MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 8802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021830	TAT	2	6	1423606	1423611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021830	TCC	2	6	1425362	1425367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_021830	GAAA	2	8	1425385	1425392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021830	TGC	2	6	1425407	1425412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_021830	GTA	2	6	1425449	1425454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021830	TTTTA	2	10	1425491	1425500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021830	A	6	6	1425534	1425539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021830	TCTAT	2	10	1425558	1425567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4009	NC_021830	ACAAA	2	10	1425569	1425578	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4010	NC_021830	ATT	2	6	1425618	1425623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021830	CTA	2	6	1426142	1426147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021830	ACTAT	2	10	1426151	1426160	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_021830	ATGA	2	8	1426194	1426201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_021830	GT	3	6	1426202	1426207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021830	CGG	2	6	1426248	1426253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_021830	GTTT	2	8	1426308	1426315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021830	AGG	2	6	1426335	1426340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021830	T	7	7	1427000	1427006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021830	A	6	6	1427013	1427018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021830	A	6	6	1428341	1428346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021830	ATTA	2	8	1428381	1428388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021830	ACC	2	6	1428396	1428401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_021830	A	6	6	1428428	1428433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021830	CTA	2	6	1428505	1428510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_021830	CCA	2	6	1428515	1428520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_021830	CT	3	6	1428529	1428534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_021830	GAATAA	2	12	1428537	1428548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021830	ACT	2	6	1428552	1428557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_021830	TACA	2	8	1428593	1428600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_021830	ATT	2	6	1429661	1429666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021830	CTAC	2	8	1429676	1429683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_021830	GTAAAC	2	12	1429688	1429699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4033	NC_021830	CCTT	2	8	1429707	1429714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_021830	TAA	2	6	1429715	1429720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021830	T	6	6	1429730	1429735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021830	ATTT	2	8	1429767	1429774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021830	ATT	2	6	1429790	1429795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021830	GTT	2	6	1429825	1429830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021830	CAAAA	2	10	1429836	1429845	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4040	NC_021830	A	6	6	1429842	1429847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021830	T	6	6	1429864	1429869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021830	ATT	2	6	1430993	1430998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021830	AAT	2	6	1431073	1431078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021830	T	6	6	1431129	1431134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021830	TAA	2	6	1431137	1431142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021830	A	7	7	1431141	1431147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021830	T	6	6	1431164	1431169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021830	TCT	2	6	1432237	1432242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_021830	A	6	6	1432266	1432271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021830	TAA	2	6	1432319	1432324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021830	GAAA	2	8	1432325	1432332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021830	TGT	2	6	1432343	1432348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021830	GCT	2	6	1432391	1432396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_021830	T	6	6	1433580	1433585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021830	ATTA	2	8	1434147	1434154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021830	AT	3	6	1434179	1434184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021830	TTTA	2	8	1434214	1434221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021830	ACAA	2	8	1434230	1434237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_021830	A	6	6	1434239	1434244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021830	TTTA	2	8	1434267	1434274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021830	A	8	8	1435662	1435669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021830	CAT	2	6	1435733	1435738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_021830	AAT	2	6	1435782	1435787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_021830	TTA	2	6	1435796	1435801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021830	ATT	2	6	1435869	1435874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021830	TTAGT	2	10	1435898	1435907	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021830	AATTT	2	10	1438283	1438292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021830	ACAAAA	2	12	1438312	1438323	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4069	NC_021830	T	6	6	1438352	1438357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021830	TAA	2	6	1438516	1438521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021830	A	6	6	1438531	1438536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021830	AAC	2	6	1440394	1440399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_021830	A	6	6	1440425	1440430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021830	AAC	2	6	1440636	1440641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_021830	CAA	2	6	1440646	1440651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021830	TAT	2	6	1440665	1440670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021830	TAA	2	6	1441746	1441751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021830	TAT	2	6	1441779	1441784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021830	ATA	2	6	1441790	1441795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021830	CGCT	2	8	1441804	1441811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_021830	TC	3	6	1441817	1441822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_021830	GTA	2	6	1441868	1441873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021830	GTA	2	6	1441895	1441900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021830	GGA	2	6	1441931	1441936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_021830	