MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 357

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021825	GGATA	2	10	23116	23125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021825	TATAA	2	10	36371	36380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021825	CTTTT	2	10	37217	37226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021825	GAAAA	2	10	42835	42844	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021825	AAAAT	2	10	42947	42956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021825	ATATA	2	10	43042	43051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021825	TGCTA	2	10	45665	45674	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021825	CTATT	2	10	46824	46833	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021825	CATTT	2	10	49360	49369	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021825	CATAA	2	10	71209	71218	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021825	ACCAT	2	10	76454	76463	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_021825	CTTTT	2	10	78669	78678	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021825	CAAGT	2	10	78705	78714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021825	AATAG	2	10	94003	94012	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021825	CCTTT	2	10	94499	94508	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021825	CATTT	2	10	106058	106067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021825	TAATA	2	10	114284	114293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021825	ATGTA	2	10	131872	131881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021825	ATATG	2	10	132860	132869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021825	TTTAT	2	10	185281	185290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021825	TAATT	2	10	189045	189054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021825	AAACC	2	10	192610	192619	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021825	GGTTT	2	10	201049	201058	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021825	TAGAA	2	10	202064	202073	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021825	TAAAA	2	10	214224	214233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021825	GTTAA	2	10	215724	215733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021825	AATAT	2	10	259872	259881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021825	ATTTT	2	10	272035	272044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021825	TAATT	2	10	272709	272718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021825	CTATA	2	10	277953	277962	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021825	AATAA	2	10	284998	285007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021825	ATCCA	2	10	290050	290059	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_021825	AGCCC	2	10	298949	298958	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_021825	AAAAG	2	10	300557	300566	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021825	GTTTG	2	10	307223	307232	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021825	TTTTA	2	10	308217	308226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021825	TTTAA	2	10	316380	316389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021825	TGATG	2	10	336456	336465	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021825	ATTTT	2	10	355174	355183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021825	AAAAT	2	10	377984	377993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021825	TCTAA	2	10	378079	378088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021825	TTGTA	2	10	378300	378309	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021825	TTAGT	2	10	394097	394106	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021825	CCTTG	2	10	406084	406093	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_021825	AACGA	2	10	406130	406139	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021825	TAATT	2	10	410513	410522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021825	CATGC	2	10	410787	410796	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021825	TCGTG	2	10	411672	411681	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021825	AAGGT	2	10	413391	413400	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021825	GGGTG	2	10	416087	416096	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021825	TAAAA	2	10	419495	419504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021825	TATAA	2	10	419910	419919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021825	ATGAT	2	10	431851	431860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021825	TATAA	2	10	441017	441026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021825	ATAAA	2	10	444178	444187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021825	GACTT	2	10	444188	444197	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021825	TATTT	2	10	444217	444226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021825	GTTAT	2	10	450930	450939	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021825	CTTTC	2	10	458050	458059	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021825	AAACT	2	10	469905	469914	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021825	TTTTA	2	10	487713	487722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021825	AAAGC	2	10	487727	487736	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021825	TTGTT	2	10	489725	489734	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021825	ATGGT	2	10	500748	500757	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021825	TATGA	2	10	502198	502207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021825	AAGAT	2	10	504950	504959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021825	TATTT	2	10	507579	507588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021825	TTTCC	2	10	512916	512925	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_021825	ATAAA	2	10	514933	514942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021825	TTTGC	2	10	515070	515079	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021825	TAAAA	2	10	542214	542223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021825	TTCAT	2	10	555044	555053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021825	ACCCA	2	10	559000	559009	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_021825	AAAAC	2	10	573596	573605	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021825	AAATA	2	10	582162	582171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021825	CTTAT	2	10	582179	582188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021825	GTTAC	2	10	596512	596521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021825	AAATA	2	10	596625	596634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021825	TGTTT	2	10	602468	602477	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021825	CATAA	2	10	604684	604693	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021825	AAATT	2	10	610015	610024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021825	AACTT	2	10	627711	627720	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021825	TAATT	2	10	640940	640949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021825	TCGTG	2	10	642099	642108	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021825	AAGGT	2	10	643818	643827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021825	ATTAA	2	10	647823	647832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021825	TTTTC	2	10	659237	659246	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021825	TATAG	2	10	665334	665343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021825	GAAGT	2	10	680777	680786	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021825	TATGT	2	10	690908	690917	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021825	AATAG	2	10	695433	695442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021825	TATAT	2	10	702757	702766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021825	TCTCC	2	10	717703	717712	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_021825	TTTCA	2	10	760425	760434	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021825	CATAA	2	10	771237	771246	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021825	ACTCC	2	10	772386	772395	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_021825	TTTAA	2	10	772874	772883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021825	TAAGA	2	10	798588	798597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021825	ATTTT	2	10	