022112	GCT	2	6	132449	132454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_022112	TCA	2	6	132455	132460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_022112	GTG	2	6	132486	132491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022112	A	6	6	132500	132505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022112	T	7	7	133466	133472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022112	AAAT	2	8	133506	133513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022112	TG	3	6	133552	133557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022112	TG	3	6	133630	133635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022112	CCGG	2	8	133680	133687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_022112	TAA	2	6	133696	133701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022112	GA	3	6	133730	133735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022112	AGG	2	6	134429	134434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022112	AAG	2	6	134716	134721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022112	T	6	6	134749	134754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022112	AT	4	8	134755	134762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022112	GAT	2	6	134795	134800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022112	AAC	2	6	134844	134849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_022112	TA	3	6	136037	136042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022112	AAT	2	6	136060	136065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022112	AAAC	2	8	136074	136081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_022112	GGA	2	6	136086	136091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022112	TTG	2	6	138014	138019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022112	CAA	2	6	138035	138040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_022112	CGT	2	6	138133	138138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_022112	AAC	2	6	138159	138164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_022112	AAT	2	6	138167	138172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022112	AC	3	6	138178	138183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_022112	TA	3	6	138184	138189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022112	CTG	2	6	138244	138249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_022112	T	7	7	140559	140565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022112	TCAAA	2	10	140662	140671	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
550	NC_022112	GGTG	2	8	142074	142081	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022112	GCA	2	6	142085	142090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_022112	GAA	2	6	142156	142161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022112	TGA	2	6	142279	142284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022112	ATTA	2	8	142290	142297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022112	ATA	2	6	142299	142304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022112	GTT	2	6	142317	142322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022112	A	6	6	142324	142329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022112	TTAG	2	8	142340	142347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022112	TGAC	2	8	143766	143773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_022112	TGT	2	6	143793	143798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022112	ATT	2	6	144660	144665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022112	GAG	2	6	144790	144795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022112	TCC	2	6	146242	146247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_022112	T	6	6	146254	146259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022112	TGGT	2	8	146262	146269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022112	A	6	6	146292	146297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022112	TCA	3	9	146302	146310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_022112	GTC	2	6	146317	146322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_022112	TTA	2	6	146340	146345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022112	CATTCT	2	12	146361	146372	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_022112	A	7	7	146396	146402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022112	TGTT	2	8	146474	146481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022112	CAG	2	6	146485	146490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_022112	CAGA	2	8	146558	146565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_022112	GCT	2	6	146665	146670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_022112	GGC	2	6	146690	146695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_022112	T	7	7	146833	146839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022112	TGG	2	6	146861	146866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022112	AAC	2	6	146891	146896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_022112	CTT	2	6	146897	146902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_022112	GCT	2	6	146904	146909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_022112	AAG	2	6	146910	146915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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584	NC_022112	AACTTT	2	12	147538	147549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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587	NC_022112	AAAT	2	8	147667	147674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_022112	TCGCAG	2	12	148716	148727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_022112	ATTA	2	8	150015	150022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022112	TCG	2	6	150069	150074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_022112	AGA	2	6	150131	150136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022112	TTAA	2	8	150155	150162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022112	AT	3	6	150591	150596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022112	TAT	2	6	151703	151708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_022112	AAG	2	6	151786	151791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022112	T	6	6	153477	153482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022112	GATT	2	8	153491	153498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_022112	GTGAGC	2	12	153817	153828	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
602	NC_022112	TGA	2	6	153867	153872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022112	CGA	2	6	153890	153895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_022112	CCT	2	6	154471	154476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_022112	AT	3	6	154491	154496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022112	ACA	2	6	154501	154506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_022112	AT	3	6	154532	154537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022112	GGT	2	6	154565	154570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022112	TTTC	2	8	156007	156014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_022112	CTT	2	6	156527	156532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_022112	TGT	2	6	156545	156550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022112	TCA	2	6	156555	156560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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614	NC_022112	AAG	2	6	158194	158199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022112	CTT	2	6	158259	158264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_022112	GTA	2	6	158649	158654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022112	A	6	6	158654	158659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022112	TGA	2	6	158672	158677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022112	ATT	2	6	158684	158689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022112	A	6	6	158733	158738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022112	TA	3	6	158749	158754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022112	AGG	2	6	158759	158764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022112	TGT	2	6	159149	159154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022112	CTG	2	6	159156	159161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_022112	T	7	7	159164	159170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022112	A	6	6	159187	159192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022112	CAA	2	6	159193	159198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_022112	C	6	6	161829	161834	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
