MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	CTTT	2	8	156	163	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022045	CGAT	2	8	1572	1579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022045	TTTC	2	8	1685	1692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022045	AGTT	2	8	2373	2380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022045	TTAC	2	8	2416	2423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022045	AAAT	2	8	2475	2482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022045	ATTT	2	8	6688	6695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022045	TAAA	2	8	10576	10583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022045	GGAG	2	8	10584	10591	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022045	CTTA	2	8	15106	15113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022045	TAAT	2	8	16794	16801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022045	CTTG	2	8	16812	16819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022045	AATT	2	8	20713	20720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022045	CAAA	2	8	22461	22468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022045	TCCC	2	8	22480	22487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_022045	AATT	2	8	22985	22992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022045	ACAA	2	8	26125	26132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022045	CAAA	2	8	26215	26222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022045	TCAG	2	8	26248	26255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022045	ATTT	2	8	27079	27086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022045	GAAA	2	8	27131	27138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022045	TTAT	2	8	28779	28786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022045	TTCG	2	8	32861	32868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022045	AAGG	2	8	36080	36087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022045	GCAA	2	8	39882	39889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022045	AAAG	2	8	39917	39924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022045	TATC	2	8	52560	52567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022045	AAAT	2	8	52599	52606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022045	CTTC	2	8	53337	53344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022045	CTTT	2	8	57718	57725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022045	AGTT	2	8	59929	59936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022045	TTAC	2	8	59972	59979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022045	AAAT	2	8	60031	60038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022045	ATTT	2	8	64241	64248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022045	ATGA	2	8	65832	65839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022045	ATAA	2	8	66973	66980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022045	AATA	2	8	77514	77521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022045	GAAA	2	8	77952	77959	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022045	TTTC	2	8	81027	81034	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022045	AGCA	2	8	81367	81374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022045	GTTT	2	8	82387	82394	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022045	AAAT	2	8	82634	82641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022045	TTTA	2	8	89523	89530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022045	TAAT	2	8	89531	89538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022045	TTCC	2	8	103973	103980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022045	CTTC	2	8	104269	104276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022045	AATA	2	8	118185	118192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022045	CAAT	2	8	119479	119486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022045	ATAC	2	8	119830	119837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022045	TAAA	2	8	120118	120125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022045	TTTA	2	8	122355	122362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022045	AATT	2	8	122414	122421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022045	TAAT	2	8	123744	123751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022045	TCAA	2	8	123757	123764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022045	ACAT	2	8	123969	123976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022045	AAAT	2	8	124032	124039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022045	ACAA	2	8	125716	125723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022045	TTTA	2	8	125813	125820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022045	TAAA	2	8	128153	128160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022045	TGTT	2	8	131809	131816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022045	CATC	2	8	131836	131843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022045	GTTT	2	8	132717	132724	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022045	AAGA	2	8	138573	138580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022045	AAAT	2	8	138846	138853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022045	TTAT	2	8	141796	141803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022045	CAGA	2	8	142798	142805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_022045	CGTT	2	8	144714	144721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022045	TTAT	2	8	144838	144845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022045	AACT	2	8	144909	144916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022045	GTTT	2	8	148219	148226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022045	TGTT	2	8	148227	148234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022045	GAAA	2	8	148650	148657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022045	AAAT	2	8	148864	148871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.