MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 1175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	AAAG	2	8	101	108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021839	TACT	2	8	540	547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021839	CACG	2	8	561	568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021839	AGTG	2	8	1300	1307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021839	GGAA	2	8	1354	1361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021839	TAGG	2	8	1928	1935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021839	ATGG	2	8	2111	2118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021839	ATCG	2	8	2689	2696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021839	ATAA	2	8	2949	2956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021839	TAGG	2	8	2965	2972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021839	TGAA	2	8	12954	12961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021839	ACAA	2	8	21450	21457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021839	AAGG	2	8	21993	22000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021839	TCTT	2	8	22812	22819	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021839	AAAT	2	8	22846	22853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021839	AATT	2	8	32519	32526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021839	CGAA	2	8	40551	40558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021839	CACT	2	8	42089	42096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021839	ATTT	2	8	43849	43856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021839	TAAA	2	8	43879	43886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021839	TAAA	2	8	50471	50478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021839	TTTG	2	8	50488	50495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021839	ACAT	2	8	52739	52746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021839	CTAT	2	8	58941	58948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021839	ATTA	2	8	68249	68256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021839	TAAA	2	8	71891	71898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021839	GTTA	2	8	71971	71978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021839	TAAT	2	8	73330	73337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021839	AGGC	2	8	73390	73397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021839	TAAA	2	8	73433	73440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021839	CTTA	2	8	74273	74280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021839	TAAA	2	8	74294	74301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021839	GAAG	2	8	79426	79433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021839	ATTT	2	8	81162	81169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021839	GATT	2	8	81309	81316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021839	AGAT	2	8	83069	83076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021839	TTTA	2	8	83082	83089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021839	TAAT	2	8	84002	84009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021839	AAAT	2	8	84039	84046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021839	ATTT	2	8	91122	91129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021839	TAAA	2	8	96100	96107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021839	TAAT	2	8	97849	97856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021839	TTTA	2	8	97875	97882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021839	TGTT	2	8	102744	102751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021839	TTGT	2	8	108931	108938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021839	TTGA	2	8	109929	109936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021839	TAAA	2	8	109965	109972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021839	AAAG	2	8	111893	111900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021839	AAAG	2	8	113089	113096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021839	AGGG	2	8	114142	114149	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021839	AGTT	2	8	114269	114276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021839	CAAA	2	8	121140	121147	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021839	AGAT	2	8	121373	121380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021839	TCAT	2	8	121606	121613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021839	TAAT	2	8	124973	124980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021839	AAAT	2	8	124999	125006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021839	CTTC	2	8	130470	130477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021839	TTAG	2	8	131170	131177	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021839	AATA	2	8	134444	134451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021839	AAGA	2	8	134779	134786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021839	AAAT	2	8	135726	135733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021839	AATT	2	8	143049	143056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021839	ATGG	2	8	150202	150209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021839	TGAT	2	8	151360	151367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021839	TGAA	2	8	151433	151440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021839	TAAT	2	8	151525	151532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021839	CAAA	2	8	151563	151570	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021839	ATTG	2	8	151736	151743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021839	GAAG	2	8	152112	152119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021839	GAAA	2	8	152186	152193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021839	ATTG	2	8	152709	152716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021839	TATT	2	8	152759	152766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021839	GGTT	2	8	152806	152813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021839	TGGG	2	8	152882	152889	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021839	ATTT	2	8	153251	153258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021839	TACT	2	8	153262	153269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021839	AAAT	2	8	159628	159635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021839	TATT	2	8	159644	159651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021839	ACAG	2	8	164034	164041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021839	TGAA	2	8	165250	165257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021839	ATAA	2	8	165605	165612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021839	AGTA	2	8	166107	166114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021839	ATAA	2	8	166124	166131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021839	TAAT	2	8	173341	173348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021839	GCCT	2	8	174941	174948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021839	TTTC	2	8	175787	175794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021839	AAGA	2	8	177112	177119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021839	ATCA	2	8	181315	181322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021839	GTAT	2	8	186026	186033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021839	CAAT	2	8	196169	196176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021839	GTAA	2	8	196194	196201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021839	GAAG	2	8	196210	196217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021839	TATC	2	8	201455	201462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021839	GATT	2	8	202712	202719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021839	ATGA	2	8	205499	205506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021839	TATT	2	8	205562	205569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021839	TTAT	2	8	207239	207246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021839	GATT	2	8	218032	218039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021839	CAAA	2	8	218673	218680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021839	AGGG	2	8	226396	226403	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021839	ATAA	2	8	226451	226458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021839	TACG	2	8	228061	228068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021839	AGGG	2	8	229847	229854	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021839	TACG	2	8	229935	229942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021839	AATA	2	8	231325	231332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021839	ATTA	2	8	231849	231856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021839	GGAA	2	8	233320	233327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021839	GAAC	2	8	233783	233790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021839	TTTA	2	8	240009	240016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021839	CTTC	2	8	241962	241969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021839	TATT	2	8	242342	242349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021839	AATT	2	8	244705	244712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021839	AAGT	2	8	245268	245275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021839	TAAA	2	8	259606	259613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021839	CTAA	2	8	259654	259661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021839	TAAA	2	8	259678	259685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021839	ATTT	2	8	259901	259908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021839	AAGC	2	8	264050	264057	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021839	AAGC	2	8	266255	266262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021839	ATTG	2	8	269877	269884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021839	TAAA	2	8	270073	270080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021839	GATG	2	8	272535	272542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021839	TTAT	2	8	274088	274095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021839	CATT	2	8	274269	274276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021839	TAAA	2	8	274410	274417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021839	ATTG	2	8	279269	279276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021839	GGAA	2	8	279352	279359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021839	TGAA	2	8	279776	279783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021839	GGAT	2	8	279887	279894	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021839	AAAT	2	8	281992	281999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021839	TTGG	2	8	283839	283846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021839	GTTA	2	8	293511	293518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021839	AGGG	2	8	301418	301425	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021839	TACT	2	8	304051	304058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021839	AAAT	2	8	304192	304199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021839	ATAA	2	8	306653	306660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021839	TTTA	2	8	306848	306855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021839	AGTT	2	8	306939	306946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021839	GAAT	2	8	308851	308858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021839	AAAT	2	8	310922	310929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021839	ATGG	2	8	311920	311927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021839	GTTT	2	8	314076	314083	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021839	CTTA	2	8	316500	316507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021839	CTTT	2	8	328842	328849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021839	TCCT	2	8	336688	336695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021839	TATT	2	8	344117	344124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021839	CAAA	2	8	347046	347053	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021839	AGAA	2	8	350241	350248	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021839	CTTA	2	8	351484	351491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021839	AAAT	2	8	355845	355852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021839	AGAA	2	8	356949	356956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021839	AACG	2	8	369071	369078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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