MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 7488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021872	AAAT	2	8	155372	155379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021872	AGG	2	6	156187	156192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021872	AGG	2	6	158729	158734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021872	CTT	2	6	159455	159460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021872	AG	3	6	159470	159475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021872	TAA	2	6	159485	159490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021872	AGG	2	6	159550	159555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021872	TAG	2	6	160536	160541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021872	GAA	2	6	161758	161763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021872	AAT	2	6	161792	161797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021872	T	6	6	161839	161844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021872	TAGT	2	8	161849	161856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021872	GTT	2	6	161914	161919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021872	GAT	3	9	161920	161928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021872	AAG	2	6	162002	162007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021872	ATT	2	6	162046	162051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021872	ATG	2	6	162061	162066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021872	ATGGA	2	10	162077	162086	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021872	TGA	2	6	162186	162191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021872	TCG	2	6	162249	162254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021872	ATT	2	6	162306	162311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021872	CAG	2	6	162425	162430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021872	CAA	2	6	162454	162459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021872	GAA	2	6	162520	162525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021872	ATG	2	6	162604	162609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021872	GGA	2	6	162611	162616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021872	A	6	6	163770	163775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021872	T	6	6	163800	163805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021872	ATT	2	6	163886	163891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021872	GGA	2	6	163892	163897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021872	AATTA	2	10	165175	165184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021872	GAA	2	6	165217	165222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021872	TTTTA	2	10	165232	165241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021872	A	6	6	166128	166133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021872	TTA	2	6	166159	166164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021872	ATAA	2	8	166167	166174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021872	AGGA	2	8	166207	166214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021872	CTT	2	6	166238	166243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021872	GAG	2	6	166254	166259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021872	CGAC	2	8	166320	166327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
541	NC_021872	AG	4	8	166343	166350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021872	TGT	2	6	166361	166366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021872	TGA	2	6	166399	166404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021872	TGT	2	6	166439	166444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021872	ATTA	2	8	171002	171009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021872	A	6	6	171012	171017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021872	GATT	2	8	171024	171031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_021872	AATAC	2	10	171774	171783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
550	NC_021872	TA	3	6	172456	172461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021872	TAA	2	6	172514	172519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021872	TTTAA	2	10	172527	172536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021872	AAT	2	6	172564	172569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021872	A	6	6	172657	172662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021872	GTT	2	6	172702	172707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021872	TTA	2	6	172764	172769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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558	NC_021872	CAT	2	6	172858	172863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021872	GAC	2	6	172929	172934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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561	NC_021872	TTC	2	6	172990	172995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021872	ATCC	2	8	173036	173043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_021872	GCC	2	6	173053	173058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_021872	TTG	2	6	173059	173064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021872	CAT	2	6	173094	173099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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567	NC_021872	TTTTC	2	10	173141	173150	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
568	NC_021872	CCGA	2	8	173168	173175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
569	NC_021872	TGTAA	2	10	173176	173185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021872	CTT	2	6	173250	173255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021872	TTC	2	6	173287	173292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021872	CTT	2	6	173404	173409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_021872	TGA	2	6	173417	173422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021872	ATC	2	6	173449	173454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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582	NC_021872	ATCC	2	8	173805	173812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_021872	TAG	2	6	173851	173856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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590	NC_021872	GAT	2	6	174045	174050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_021872	ATA	2	6	179673	179678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_021872	AGT	2	6	179827	179832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_021872	ATT	2	6	179905	179910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021872	TATT	2	8	179929	179936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021872	ACA	2	6	179974	179979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021872	TGC	2	6	180006	180011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021872	ATC	2	6	180016	180021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021872	AAT	2	6	180045	180050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021872	TCA	2	6	180109	180114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021872	TAA	2	6	180115	180120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021872	CATTTC	2	12	180172	180183	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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614	NC_021872	CCA	2	6	180311	180316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_021872	AAC	2	6	180415	180420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021872	GCA	2	6	180451	180456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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618	NC_021872	ATT	2	6	180622	180627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021872	GCGG	2	8	180664	180671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
620	NC_021872	TCC	2	6	182259	182264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_021872	ATTTT	2	10	182278	182287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021872	TGAAAA	2	12	182322	182333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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625	NC_021872	T	6	6	184544	184549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021872	A	6	6	184613	184618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021872	GAG	2	6	184644	184649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021872	ATA	2	6	186294	186299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021872	A	6	6	186307	186312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021872	AG	3	6	186314	186319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021872	A	6	6	187657	187662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021872	TG	3	6	187679	187684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021872	GTA	2	6	187731	187736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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635	NC_021872	AAG	2	6	187822	187827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021872	AACT	2	8	187843	187850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_021872	ACT	2	6	187883	187888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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