MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 1657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021829	TAGT	2	8	124	131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021829	ACAA	2	8	292	299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021829	ATTC	2	8	2172	2179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021829	ATAA	2	8	2266	2273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021829	ATGC	2	8	4214	4221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021829	GCTA	2	8	4258	4265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021829	CCTC	2	8	5031	5038	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_021829	TGCT	2	8	10722	10729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021829	AATG	2	8	13079	13086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021829	CTTT	2	8	18528	18535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021829	CAAA	2	8	22377	22384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021829	TTAA	2	8	24249	24256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021829	AATT	2	8	31985	31992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021829	TAAA	2	8	36631	36638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021829	AGAT	2	8	36649	36656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021829	TATT	2	8	36851	36858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021829	AGTG	2	8	37069	37076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021829	CATG	2	8	37337	37344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021829	ATTT	2	8	37619	37626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021829	TTGT	2	8	38599	38606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021829	ATGT	2	8	39677	39684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021829	TTCT	2	8	43431	43438	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021829	TAAT	2	8	43522	43529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021829	CAAA	2	8	44882	44889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021829	ATTT	2	8	45313	45320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021829	TACT	2	8	46574	46581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021829	AAAG	2	8	48624	48631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021829	ATTT	2	8	48642	48649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021829	ATAA	2	8	53338	53345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021829	TTTC	2	8	56990	56997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021829	TTAG	2	8	59186	59193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021829	ATTA	2	8	59272	59279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021829	AGAA	2	8	59312	59319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021829	ATTC	2	8	59434	59441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021829	AGAA	2	8	70433	70440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021829	CCAG	2	8	72713	72720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021829	ATTA	2	8	73177	73184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021829	TGGT	2	8	73685	73692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021829	GACT	2	8	73774	73781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021829	TGTT	2	8	74773	74780	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021829	CTTT	2	8	78290	78297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021829	ATTA	2	8	80424	80431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021829	AAAC	2	8	82779	82786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021829	CTTT	2	8	94284	94291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021829	ATTT	2	8	94529	94536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021829	TTTC	2	8	98838	98845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021829	AAAT	2	8	98855	98862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021829	TTTC	2	8	98906	98913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021829	TTTC	2	8	99354	99361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021829	AAAG	2	8	99961	99968	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021829	AACT	2	8	103087	103094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021829	AAGG	2	8	105456	105463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021829	TAGA	2	8	112930	112937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021829	AAAT	2	8	114165	114172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021829	TAAT	2	8	114417	114424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021829	TGTA	2	8	115601	115608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021829	AAAT	2	8	117192	117199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021829	CAAG	2	8	117806	117813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021829	TTAG	2	8	118077	118084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021829	CTAA	2	8	118564	118571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021829	ATTC	2	8	120230	120237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021829	TAAC	2	8	123004	123011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021829	AGGG	2	8	124732	124739	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021829	ACGG	2	8	127951	127958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021829	AAAT	2	8	129092	129099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021829	TTCT	2	8	129110	129117	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021829	AGTA	3	12	131263	131274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021829	ACTA	2	8	134229	134236	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021829	CTCC	2	8	137551	137558	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_021829	AATA	2	8	140336	140343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021829	TGTT	2	8	142405	142412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021829	AAAT	2	8	142820	142827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021829	TAAT	2	8	142875	142882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021829	CTTA	2	8	142915	142922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021829	CAGA	2	8	146370	146377	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021829	CTTT	2	8	147562	147569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021829	ATTT	2	8	147811	147818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021829	CTAT	2	8	150418	150425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021829	CTTC	2	8	154335	154342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021829	GAAA	2	8	156427	156434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021829	GAAA	2	8	156496	156503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021829	AAGG	2	8	157939	157946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021829	TTTG	2	8	162055	162062	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021829	AGTA	2	8	166222	166229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021829	GCTT	2	8	168583	168590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021829	TCCC	2	8	177272	177279	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_021829	ATTC	2	8	178321	178328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021829	TTTA	2	8	178346	178353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021829	TTGC	2	8	187406	187413	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021829	ACTT	2	8	187673	187680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021829	GCTA	2	8	189451	189458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021829	CTTC	2	8	190307	190314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021829	AGAA	2	8	192620	192627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021829	ATTC	2	8	197703	197710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021829	CAGG	2	8	197868	197875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021829	TATT	2	8	200324	200331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021829	TAAT	2	8	200860	200867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021829	TTTC	2	8	201510	201517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021829	ATTA	2	8	201649	201656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021829	CATA	2	8	201876	201883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021829	CAGG	2	8	202058	202065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021829	TTAT	2	8	206540	206547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021829	CTAA	2	8	208930	208937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021829	GTAA	2	8	212577	212584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021829	TCTA	2	8	215655	215662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021829	TCAT	2	8	218341	218348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021829	ATCT	2	8	219783	219790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021829	CTTG	2	8	219806	219813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021829	AATC	2	8	230314	230321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021829	TTTA	2	8	230342	230349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021829	AATC	2	8	230587	230594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021829	TACA	2	8	230749	230756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021829	ATGA	2	8	230834	230841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021829	TCTA	2	8	231210	231217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021829	TTGT	2	8	232873	232880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021829	AATA	2	8	241711	241718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021829	CTAA	2	8	247502	247509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021829	ATTA	2	8	248785	248792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021829	TTAA	2	8	253346	253353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021829	ATTT	2	8	256034	256041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021829	CTTT	2	8	256438	256445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021829	GTTT	2	8	256475	256482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021829	TCTT	2	8	256914	256921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021829	GAAT	2	8	263106	263113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021829	AGAA	2	8	263377	263384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021829	AACA	2	8	266170	266177	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021829	AATA	2	8	266212	266219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021829	ATTA	2	8	268142	268149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021829	ATAA	2	8	268519	268526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021829	AGCC	2	8	268642	268649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021829	AAAG	2	8	269027	269034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021829	TTGC	2	8	269224	269231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021829	TCCA	2	8	269315	269322	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021829	AAAT	2	8	269476	269483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021829	TTCT	2	8	269553	269560	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021829	AGTA	2	8	272177	272184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021829	TAAT	2	8	272220	272227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021829	TGCT	2	8	272440	272447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021829	TTGT	2	8	272477	272484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021829	TGTA	2	8	274919	274926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021829	CTTT	2	8	275529	275536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021829	TCCC	2	8	275599	275606	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_021829	TAAT	2	8	275800	275807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021829	ACTA	2	8	275826	275833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021829	ATTC	2	8	279165	279172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021829	TTTG	2	8	284691	284698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021829	TACT	2	8	293470	293477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021829	AAAG	2	8	295277	295284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021829	TTGT	2	8	296245	296252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021829	CGAG	2	8	297908	297915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021829	TAAA	2	8	300874	300881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021829	TAAA	2	8	303003	303010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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