MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021837	CAAAA	2	10	700	709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021837	GCTAT	2	10	2271	2280	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021837	AAATT	2	10	2725	2734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021837	ATATT	2	10	21397	21406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021837	TATAA	2	10	23302	23311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021837	GATTG	2	10	34672	34681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021837	ATTGT	2	10	35175	35184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021837	CGTTT	2	10	39516	39525	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021837	CATAG	2	10	41022	41031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021837	AAAAT	2	10	41186	41195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021837	AAGAA	2	10	50555	50564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021837	AATAA	2	10	54929	54938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021837	GATAA	2	10	65257	65266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021837	AGGAA	2	10	72342	72351	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021837	TTTCC	2	10	79724	79733	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021837	CCAAA	2	10	80870	80879	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021837	CTATA	2	10	84110	84119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021837	CACCT	2	10	87301	87310	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_021837	CTTTC	2	10	95154	95163	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021837	AATTT	2	10	118229	118238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021837	TTGTT	2	10	138213	138222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021837	ATCAC	2	10	139642	139651	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021837	AATTT	2	10	152807	152816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021837	TCATT	2	10	154374	154383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021837	AATCT	2	10	162377	162386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021837	ATTTC	2	10	169869	169878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021837	AGACT	2	10	184409	184418	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021837	ATCTA	2	10	196185	196194	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021837	CAAAT	2	10	196225	196234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021837	CGAAT	2	10	198853	198862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021837	TTTAT	2	10	212697	212706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021837	CTCTC	2	10	215386	215395	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_021837	AACAA	2	10	257825	257834	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021837	ATGCC	2	10	258906	258915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021837	TTACC	2	10	276195	276204	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021837	CACGA	2	10	277665	277674	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021837	AATTA	2	10	278824	278833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021837	TTACC	2	10	282218	282227	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021837	CACGA	2	10	283688	283697	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_021837	AATTA	2	10	284847	284856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021837	CTATT	2	10	286733	286742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021837	TATCA	2	10	289253	289262	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021837	TGTTT	2	10	289730	289739	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021837	TTTTC	2	10	290026	290035	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021837	TTTTC	2	10	290229	290238	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021837	AAGAA	2	10	290376	290385	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021837	CGGCT	2	10	298353	298362	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021837	CACTC	2	10	306531	306540	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_021837	TTTTG	2	10	306609	306618	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021837	TTATA	2	10	314658	314667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021837	TTTTG	2	10	322397	322406	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021837	GACAA	2	10	322763	322772	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021837	TCTAT	2	10	328289	328298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021837	TTTAG	2	10	354251	354260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021837	CATAT	2	10	364885	364894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021837	TTCTA	2	10	365968	365977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021837	CTTAT	2	10	371864	371873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021837	ACTTT	2	10	397142	397151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021837	CAGTA	2	10	399381	399390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021837	TATGA	2	10	411647	411656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021837	TTGTT	2	10	412910	412919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021837	TCCGC	2	10	417454	417463	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_021837	TAAAA	2	10	431989	431998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021837	TAAAA	2	10	450382	450391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021837	ATGCT	2	10	450623	450632	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021837	CATAA	2	10	471535	471544	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021837	ACCAT	2	10	476780	476789	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021837	CTTTT	2	10	478996	479005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021837	CAAGT	2	10	479033	479042	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021837	ATGTA	2	10	526023	526032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021837	ATATG	2	10	527012	527021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021837	AGAAC	2	10	557039	557048	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021837	GATTT	2	10	591009	591018	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021837	TAGAA	2	10	592024	592033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021837	GAATC	2	10	599913	599922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021837	ATTAT	2	10	600048	600057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021837	GCATT	2	10	600724	600733	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021837	GCACC	2	10	601402	601411	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_021837	AATAT	2	10	648148	648157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021837	ATTTT	2	10	660312	660321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021837	TAATT	2	10	660986	660995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021837	CTATT	2	10	665189	665198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021837	CTATA	2	10	666230	666239	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021837	ATCCA	2	10	672417	672426	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021837	AGCCC	2	10	681316	681325	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_021837	AAAAG	2	10	682924	682933	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021837	CTTAT	2	10	684991	685000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021837	TTTAA	2	10	698905	698914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021837	GAAAC	2	10	706992	707001	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021837	ATTTT	2	10	737255	737264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021837	AAAAT	2	10	756863	756872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021837	TCTAA	2	10	756958	756967	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021837	TTGTA	2	10	757179	757188	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021837	TCTGG	2	10	759452	759461	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021837	ATTAG	2	10	772972	772981	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021837	ACCTG	2	10	773085	773094	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_021837	AAATA	2	10	783605	783614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021837	TGGAT	2	10	784379	784388	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021837	CCTTG	2	10	793106	793115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_021837	AACGA	2	10	793152	793161	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021837	TAATT	2	10	797536	797545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021837	TCGTG	2	10	798695	798704	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021837	AAGGT	2	10	800414	800423	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021837	GGGTG	2	10	803109	803118	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021837	TAAAA	2	10	806515	806524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021837	TATAA	2	10	806931	806940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021837	CTAAT	2	10	817639	817648	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021837	TTCCA	2	10	822436	822445	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021837	ATGAT	2	10	823471	823480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021837	TATAA	2	10	832640	832649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021837	ATAAA	2	10	835801	835810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021837	GACTT	2	10	835811	835820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021837	TATTT	2	10	835840	835849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021837	GTTAT	2	10	842991	843000	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021837	CTTTC	2	10	851102	851111	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_021837	CAAAC	2	10	862956	862965	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021837	TTTTA	2	10	882035	882044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021837	AAAGC	2	10	882049	882058	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_021837	TTGTT	2	10	884047	884056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021837	ACAGC	2	10	889730	889739	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_021837	ATGGT	2	10	895067	895076	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021837	TATGA	2	10	896515	896524	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021837	AAGAT	2	10	899266	899275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021837	TATTT	2	10	901895	901904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021837	ACGAA	2	10	901905	901914	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021837	TTTCC	2	10	907232	907241	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021837	ATAAA	2	10	909249	909258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021837	TTTGC	2	10	909386	909395	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021837	TAATT	2	10	938256	938265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021837	TTCGT	2	10	938358	938367	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021837	TTTTA	2	10	938401	938410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021837	TAAAA	2	10	944344	944353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021837	AAAAC	2	10	968013	968022	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021837	AAATA	2	10	976582	976591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021837	CTTAT	2	10	976599	976608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021837	GTTAC	2	10	990933	990942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021837	AAATA	2	10	991046	991055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021837	CATAA	2	10	998890	998899	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021837	AAATT	2	10	1004221	1004230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021837	GTTTC	2	10	1006741	1006750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021837	AACTT	2	10	1021532	1021541	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021837	TAATT	2	10	1032889	1032898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021837	TCGTG	2	10	1034048	1034057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021837	AAGGT	2	10	1035767	1035776	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021837	TTTTC	2	10	1051188	1051197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021837	TATAG	2	10	1057291	1057300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021837	TAAAA	2	10	1067059	1067068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.