MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 8568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021840	GAG	2	6	2945312	2945317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_021840	ACA	2	6	2945533	2945538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_021840	AGG	2	6	2945553	2945558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_021840	T	7	7	2945957	2945963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_021840	A	6	6	2946725	2946730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_021840	TTA	2	6	2946750	2946755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_021840	GGGA	2	8	2946793	2946800	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_021840	A	6	6	2948628	2948633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_021840	CTA	2	6	2949852	2949857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_021840	A	6	6	2949877	2949882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_021840	TA	3	6	2950536	2950541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_021840	TCA	2	6	2950571	2950576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_021840	GTT	2	6	2950594	2950599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_021840	AGA	3	9	2950673	2950681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_021840	CAA	2	6	2950745	2950750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_021840	TAATT	2	10	2950761	2950770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_021840	ATTCAA	2	12	2950823	2950834	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8518	NC_021840	AG	3	6	2950847	2950852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_021840	GGC	2	6	2950879	2950884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_021840	CGAA	2	8	2950904	2950911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8521	NC_021840	GGA	2	6	2950913	2950918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_021840	CCTG	2	8	2950971	2950978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8523	NC_021840	GCA	2	6	2951200	2951205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_021840	CGC	2	6	2951247	2951252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8525	NC_021840	GAA	2	6	2951259	2951264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_021840	TGT	2	6	2951286	2951291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_021840	AGA	2	6	2951295	2951300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_021840	CAG	2	6	2951368	2951373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_021840	GC	4	8	2951424	2951431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8530	NC_021840	AGA	2	6	2951509	2951514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_021840	GGA	2	6	2951559	2951564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_021840	CT	3	6	2951584	2951589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_021840	TGC	2	6	2951703	2951708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_021840	GAA	2	6	2951822	2951827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_021840	GGT	2	6	2951896	2951901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_021840	GTC	2	6	2951910	2951915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_021840	TCGTG	2	10	2951919	2951928	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8538	NC_021840	GGA	2	6	2952021	2952026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_021840	ATC	2	6	2952045	2952050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_021840	AC	3	6	2952072	2952077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8541	NC_021840	AC	3	6	2952241	2952246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8542	NC_021840	CAC	2	6	2952256	2952261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8543	NC_021840	AGCC	2	8	2952304	2952311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8544	NC_021840	CCT	2	6	2952383	2952388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8545	NC_021840	AAGGAA	2	12	2952393	2952404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_021840	TTC	2	6	2952420	2952425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_021840	TGTT	2	8	2952465	2952472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_021840	TAT	2	6	2952519	2952524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_021840	ATC	2	6	2952546	2952551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_021840	ATC	2	6	2952582	2952587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_021840	AAC	2	6	2952609	2952614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_021840	GAA	2	6	2952684	2952689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_021840	GGA	2	6	2952849	2952854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_021840	AGAA	2	8	2952857	2952864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_021840	GCG	2	6	2952883	2952888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_021840	AAG	2	6	2952913	2952918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_021840	CTT	2	6	2952924	2952929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_021840	AAAG	2	8	2952961	2952968	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_021840	CGG	2	6	2953057	2953062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_021840	GGA	2	6	2953089	2953094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_021840	AGT	2	6	2953210	2953215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_021840	TTG	2	6	2953274	2953279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_021840	AAGGT	2	10	2953387	2953396	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_021840	TACT	2	8	2953399	2953406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8565	NC_021840	CACG	2	8	2953419	2953426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8566	NC_021840	TC	3	6	2953492	2953497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8567	NC_021840	ACC	2	6	2953669	2953674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8568	NC_021840	AT	3	6	2953689	2953694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.