MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502

Total Repeats: 8779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021838	CTTT	2	8	42	49	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021838	ATA	2	6	86	91	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021838	TA	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021838	TCG	2	6	109	114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021838	C	6	6	245	250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_021838	CAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021838	CTT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021838	AT	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021838	CAA	3	9	397	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021838	TAA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021838	CTT	2	6	2957	2962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021838	T	6	6	2965	2970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021838	TA	3	6	2973	2978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021838	TAAT	2	8	3008	3015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021838	ATTT	2	8	3136	3143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021838	ATC	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021838	TAA	2	6	3167	3172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021838	T	7	7	3185	3191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021838	T	7	7	3707	3713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021838	TCC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021838	TC	3	6	5999	6004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021838	TCC	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021838	TC	3	6	6604	6609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021838	T	6	6	6655	6660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021838	T	6	6	10968	10973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021838	GC	3	6	11023	11028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021838	T	6	6	11043	11048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021838	TCG	2	6	11060	11065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021838	ATC	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021838	AAATTA	2	12	11385	11396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021838	TAATGC	2	12	11425	11436	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021838	GCT	2	6	11438	11443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021838	T	7	7	12249	12255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021838	AAC	2	6	12266	12271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021838	TA	3	6	12279	12284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021838	CCT	2	6	13593	13598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021838	ATT	2	6	14715	14720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021838	GGT	2	6	14731	14736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021838	T	7	7	15231	15237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021838	ACTTG	2	10	15249	15258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021838	ATT	2	6	15286	15291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021838	TG	3	6	15297	15302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021838	AT	3	6	15311	15316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021838	TATAA	2	10	15332	15341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021838	AAC	2	6	15360	15365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021838	GA	3	6	16575	16580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021838	AAAG	2	8	17624	17631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021838	CTTTT	2	10	17640	17649	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021838	CTG	2	6	17678	17683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021838	AAGT	2	8	17707	17714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021838	T	7	7	17725	17731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021838	ACA	2	6	17800	17805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021838	T	7	7	17814	17820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021838	AAG	2	6	17823	17828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021838	CTTTT	2	10	18753	18762	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021838	A	7	7	18767	18773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021838	ATA	2	6	20654	20659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021838	TCACT	2	10	21039	21048	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_021838	AAT	2	6	21071	21076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021838	CTC	2	6	24712	24717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021838	TTTC	2	8	24742	24749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021838	TTCA	2	8	24763	24770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021838	CA	3	6	24779	24784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021838	ATTC	2	8	24792	24799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021838	ATT	2	6	24835	24840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021838	AGA	2	6	24891	24896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021838	AGG	2	6	24910	24915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021838	CCT	2	6	26698	26703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021838	ATTT	2	8	26714	26721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021838	A	6	6	26728	26733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021838	TAT	2	6	28848	28853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021838	AT	3	6	28852	28857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021838	CTTT	2	8	28865	28872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021838	A	6	6	28881	28886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021838	CTT	2	6	28897	28902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021838	AGGA	2	8	28906	28913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021838	T	6	6	29642	29647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021838	A	7	7	29661	29667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021838	TC	3	6	33762	33767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021838	CCCT	2	8	34497	34504	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_021838	CTC	2	6	35879	35884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021838	ACTT	2	8	36459	36466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021838	CTATA	2	10	36483	36492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021838	A	7	7	36519	36525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021838	TAATAC	2	12	36543	36554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021838	ATT	2	6	36571	36576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021838	TAA	2	6	36596	36601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021838	A	6	6	36644	36649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021838	T	6	6	37592	37597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021838	TTC	2	6	39603	39608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021838	A	7	7	39624	39630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021838	T	6	6	42550	42555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021838	GAAAA	2	10	42580	42589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021838	TCA	2	6	42593	42598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021838	A	6	6	42598	42603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021838	TGG	2	6	42622	42627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021838	TAA	2	6	42629	42634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021838	CCT	2	6	43339	43344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_021838	TC	3	6	43366	43371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021838	ATA	2	6	43378	43383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021838	A	9	9	43383	43391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021838	TCT	2	6	43418	43423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021838	CTT	2	6	43426	43431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021838	TTA	2	6	43466	43471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021838	A	6	6	43508	43513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021838	TCC	2	6	44803	44808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021838	T	6	6	44835	44840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021838	TAA	2	6	45733	45738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021838	A	6	6	45760	45765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021838	TTA	2	6	48591	48596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021838	CTT	2	6	48602	48607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021838	TCC	2	6	49102	49107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021838	ATT	2	6	49116	49121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021838	TA	3	6	49155	49160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021838	T	8	8	49172	49179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021838	T	6	6	49192	49197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021838	A	6	6	49209	49214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021838	AATG	2	8	49219	49226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021838	AAC	2	6	49243	49248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021838	A	7	7	49284	49290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021838	AAT	2	6	49295	49300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021838	AAAC	2	8	49307	49314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021838	CAA	2	6	49336	49341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021838	AGG	2	6	49352	49357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021838	TGA	2	6	49376	49381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021838	A	7	7	49388	49394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021838	ATTA	2	8	49406	49413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021838	CAT	2	6	49416	49421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021838	CAAA	2	8	49458	49465	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021838	A	6	6	49463	49468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021838	TAC	2	6	49477	49482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021838	A	6	6	51014	51019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021838	ACA	2	6	53968	53973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021838	CTT	2	6	53982	53987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021838	TTAAT	2	10	53994	54003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021838	TA	3	6	54027	54032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021838	T	7	7	54035	54041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021838	T	6	6	54062	54067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021838	T	6	6	54136	54141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021838	ATT	2	6	54187	54192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021838	T	6	6	54191	54196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021838	TTTA	2	8	54203	54210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021838	A	6	6	54246	54251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021838	CGG	2	6	54291	54296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021838	ATA	2	6	54380	54385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021838	ATTA	2	8	54403	54410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021838	ACT	2	6	54571	54576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021838	CAA	2	6	54657	54662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021838	GAT	2	6	54692	54697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021838	ATT	2	6	54762	54767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021838	AT	3	6	54771	54776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021838	TGG	2	6	54857	54862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_021838	AACG	2	8	113696	113703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
445	NC_021838	A	6	6	113722	113727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_021838	A	6	6	114937	114942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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