MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 7488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021872	AAC	2	6	1165755	1165760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_021872	CTC	2	6	1165809	1165814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_021872	ACG	2	6	1165858	1165863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_021872	ACC	2	6	1166053	1166058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_021872	CTGT	2	8	1166093	1166100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_021872	AGG	2	6	1166189	1166194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021872	TGC	2	6	1166246	1166251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_021872	GTA	2	6	1166277	1166282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021872	CCA	2	6	1166285	1166290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_021872	CCTA	2	8	1166329	1166336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_021872	ATTTCA	2	12	1166432	1166443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4012	NC_021872	TC	3	6	1166449	1166454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_021872	GCC	2	6	1166546	1166551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_021872	TC	3	6	1166773	1166778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_021872	TC	3	6	1166793	1166798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_021872	ACT	2	6	1166836	1166841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_021872	CCT	2	6	1166992	1166997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_021872	CTCGGC	2	12	1167067	1167078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_021872	GGA	2	6	1167099	1167104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021872	CCA	2	6	1167196	1167201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_021872	CGC	2	6	1167220	1167225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_021872	TGG	2	6	1167348	1167353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021872	AT	3	6	1167412	1167417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021872	GA	3	6	1167613	1167618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021872	TCC	2	6	1167699	1167704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_021872	CTT	2	6	1167773	1167778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_021872	TGCA	2	8	1167832	1167839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_021872	CCG	2	6	1168051	1168056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_021872	AG	3	6	1168074	1168079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021872	CAA	2	6	1168182	1168187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_021872	TTG	2	6	1168194	1168199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021872	TCGC	2	8	1168218	1168225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_021872	TTTC	2	8	1168246	1168253	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_021872	CTA	2	6	1168265	1168270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_021872	GCTA	2	8	1168301	1168308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_021872	TTAA	2	8	1168524	1168531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021872	TTGTT	2	10	1168561	1168570	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021872	TTC	2	6	1168645	1168650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_021872	AGG	2	6	1168681	1168686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021872	GGC	2	6	1168755	1168760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_021872	GT	3	6	1168823	1168828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021872	GT	3	6	1168992	1168997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021872	ATG	2	6	1169017	1169022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021872	CGT	2	6	1169029	1169034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021872	TCC	2	6	1169043	1169048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_021872	CACGA	2	10	1169142	1169151	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4047	NC_021872	GAC	3	9	1169155	1169163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_021872	CAC	2	6	1169168	1169173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_021872	TTC	2	6	1169243	1169248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_021872	CAGAC	2	10	1169476	1169485	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4051	NC_021872	GCC	2	6	1169487	1169492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_021872	TTC	2	6	1169506	1169511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_021872	AT	3	6	1169513	1169518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_021872	CTT	2	6	1169591	1169596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_021872	GCT	2	6	1169697	1169702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_021872	CACG	2	8	1169762	1169769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_021872	TTC	2	6	1169770	1169775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_021872	CAA	2	6	1169778	1169783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_021872	CTT	2	6	1169806	1169811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_021872	CTG	2	6	1169865	1169870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_021872	TC	3	6	1169920	1169925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_021872	CAT	2	6	1169938	1169943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_021872	TTACC	2	10	1169959	1169968	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4064	NC_021872	CAAA	2	8	1170022	1170029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_021872	TGT	2	6	1170044	1170049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021872	CACT	2	8	1170128	1170135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_021872	ATCA	2	8	1170167	1170174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_021872	CCG	2	6	1170213	1170218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_021872	AT	3	6	1170256	1170261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021872	TAT	2	6	1170290	1170295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021872	TCG	2	6	1170364	1170369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_021872	AGC	2	6	1170412	1170417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_021872	TAT	2	6	1170431	1170436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021872	ACAT	2	8	1170438	1170445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_021872	AAG	3	9	1170460	1170468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021872	ATT	2	6	1170474	