MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 12028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021829	TAT	2	6	1174242	1174247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021829	TTTA	2	8	1174255	1174262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021829	AT	3	6	1174296	1174301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021829	ATA	2	6	1174374	1174379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021829	T	7	7	1176786	1176792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021829	AGA	2	6	1176840	1176845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021829	A	6	6	1176868	1176873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021829	CTT	2	6	1176879	1176884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021829	T	7	7	1176894	1176900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021829	AGA	2	6	1180829	1180834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021829	AGG	2	6	1182050	1182055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021829	TCC	2	6	1182076	1182081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_021829	T	6	6	1182082	1182087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021829	TCC	2	6	1182099	1182104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_021829	CGC	2	6	1182425	1182430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_021829	GCTT	2	8	1182451	1182458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_021829	ATA	2	6	1182544	1182549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021829	ACA	2	6	1182565	1182570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_021829	CCA	2	6	1182577	1182582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_021829	CGC	2	6	1182638	1182643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_021829	CCA	2	6	1182661	1182666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_021829	CAA	2	6	1182683	1182688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021829	TTA	2	6	1182706	1182711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021829	AAT	2	6	1182716	1182721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021829	GAC	2	6	1182758	1182763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_021829	AAAT	2	8	1182793	1182800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021829	T	6	6	1182855	1182860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021829	TAA	2	6	1182941	1182946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021829	AG	3	6	1183514	1183519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021829	A	6	6	1184252	1184257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021829	AG	3	6	1184273	1184278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021829	CTC	2	6	1185117	1185122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_021829	TTA	2	6	1185280	1185285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021829	TAA	2	6	1185307	1185312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021829	GTT	2	6	1185373	1185378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021829	T	6	6	1186843	1186848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021829	AAT	2	6	1188837	1188842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021829	T	6	6	1188847	1188852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021829	TTAA	2	8	1188860	1188867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021829	AGA	3	9	1188886	1188894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021829	TG	3	6	1189317	1189322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021829	ATA	2	6	1189335	1189340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021829	AAT	2	6	1189355	1189360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021829	ATT	2	6	1189362	1189367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021829	ATG	2	6	1189419	1189424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021829	AAG	2	6	1189450	1189455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021829	ATG	2	6	1189462	1189467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021829	AAG	2	6	1189501	1189506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021829	AAT	2	6	1189565	1189570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021829	TTA	2	6	1189582	1189587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021829	A	7	7	1189623	1189629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021829	GAA	2	6	1189634	1189639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021829	GTG	2	6	1189647	1189652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021829	AGCA	2	8	1189654	1189661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_021829	A	8	8	1189746	1189753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021829	ACA	2	6	1189807	1189812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_021829	ATACTT	2	12	1192154	1192165	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5058	NC_021829	AAT	2	6	1192169	1192174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021829	AT	3	6	1192183	1192188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021829	AAACC	2	10	1192212	1192221	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5061	NC_021829	A	6	6	1192268	1192273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021829	TTTTTA	2	12	1193021	1193032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021829	T	6	6	1193045	1193050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021829	AAT	2	6	1193089	1193094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021829	ATTGAT	2	12	1193104	1193115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021829	AGG	2	6	1193180	1193185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021829	CA	3	6	1194918	1194923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_021829	CTT	2	6	1196364	1196369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021829	AGG	2	6	1196400	1196405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021829	GAA	2	6	1197546	1197551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021829	ATAG	2	8	1199252	1199259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021829	AGC	2	6	1199274	1199279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_021829	TCTA	2	8	1199280	1199287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_021829	T	6	6	1199288	1199293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021829	ATA	2	6	1199372	1199377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_021829	AGGA	2	8	1199406	1199413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021829	T	6	6	1200611	1200616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021829	A	6	6	1200623	1200628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021829	GGTTT	2	10	1200651	1200660	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021829	A	6	6	1200668	1200673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021829	A	6	6	1200702	1200707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021829	AGG	2	6	1200735	1200740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021829	GGTT	2	8	1201524	1201531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021829	T	7	7	1201534	1201540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021829	ATTT	2	8	1201625	1201632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021829	TAGAA	2	10	1201667	1201676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021829	A	7	7	1203348	1203354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021829	GGAT	2	8	1203435	1203442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021829	TGA	2	6	1203477	1203482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021829	CGC	2	6	1203487	1203492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_021829	CGAA	2	8	1203498	1203505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_021829	GAA	2	6	1203510	1203515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021829	AAT	2	6	1203536	1203541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021829	GTC	2	6	1203563	1203568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_021829	T	6	6	1203574	1203579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021829	CTTC	2	8	1203604	1203611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_021829	TAA	2	6	1203635	1203640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021829	TTA	2	6	1203641	1203646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021829	A	6	6	1203652	1203657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021829	TA	3	6	1203680	1203685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021829	T	6	6	1205188	1205193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021829	AGA	2	6	1205220	1205225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021829	CTA	2	6	1205274	1205279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_021829	AATT	2	8	1205338	1205345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021829	GAG	2	6	1205351	1205356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021829	AG	3	6	1207307	1207312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021829	T	7	7	1207328	1207334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021829	ATTT	2	8	1207373	1207380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021829	AAAG	2	8	1207386	1207393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021829	AGG	2	6	1207417	1207422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021829	A	6	6	1207426	1207431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021829	T	6	6	1209051	1209056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021829	AGG	2	6	1209061	1209066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021829	AGAA	2	8	1209067	1209074	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021829	T	6	6	1211698	1211703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021829	GGTG	2	8	1211704	1211711	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021829	TTTG	2	8	1211716	1211723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021829	A	6	6	1211750	1211755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021829	TA	4	8	1211803	1211810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021829	AAGT	2	8	1212940	1212947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021829	T	6	6	1212962	1212967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021829	ATA	3	9	1213062	1213070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021829	AAAC	2	8	1213086	1213093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_021829	AT	4	8	1213116	1213123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021829	ATTT	2	8	1213137	1213144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021829	TAAT	2	8	1213149	1213156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021829	AG	3	6	1213177	1213182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021829	ATG	2	6	1213187	1213192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021829	TAT	2	6	1213213	1213218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021829	T	7	7	1213775	1213781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021829	AAAT	2	8	1213792	1213799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021829	TAAAA	2	10	1213824	1213833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021829	T	6	6	1213866	1213871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5405	NC_021829	AAAT	2	8	1329223	1329230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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