MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 1071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021872	ATTC	2	8	19178	19185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021872	ATTT	2	8	19561	19568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021872	TAAT	2	8	22198	22205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021872	TTAA	2	8	29205	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021872	TAAC	2	8	31203	31210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021872	TAAA	2	8	34364	34371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021872	GCCA	2	8	34425	34432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021872	TTTA	2	8	37451	37458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021872	TTGA	2	8	50205	50212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021872	ATTA	2	8	50221	50228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021872	ATAA	2	8	54572	54579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021872	ATAA	2	8	54727	54734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021872	AGAA	2	8	58644	58651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021872	ACGA	2	8	60219	60226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021872	ATTA	2	8	72250	72257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021872	CAAT	2	8	82048	82055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021872	TATC	2	8	85515	85522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021872	TCCT	2	8	90579	90586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021872	ATTA	2	8	90626	90633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021872	TTTA	2	8	91753	91760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021872	GAGC	2	8	91874	91881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021872	AACG	2	8	91889	91896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021872	CACT	2	8	92252	92259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021872	AAGG	2	8	92412	92419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021872	TGAG	2	8	93528	93535	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021872	GTCC	2	8	98696	98703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021872	GGAT	2	8	99471	99478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021872	CAGT	2	8	99958	99965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021872	TTAA	2	8	100297	100304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021872	TGAT	2	8	107990	107997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021872	AGGC	2	8	110708	110715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021872	GAAA	2	8	110818	110825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021872	TAAT	2	8	112352	112359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021872	ATAA	2	8	112488	112495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021872	TACT	2	8	115400	115407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021872	TTAA	2	8	124476	124483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021872	TTAT	2	8	124547	124554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021872	GATA	2	8	124575	124582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021872	ATAA	2	8	124690	124697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021872	TCAA	2	8	124942	124949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021872	ATTA	2	8	138733	138740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021872	TTTA	2	8	138928	138935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021872	TTGT	2	8	139160	139167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021872	AGTT	2	8	139592	139599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021872	ATAA	2	8	141345	141352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021872	GTTG	2	8	141379	141386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021872	ATTT	2	8	141452	141459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021872	GACT	2	8	143737	143744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021872	GGGA	2	8	145546	145553	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021872	AACA	2	8	145591	145598	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021872	AGAT	2	8	145776	145783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021872	GCTT	2	8	148555	148562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021872	TGAT	2	8	153288	153295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021872	AAAT	2	8	155372	155379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021872	TAGT	2	8	161849	161856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021872	ATAA	2	8	166167	166174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021872	AGGA	2	8	166207	166214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021872	CGAC	2	8	166320	166327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021872	ATTA	2	8	171002	171009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021872	GATT	2	8	171024	171031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021872	AGAA	2	8	171033	171040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021872	ATCC	2	8	173036	173043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021872	CCGA	2	8	173168	173175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021872	CTTT	2	8	173561	173568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021872	ATCC	2	8	173805	173812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021872	GTTA	2	8	175141	175148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021872	AAAG	2	8	175237	175244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021872	ATTA	2	8	179649	179656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021872	TATT	2	8	179929	179936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021872	GCGG	2	8	180664	180671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021872	GAAG	2	8	187786	187793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021872	AACT	2	8	187843	187850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021872	CGTA	2	8	189532	189539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021872	AATT	2	8	189703	189710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021872	AAAT	2	8	189722	189729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021872	ATTA	2	8	203427	203434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021872	TGAT	2	8	203732	203739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021872	AGTG	2	8	203771	203778	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021872	TTTG	2	8	203877	203884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021872	GTGA	2	8	204088	204095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021872	CGTG	2	8	204137	204144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021872	AGCG	2	8	204258	204265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021872	GGAG	2	8	205139	205146	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021872	TTAA	2	8	205375	205382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021872	TAGC	2	8	205598	205605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021872	AGAA	2	8	205652	205659	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021872	GCTT	2	8	205713	205720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021872	TGCA	2	8	206067	206074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021872	TAGG	2	8	207570	207577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021872	GACA	2	8	207805	207812	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021872	TATG	2	8	208176	208183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021872	AGAT	2	8	208377	208384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021872	TAAT	2	8	208608	208615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021872	TTGG	2	8	216796	216803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021872	GAAA	2	8	221409	221416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021872	GAAA	2	8	223625	223632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021872	AGAA	2	8	228024	228031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021872	TAAT	2	8	231283	231290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021872	ATTG	2	8	236962	236969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021872	TTTA	2	8	240568	240575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021872	TTAG	2	8	242337	242344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021872	TCAA	2	8	246197	246204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021872	TTAA	2	8	246222	246229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021872	TAAA	2	8	246246	246253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021872	CCAG	2	8	246459	246466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021872	TACT	2	8	246488	246495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021872	AATT	2	8	246522	246529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021872	CTAT	2	8	246627	246634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021872	TAAA	2	8	247643	247650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021872	CTTT	2	8	250186	250193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021872	AATT	2	8	250194	250201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021872	TAAA	2	8	250202	250209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021872	CGGT	2	8	258538	258545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021872	TAAT	2	8	259835	259842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021872	ATTT	2	8	264085	264092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021872	TAAC	2	8	271432	271439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021872	TTTG	2	8	275101	275108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021872	TTAA	2	8	275237	275244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021872	AGAA	2	8	275262	275269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021872	GGAA	2	8	278584	278591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021872	TTTC	2	8	278604	278611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021872	TAGA	2	8	282760	282767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021872	TACT	2	8	282783	282790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021872	GTTC	2	8	284381	284388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021872	ATAA	2	8	285640	285647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021872	AAAT	2	8	292584	292591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021872	TAAA	2	8	292651	292658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021872	ATTG	2	8	304511	304518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021872	ATTT	2	8	304521	304528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021872	ATTT	2	8	317962	317969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021872	TTAT	2	8	318111	318118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021872	ATTG	2	8	318161	318168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021872	ATGA	2	8	318624	318631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021872	ATTA	2	8	323637	323644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021872	TTTA	2	8	323789	323796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021872	CCAT	2	8	328801	328808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021872	TTGT	2	8	328827	328834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021872	ACGA	2	8	329941	329948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021872	TTAA	2	8	338413	338420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021872	GTAT	2	8	344422	344429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021872	AAAT	2	8	346139	346146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021872	ATAC	2	8	346413	346420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021872	ATCA	2	8	346630	346637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021872	ATTA	2	8	346651	346658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021872	TGAT	2	8	346956	346963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021872	AGTG	2	8	346995	347002	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021872	TTTG	2	8	347101	347108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021872	GTGA	2	8	347312	347319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021872	CGTG	2	8	347361	347368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021872	AGCG	2	8	347482	347489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021872	GGAG	2	8	348363	348370	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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