1170479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021872	TTA	2	6	1170517	1170522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021872	TCA	2	6	1170533	1170538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_021872	CAA	2	6	1170548	1170553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_021872	T	6	6	1170555	1170560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021872	ATT	3	9	1170563	1170571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021872	AAG	2	6	1170600	1170605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021872	TAT	2	6	1170646	1170651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021872	TAT	2	6	1171194	1171199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_021872	AAT	3	9	1177042	1177050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021872	AATA	2	8	1177062	1177069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021872	AT	3	6	1177070	1177075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021872	TGC	2	6	1177106	1177111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_021872	TTTC	2	8	1177115	1177122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_021872	CATTA	2	10	1177185	1177194	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4091	NC_021872	CTTTT	2	10	1177204	1177213	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_021872	AAT	2	6	1178977	1178982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021872	AAT	2	6	1179061	1179066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021872	TGC	2	6	1179079	1179084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_021872	GAA	2	6	1179102	1179107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021872	GCT	2	6	1179146	1179151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_021872	GCT	2	6	1179161	1179166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_021872	ATTG	2	8	1179181	1179188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021872	ATTA	2	8	1179202	1179209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021872	ATT	2	6	1179214	1179219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021872	AGC	3	9	1179220	1179228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_021872	TTG	2	6	1179235	1179240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021872	ATGTA	2	10	1179253	1179262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021872	TGT	2	6	1179286	1179291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021872	CTT	2	6	1179330	1179335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_021872	TG	3	6	1179404	1179409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021872	CAG	2	6	1179435	1179440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_021872	ATT	2	6	1179461	1179466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021872	CAT	2	6	1179486	1179491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_021872	GTAAT	2	10	1179503	1179512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021872	CAA	2	6	1179537	1179542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_021872	TAA	2	6	1179606	1179611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021872	AAC	2	6	1179667	1179672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_021872	AGT	2	6	1179735	1179740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021872	TTG	2	6	1179760	1179765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021872	CCT	2	6	1179896	1179901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_021872	CTG	2	6	1179921	1179926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_021872	AGC	2	6	1179943	1179948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_021872	TAT	2	6	1180002	1180007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021872	GTC	2	6	1180011	1180016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_021872	TGT	2	6	1180030	1180035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021872	AGC	2	6	1180036	1180041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_021872	TAA	2	6	1180059	1180064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021872	GTT	2	6	1180078	1180083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021872	CAA	2	6	1180092	1180097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_021872	GTT	2	6	1180196	1180201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021872	ATA	2	6	1180217	1180222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021872	TAGCAT	2	12	1180278	1180289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4263	NC_021872	A	6	6	1207287	1207292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_021872	A	6	6	1207404	1207409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_021872	TCC	2	6	1208218	1208223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4266	NC_021872	GTAT	2	8	1208271	1208278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_021872	TTA	2	6	1209176	1209181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4269	NC_021872	ACT	2	6	1210509	1210514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4271	NC_021872	T	6	6	1210570	1210575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_021872	A	6	6	1210615	1210620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_021872	TAG	2	6	1210637	1210642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4277	NC_021872	A	6	6	1212357	1212362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4281	NC_021872	CTT	2	6	1212462	1212467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4285	NC_021872	TAAG	2	8	1212639	1212646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4294	NC_021872	TAAT	2	8	1213243	1213250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4306	NC_021872	TA	3	6	1215387	1215392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4307	NC_021872	ATG	2	6	1215423	1215428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4385	NC_021872	ATA	2	6	1234148	1234153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4388	NC_021872	AAT	2	6	1234222	1234227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_021872	ATA	3	9	1234283	1234291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4390	NC_021872	AAT	2	6	1234294	1234299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_021872	CGC	2	6	1234303	1234308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4392	NC_021872	TAACA	2	10	1234309	1234318	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4393	NC_021872	TTG	2	6	1234333	1234338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4395	NC_021872	CTT	2	6	1234383	1234388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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