MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 12028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021829	GCT	2	6	269723	269728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021829	AAT	2	6	269816	269821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021829	GCT	2	6	271516	271521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021829	TAA	2	6	271570	271575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021829	A	6	6	271578	271583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021829	C	6	6	271602	271607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1007	NC_021829	A	6	6	271648	271653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021829	AGG	2	6	271672	271677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021829	TGT	2	6	272168	272173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021829	AGTA	2	8	272177	272184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021829	AAT	2	6	272203	272208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021829	TAAT	2	8	272220	272227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021829	T	8	8	272278	272285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021829	TGCT	2	8	272440	272447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_021829	T	7	7	272455	272461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021829	ATG	2	6	272467	272472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021829	TTGT	2	8	272477	272484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021829	TAA	2	6	272526	272531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021829	T	7	7	272546	272552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021829	GCT	2	6	272770	272775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021829	GAT	2	6	272784	272789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021829	CTA	2	6	272792	272797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021829	TAA	2	6	272802	272807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021829	ATT	2	6	272842	272847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021829	AT	3	6	272853	272858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021829	ATT	2	6	273033	273038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021829	ATT	2	6	273094	273099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021829	T	8	8	273122	273129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021829	ATA	2	6	273898	273903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021829	TA	4	8	273935	273942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021829	A	7	7	273948	273954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021829	TA	3	6	274888	274893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021829	TGTA	2	8	274919	274926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021829	TAG	2	6	274960	274965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021829	A	7	7	275027	275033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021829	AT	3	6	275047	275052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021829	TTCCT	2	10	275357	275366	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_021829	CTG	2	6	275432	275437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021829	CTTT	2	8	275529	275536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_021829	T	7	7	275534	275540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021829	TA	3	6	275546	275551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021829	TCCC	2	8	275599	275606	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1043	NC_021829	AT	3	6	275634	275639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021829	TA	3	6	275687	275692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021829	TAC	2	6	275710	275715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_021829	T	7	7	275740	275746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021829	TAAT	2	8	275800	275807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021829	ACTA	2	8	275826	275833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_021829	AATTT	2	10	275880	275889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021829	T	6	6	276936	276941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021829	AAAAC	2	10	276957	276966	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1052	NC_021829	ATA	2	6	276993	276998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021829	AGG	2	6	277016	277021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021829	CAA	2	6	279049	279054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021829	TCT	2	6	279098	279103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021829	A	7	7	279107	279113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021829	TAG	2	6	279126	279131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021829	ATTC	2	8	279165	279172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_021829	A	6	6	279206	279211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021829	A	8	8	283000	283007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021829	TTTG	2	8	284691	284698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021829	T	6	6	284718	284723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021829	CAT	2	6	284724	284729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021829	AAAGTA	2	12	284735	284746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021829	T	8	8	284758	284765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021829	GTT	2	6	284801	284806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021829	TAA	2	6	284865	284870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021829	TAT	2	6	287146	287151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021829	T	7	7	287177	287183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021829	T	6	6	287233	287238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021829	CCT	2	6	288077	288082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_021829	TAA	2	6	288088	288093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021829	TAT	2	6	288160	288165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021829	A	7	7	288170	288176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021829	GGT	2	6	288179	288184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021829	AAAAT	2	10	289892	289901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021829	TCC	2	6	289918	289923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_021829	CCT	2	6	290797	290802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_021829	CCT	2	6	293441	293446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_021829	TACT	2	8	293470	293477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_021829	TTATT	2	10	293478	293487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021829	A	7	7	293490	293496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021829	AT	3	6	293508	293513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021829	AT	3	6	293538	293543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021829	TTA	2	6	293584	293589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021829	GAT	2	6	293649	293654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021829	TCC	2	6	294608	294613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_021829	CCT	2	6	295076	295081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_021829	TTG	2	6	295083	295088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021829	AAT	2	6	295096	295101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021829	TGA	2	6	295136	295141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021829	CTA	2	6	295159	295164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021829	A	6	6	295168	295173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021829	ATA	2	6	295230	295235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021829	AAAG	2	8	295277	295284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021829	TCC	2	6	296232	296237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_021829	TTGT	2	8	296245	296252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021829	A	6	6	296274	296279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021829	A	6	6	297186	297191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021829	AAG	2	6	297865	297870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021829	CTATA	2	10	297891	297900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_021829	CGAG	2	8	297908	297915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_021829	A	7	7	298649	298655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021829	ATT	2	6	298665	298670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021829	TGG	2	6	298752	298757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021829	TA	3	6	298779	298784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021829	TCT	2	6	300490	300495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_021829	TA	3	6	300641	300646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021829	CAAAA	2	10	300654	300663	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_021829	A	7	7	300751	300757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021829	TCT	2	6	300765	300770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021829	A	9	9	300806	300814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021829	AT	3	6	300856	300861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021829	TAAA	2	8	300874	300881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021829	TCC	2	6	302903	302908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_021829	ACA	2	6	302932	302937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_021829	ATTTTT	2	12	302958	302969	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021829	T	8	8	302965	302972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021829	TAAA	2	8	303003	303010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021829	TCA	2	6	303035	303040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021829	A	7	7	303049	303055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021829	CTT	2	6	303062	303067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021829	ATA	2	6	303073	303078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021829	AAT	2	6	303090	303095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021829	A	6	6	303103	303108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021829	TAAA	2	8	303123	303130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021829	AAAT	2	8	303135	303142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021829	TAAAA	2	10	303181	303190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021829	TAT	2	6	303257	303262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021829	AAT	3	9	303330	303338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021829	TTA	2	6	303339	303344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021829	AT	3	6	303404	303409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021829	TCA	2	6	303422	303427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_021829	TAA	2	6	303445	303450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021829	CTT	2	6	303456	303461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021829	TAA	2	6	303530	303535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021829	CCA	2	6	303563	303568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1139	NC_021829	GAT	2	6	303700	303705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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