MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	TTG	2	6	278	283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022045	AAT	2	6	295	300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022045	GAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022045	CAT	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022045	CTT	2	6	570	575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022045	CGA	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022045	CTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022045	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022045	CTT	2	6	712	717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022045	CCT	2	6	786	791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_022045	CTT	2	6	792	797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022045	TGC	2	6	799	804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022045	CTG	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022045	CTT	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022045	CAT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022045	CTT	2	6	1277	1282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022045	CTT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022045	ACG	2	6	1626	1631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022045	TGT	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022045	TCT	2	6	1766	1771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022045	TAG	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022045	GCT	2	6	1805	1810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022045	AGC	2	6	1942	1947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022045	CAA	2	6	2008	2013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022045	TTA	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022045	CTT	2	6	2076	2081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022045	TCA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022045	CCT	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_022045	CTG	2	6	2232	2237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022045	AAT	2	6	2243	2248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022045	GTC	2	6	2346	2351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022045	ATA	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022045	AAT	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022045	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022045	ATT	2	6	3421	3426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022045	ATT	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022045	ATA	2	6	5173	5178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022045	GAA	2	6	5179	5184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022045	CTT	2	6	6713	6718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022045	AAT	2	6	6808	6813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022045	AGG	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022045	AGG	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022045	ATA	2	6	10472	10477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022045	ATT	2	6	11571	11576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022045	CTC	2	6	11588	11593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_022045	CCT	2	6	12385	12390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022045	GAA	2	6	14863	14868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022045	AAT	2	6	14929	14934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022045	GGT	2	6	15080	15085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022045	GGT	2	6	15115	15120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022045	GGT	2	6	15148	15153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022045	GGT	2	6	15182	15187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022045	TAA	2	6	16710	16715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022045	TAT	2	6	16777	16782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022045	TTC	2	6	16922	16927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022045	TGG	2	6	20513	20518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022045	TAC	2	6	23016	23021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022045	TTA	2	6	23084	23089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022045	TTA	2	6	23130	23135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022045	AGG	2	6	23148	23153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022045	CCT	2	6	26081	26086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_022045	CAA	2	6	26088	26093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022045	AAT	2	6	26178	26183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022045	TTA	2	6	26201	26206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022045	TCA	2	6	27043	27048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022045	AAC	2	6	28574	28579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022045	CTT	2	6	28635	28640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022045	ACA	2	6	30920	30925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022045	ATA	2	6	30961	30966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022045	AAT	2	6	31041	31046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022045	GTG	2	6	31201	31206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022045	AAG	2	6	31266	31271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022045	ATT	2	6	31586	31591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022045	AAT	2	6	31883	31888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022045	TTA	2	6	32918	32923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022045	CCT	2	6	35583	35588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_022045	CTT	2	6	35709	35714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022045	ATT	2	6	35775	35780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022045	ATA	3	9	35853	35861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022045	CAC	2	6	35910	35915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_022045	ATA	2	6	36010	36015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022045	TAA	3	9	37298	37306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022045	AAT	2	6	37311	37316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022045	ATC	2	6	38041	38046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022045	TCC	2	6	39442	39447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_022045	CAT	2	6	39486	39491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022045	AAC	2	6	39493	39498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022045	TTA	2	6	39531	39536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022045	TAA	2	6	39871	39876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022045	TGG	3	9	39895	39903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022045	AGT	2	6	40034	40039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022045	TTC	2	6	40210	40215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022045	TCC	2	6	41616	41621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_022045	TAA	2	6	42023	42028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022045	AGG	2	6	42038	42043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022045	CTC	2	6	42688	42693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_022045	AAT	2	6	42787	42792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022045	TAT	2	6	45423	45428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022045	ATT	2	6	45544	45549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022045	AGG	2	6	45584	45589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022045	CCT	2	6	52356	52361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022045	TAA	2	6	52384	52389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022045	TTA	2	6	53193	53198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022045	TAA	2	6	53404	53409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022045	GTT	2	6	53437	53442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022045	TTA	2	6	56502	56507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022045	CAA	2	6	56539	56544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022045	ACT	2	6	56861	56866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022045	ATT	2	6	56980	56985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022045	TAC	2	6	56998	57003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022045	CCT	2	6	59696	59701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_022045	CTG	2	6	59788	59793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022045	AAT	2	6	59799	59804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022045	GTC	2	6	59902	59907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022045	ATA	2	6	59939	59944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022045	AAT	2	6	60930	60935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022045	ATT	2	6	60962	60967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022045	ATT	2	6	60975	60980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022045	ATT	2	6	60988	60993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022045	ATA	2	6	62726	62731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022045	GAA	2	6	62732	62737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022045	CTT	2	6	64266	64271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022045	AAT	2	6	64361	64366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022045	AGG	2	6	64380	64385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022045	AGG	2	6	64809	64814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022045	TCA	2	6	65590	65595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022045	ATT	2	6	65622	65627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022045	CCA	2	6	65780	65785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_022045	GCA	2	6	65900	65905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022045	TCC	2	6	66373	66378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_022045	TTA	2	6	66420	66425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022045	AAT	2	6	66444	66449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022045	ATA	2	6	66496	66501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022045	CTG	2	6	66601	66606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022045	GAG	2	6	66635	66640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022045	AAG	2	6	66948	66953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022045	TCC	2	6	70190	70195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_022045	ATA	2	6	75894	75899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022045	CCT	2	6	77459	77464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_022045	CCA	2	6	77473	77478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_022045	ATT	2	6	77487	77492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022045	TTC	2	6	77498	77503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022045	TGG	2	6	77561	77566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_022045	TCT	2	6	77878	77883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.