629	NC_022112	TCT	2	6	161888	161893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022112	AAGT	2	8	161895	161902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022112	AAGA	2	8	161977	161984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022112	AATG	2	8	162065	162072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022112	GAT	2	6	162144	162149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022112	TCA	2	6	162166	162171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_022112	GAT	2	6	162186	162191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022112	CAA	2	6	162206	162211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_022112	GTTG	2	8	162313	162320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022112	TGGT	2	8	162361	162368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022112	AAT	2	6	162381	162386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022112	CT	3	6	162409	162414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_022112	AT	3	6	162469	162474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_022112	TTG	2	6	162558	162563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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648	NC_022112	ACC	2	6	163068	163073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
649	NC_022112	CCA	2	6	163111	163116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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652	NC_022112	TGAAC	2	10	163392	163401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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675	NC_022112	AAC	2	6	168552	168557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_022112	T	6	6	169548	169553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
682	NC_022112	A	6	6	169572	169577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_022112	AGG	2	6	201088	201093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
779	NC_022112	TTA	2	6	201131	201136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
780	NC_022112	TGT	2	6	202771	202776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
781	NC_022112	TGT	2	6	202819	202824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
782	NC_022112	AT	3	6	202828	202833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
783	NC_022112	AGTG	2	8	203792	203799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
784	NC_022112	AG	3	6	203813	203818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
785	NC_022112	GGA	2	6	203837	203842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
786	NC_022112	CAT	2	6	203849	203854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
787	NC_022112	ATT	2	6	203960	203965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
788	NC_022112	ACA	2	6	204035	204040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_022112	TGT	2	6	204063	204068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
790	NC_022112	ATT	2	6	206172	206177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
791	NC_022112	AAGG	2	8	206189	206196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
792	NC_022112	TGC	2	6	208256	208261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_022112	CAA	2	6	208320	208325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
794	NC_022112	TCGAT	2	10	208348	208357	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
795	NC_022112	AGG	2	6	208379	208384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
796	NC_022112	TCC	2	6	211345	211350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
797	NC_022112	AAAC	2	8	211451	211458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
798	NC_022112	T	6	6	212133	212138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
799	NC_022112	GAT	2	6	212175	212180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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801	NC_022112	TTG	2	6	212227	212232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
802	NC_022112	AAGGT	2	10	212234	212243	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
803	NC_022112	CGT	2	6	212574	212579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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805	NC_022112	A	6	6	212635	212640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
806	NC_022112	T	7	7	212660	212666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
807	NC_022112	TGAGG	2	10	212710	212719	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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810	NC_022112	T	6	6	213739	213744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
811	NC_022112	TTG	2	6	214753	214758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
812	NC_022112	CAT	3	9	214802	214810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
813	NC_022112	GTA	2	6	214865	214870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
814	NC_022112	AGAA	2	8	214885	214892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
815	NC_022112	TCT	2	6	214911	214916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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817	NC_022112	AGTA	2	8	215229	215236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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819	NC_022112	ATG	2	6	215698	215703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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821	NC_022112	T	6	6	215767	215772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
822	NC_022112	TCGTT	2	10	215830	215839	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
823	NC_022112	AGA	2	6	215855	215860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
824	NC_022112	AAAG	2	8	215871	215878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
825	NC_022112	GAT	2	6	216153	216158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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831	NC_022112	T	7	7	217919	217925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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854	NC_022112	A	7	7	228670	228676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
855	NC_022112	GTA	2	6	228709	228714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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865	NC_022112	CAA	2	6	234434	234439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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867	NC_022112	A	6	6	234461	234466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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909	NC_022112	TGT	2	6	255153	255158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
910	NC_022112	ATAA	2	8	255268	255275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
911	NC_022112	GAA	2	6	256676	256681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
912	NC_022112	A	6	6	256685	256690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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914	NC_022112	GGAT	2	8	256732	256739	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
915	NC_022112	TAG	2	6	256784	256789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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917	NC_022112	GGC	2	6	262491	262496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
918	NC_022112	T	6	6	262513	262518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
919	NC_022112	ACT	2	6	262538	262543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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921	NC_022112	CAG	2	6	263677	263682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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923	NC_022112	T	7	7	263711	263717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
924	NC_022112	T	6	6	263788	263793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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942	NC_022112	GGT	2	6	266748	266753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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948	NC_022112	GAG	2	6	267887	267892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_022112	AT	3	6	271811	271816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
954	NC_022112	GTCGT	2	10	271817	271826	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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973	NC_022112	A	7	7	274740	274746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
974	NC_022112	AAG	2	6	274874	274879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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988	NC_022112	T	6	6	275552	275557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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