MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	ATTT	3	12	1844	1855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022051	TTCT	2	8	1906	1913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022051	GATA	2	8	1938	1945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022051	GACT	2	8	2011	2018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022051	GAGG	2	8	2272	2279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022051	CTAC	2	8	2327	2334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022051	TAAA	2	8	4560	4567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022051	TGTT	2	8	8216	8223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022051	CATC	2	8	8243	8250	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022051	GTTT	2	8	9124	9131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022051	TAAT	2	8	13434	13441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022051	TAAA	2	8	13448	13455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022051	CTAA	2	8	14837	14844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022051	TAGT	2	8	17410	17417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022051	AATC	2	8	17431	17438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022051	GAAC	2	8	17531	17538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022051	TTTG	2	8	17604	17611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022051	AATT	2	8	20745	20752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022051	AATT	2	8	23017	23024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022051	CAAG	2	8	26571	26578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022051	ATTA	2	8	26589	26596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022051	ATAA	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022051	GTAA	2	8	28245	28252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022051	TTTA	2	8	32766	32773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022051	TCAA	2	8	39847	39854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022051	ATTG	2	8	41356	41363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022051	CTTT	2	8	41558	41565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022051	TTGA	2	8	41922	41929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022051	TCTT	2	8	44640	44647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022051	ATTA	2	8	51848	51855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022051	GAAC	2	8	52572	52579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022051	ACTA	2	8	54238	54245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022051	ATCA	2	8	54974	54981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022051	ATTA	2	8	55058	55065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.