AAAATA	2	12	1442631	1442642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_021830	TAAAAA	2	12	1443541	1443552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_021830	TTA	2	6	1445034	1445039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021830	AGTCA	2	10	1445126	1445135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4091	NC_021830	T	7	7	1445156	1445162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021830	TTTA	2	8	1445173	1445180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021830	A	7	7	1445184	1445190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021830	AC	3	6	1445211	1445216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4098	NC_021830	A	6	6	1447283	1447288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021830	TA	3	6	1447291	1447296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021830	A	7	7	1447322	1447328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021830	A	6	6	1447336	1447341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021830	TC	3	6	1448234	1448239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_021830	GCA	2	6	1448311	1448316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_021830	T	6	6	1448322	1448327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4107	NC_021830	CCT	2	6	1450251	1450256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_021830	AGG	2	6	1450329	1450334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021830	A	6	6	1451177	1451182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021830	TCC	2	6	1451183	1451188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_021830	AG	3	6	1451198	1451203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021830	T	7	7	1451206	1451212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021830	TA	3	6	1453514	1453519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021830	TTTAC	2	10	1453526	1453535	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4115	NC_021830	A	9	9	1453549	1453557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021830	AAAT	2	8	1453568	1453575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021830	GATT	2	8	1455229	1455236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021830	T	6	6	1455235	1455240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021830	GTCT	2	8	1455248	1455255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_021830	ACT	3	9	1455288	1455296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4122	NC_021830	AGT	2	6	1455798	1455803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4124	NC_021830	CTT	2	6	1462106	1462111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_021830	CTA	2	6	1462114	1462119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_021830	A	8	8	1462124	1462131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021830	TATT	2	8	1462313	1462320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021830	CCA	2	6	1462326	1462331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_021830	CT	3	6	1462340	1462345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_021830	A	6	6	1462401	1462406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021830	CT	3	6	1462411	1462416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_021830	GA	3	6	1462447	1462452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021830	ACC	2	6	1462461	1462466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_021830	ATCC	2	8	1462495	1462502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_021830	CTA	2	6	1462552	1462557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_021830	TCAGA	2	10	1462569	1462578	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4137	NC_021830	CAT	2	6	1462596	1462601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4141	NC_021830	TCA	2	6	1462664	1462669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4142	NC_021830	T	6	6	1462679	1462684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_021830	ACT	2	6	1462733	1462738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4145	NC_021830	A	6	6	1462783	1462788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_021830	AT	3	6	1462805	1462810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_021830	TAT	2	6	1462841	1462846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_021830	AATA	2	8	1462847	1462854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4156	NC_021830	AGA	2	6	1465818	1465823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4161	NC_021830	A	7	7	1466398	1466404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_021830	TTTA	2	8	1496297	1496304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_021830	A	7	7	1496316	1496322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_021830	TCCAT	2	10	1497225	1497234	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4261	NC_021830	GCCA	2	8	1497275	1497282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4264	NC_021830	GA	3	6	1499797	1499802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_021830	ACC	2	6	1499818	1499823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4270	NC_021830	AATG	2	8	1500080	1500087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_021830	TA	3	6	1503562	1503567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_021830	T	7	7	1503583	1503589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_021830	TATCA	2	10	1503599	1503608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4302	NC_021830	AG	3	6	1527902	1527907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4303	NC_021830	TC	3	6	1527950	1527955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4393	NC_021830	AACA	2	8	1534647	1534654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4394	NC_021830	AGA	2	6	1534693	1534698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4400	NC_021830	GT	3	6	1535042	1535047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_021830	ATG	2	6	1535067	1535072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4403	NC_021830	CACGA	2	10	1535191	1535200	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4404	NC_021830	GAC	2	6	1535204	1535209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4405	NC_021830	CAC	2	6	1535217	1535222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4406	NC_021830	TTC	2	6	1535292	1535297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4407	NC_021830	GCA	2	6	1535411	1535416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4434	NC_021830	AT	3	6	1536640	1536645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4437	NC_021830	A	6	6	1536692	1536697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4438	NC_021830	A	7	7	1536701	1536707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4439	NC_021830	CTAG	2	8	1536711	1536718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4443	NC_021830	T	7	7	1538248	1538254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_021830	T	6	6	1538276	1538281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4445	NC_021830	T	6	6	1538298	1538303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4451	NC_021830	A	6	6	1541512	1541517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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