MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 4213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021830	CAC	2	6	78	83	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021830	CCT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021830	TTC	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021830	TAT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021830	ATC	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021830	ATC	2	6	422	427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021830	AAC	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021830	GAA	2	6	524	529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021830	GGA	2	6	689	694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021830	GCG	2	6	723	728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021830	AAG	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021830	CTT	2	6	763	768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021830	CGG	2	6	897	902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021830	GGA	2	6	929	934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021830	AGT	2	6	1050	1055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021830	TTG	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021830	ACC	2	6	1512	1517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021830	AGC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021830	TGG	2	6	1752	1757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021830	AAG	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021830	ACA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021830	AGT	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021830	GAG	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021830	CGG	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021830	GAG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021830	TGG	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021830	TAC	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021830	CCT	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021830	GGT	2	6	2905	2910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021830	TCG	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021830	CGT	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021830	GAG	2	6	3149	3154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021830	GTT	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021830	TTC	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021830	GAT	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021830	TCT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021830	CAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021830	ATA	2	6	3785	3790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021830	AGT	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021830	ATT	2	6	4160	4165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021830	CTC	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021830	TTA	2	6	4249	4254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021830	TAT	2	6	4343	4348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021830	AGG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021830	CCA	2	6	4419	4424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021830	ATT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021830	TGC	2	6	4481	4486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021830	GAA	3	9	4497	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021830	AGA	3	9	4531	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021830	CAA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021830	GGC	2	6	4737	4742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021830	GGA	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021830	GCA	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021830	CGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021830	GAA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021830	TGT	2	6	5144	5149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021830	AGA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021830	CAG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021830	AGA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021830	GGA	2	6	5417	5422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021830	TGC	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021830	GAA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021830	GGT	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021830	GTC	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021830	GGA	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021830	ATC	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021830	CAC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021830	CCT	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021830	TTC	2	6	6279	6284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021830	TAT	2	6	6396	6401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021830	ATC	2	6	6423	6428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021830	ATC	2	6	6459	6464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021830	AAC	2	6	6486	6491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021830	GAA	2	6	6561	6566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021830	GGA	2	6	6726	6731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021830	GCG	2	6	6760	6765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021830	AAG	2	6	6790	6795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021830	CTT	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021830	CGG	2	6	6934	6939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021830	GGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021830	AGT	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021830	TTG	2	6	7151	7156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021830	ACC	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021830	AGC	2	6	7629	7634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021830	TGG	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021830	AAG	2	6	7831	7836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021830	ACA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021830	AGT	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021830	GAG	2	6	8188	8193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021830	CGG	2	6	8448	8453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021830	GAG	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021830	TGG	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021830	TAC	2	6	8718	8723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021830	CCT	2	6	8806	8811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021830	GGT	2	6	8942	8947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021830	TCG	2	6	9057	9062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021830	CGT	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021830	GAG	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021830	GTT	2	6	9240	9245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021830	TTC	2	6	9338	9343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021830	GAT	2	6	9364	9369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021830	TCT	2	6	9478	9483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021830	CAA	2	6	9507	9512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021830	ATT	2	6	9655	9660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021830	TGA	2	6	10246	10251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021830	AGG	2	6	11806	11811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021830	ACA	2	6	11814	11819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021830	TGA	2	6	14360	14365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021830	GAT	2	6	14384	14389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021830	AGG	2	6	15922	15927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021830	AGG	2	6	17014	17019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021830	AAT	2	6	18204	18209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021830	TGA	2	6	19796	19801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021830	GAA	2	6	19805	19810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021830	AGG	2	6	20073	20078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021830	CAA	2	6	20079	20084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021830	AGA	2	6	23851	23856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021830	AGG	2	6	25034	25039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021830	GGC	2	6	25042	25047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021830	TGC	2	6	25058	25063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021830	ATT	2	6	25624	25629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021830	GTT	2	6	25637	25642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021830	TTA	2	6	25643	25648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021830	AAT	2	6	26133	26138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021830	AGG	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021830	AGG	2	6	26711	26716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021830	TTG	2	6	27640	27645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021830	TAT	2	6	28219	28224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021830	GGA	2	6	28226	28231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021830	AGA	2	6	29461	29466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021830	AGC	2	6	30884	30889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021830	TGC	2	6	30903	30908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021830	TTC	2	6	30909	30914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021830	TGT	2	6	30919	30924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021830	AGT	2	6	30928	30933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021830	ATA	2	6	30974	30979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021830	TTA	2	6	32023	32028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021830	ATT	2	6	32068	32073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021830	CTT	2	6	39077	39082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021830	AGG	2	6	42988	42993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021830	AGA	2	6	47264	47269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021830	TAA	2	6	48848	48853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021830	TGT	2	6	48898	48903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021830	TTG	2	6	53319	53324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_021830	CGA	2	6	245605	245610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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416	NC_021830	ATA	2	6	245842	245847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_021830	AAT	2	6	245859	245864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_021830	ATA	3	9	246153	246161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_021830	AAT	2	6	246648	246653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_021830	AGG	2	6	246778	246783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_021830	AGG	2	6	248907	248912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_021830	AAT	2	6	249324	249329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_021830	ATT	2	6	249440	249445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_021830	ATT	2	6	249936	249941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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