805668	805677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021825	ACAAA	2	10	813408	813417	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021825	TTATT	2	10	834397	834406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021825	ACAAT	2	10	855847	855856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021825	TTTTC	2	10	856652	856661	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021825	GATAC	2	10	856858	856867	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021825	TAGTG	2	10	859963	859972	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021825	GTTTT	2	10	866300	866309	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021825	AAATT	2	10	867853	867862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021825	CTTTA	2	10	872615	872624	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021825	TTAGT	2	10	891032	891041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021825	AAAAC	2	10	901213	901222	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021825	TATAG	2	10	924076	924085	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021825	ATGCT	2	10	924942	924951	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021825	ATAAA	2	10	954476	954485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021825	AGTAA	2	10	957702	957711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021825	GAATT	2	10	958948	958957	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021825	TGAAG	2	10	964766	964775	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021825	ATCGT	2	10	970890	970899	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021825	AGATA	2	10	975557	975566	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021825	AATTT	2	10	985211	985220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021825	ATAGT	2	10	985246	985255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021825	TTATT	2	10	989344	989353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021825	CTATG	2	10	989510	989519	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021825	ATACA	2	10	994605	994614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021825	AAAAC	2	10	1019435	1019444	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021825	GTTTT	2	10	1019457	1019466	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021825	AAACA	2	10	1021963	1021972	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021825	TATAG	2	10	1031767	1031776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021825	GAAAA	2	10	1035877	1035886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021825	TAGAC	2	10	1052086	1052095	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021825	TAAAA	2	10	1058015	1058024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021825	CTATG	2	10	1065460	1065469	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021825	AAAGA	2	10	1070914	1070923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021825	ATAAA	2	10	1085886	1085895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021825	AGAAT	2	10	1086756	1086765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021825	TGGAA	2	10	1086884	1086893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021825	AATCA	2	10	1089887	1089896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021825	TATAA	2	10	1097825	1097834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021825	ATTGA	2	10	1097863	1097872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021825	ATTAA	2	10	1111171	1111180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021825	ATATA	2	10	1142617	1142626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021825	ATTTT	2	10	1150849	1150858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021825	TACAT	2	10	1151286	1151295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021825	TATAA	2	10	1152340	1152349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021825	GAAAT	2	10	1176169	1176178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021825	TTACT	2	10	1184192	1184201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021825	ATTTA	2	10	1189844	1189853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021825	GGGGA	2	10	1199597	1199606	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021825	TATTT	2	10	1205835	1205844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021825	AGAGA	2	10	1205985	1205994	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021825	CTTTT	2	10	1206960	1206969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_021825	CTTTT	2	10	1256604	1256613	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021825	TAGTT	2	10	1256617	1256626	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_021825	AATAA	2	10	1311849	1311858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021825	ATTTT	2	10	1315435	1315444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021825	GTTTT	2	10	1328371	1328380	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021825	ATAGA	2	10	1350723	1350732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_021825	ATTTT	2	10	1356379	1356388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_021825	AGTTT	2	10	1524570	1524579	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_021825	AATAA	2	10	1558733	1558742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_021825	TTTAT	2	10	2153656	2153665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_021825	AATCA	2	10	2153870	2153879	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_021825	CTTTT	2	10	2172625	2172634	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_021825	CGCGC	2	10	2189511	2189520	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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272	NC_021825	AATTA	2	10	2196379	2196388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021825	ATCAT	2	10	2196556	2196565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_021825	TTTCA	2	10	2223380	2223389	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
275	NC_021825	AAGAT	2	10	2226238	2226247	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021825	AAAAT	2	10	2242710	2242719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_021825	CTTAC	2	10	2252174	2252183	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
278	NC_021825	TGTTC	2	10	2257278	2257287	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
279	NC_021825	TTTTA	2	10	2265839	2265848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_021825	AAAAG	2	10	2270632	2270641	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_021825	TTTTA	2	10	2280289	2280298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021825	AGGTT	2	10	2292266	2292275	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
283	NC_021825	TTACC	2	10	2298428	2298437	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
284	NC_021825	CACGA	2	10	2299898	2299907	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_021825	AATTA	2	10	2301057	2301066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021825	GTATA	2	10	2308883	2308892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_021825	CAAAA	2	10	2309110	2309119	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_021825	TCTAT	2	10	2314336	2314345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_021825	TAAAA	2	10	2338161	2338170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021825	ATACA	2	10	2351051	2351060	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_021825	ACTTT	2	10	2352885	2352894	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_021825	GTAAA	2	10	2373386	2373395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021825	CATTT	2	10	2381261	2381270	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_021825	TAAAG	2	10	2401240	2401249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021825	AGCAT	2	10	2412213	2412222	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
296	NC_021825	ATAGA	2	10	2436702	2436711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021825	CTTTA	2	10	2443221	2443230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_021825	AATTT	2	10	2456722	2456731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021825	CTAGC	2	10	2456827	2456836	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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302	NC_021825	ACCTT	2	10	2489552	2489561	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
303	NC_021825	CAAAC	2	10	2499925	2499934	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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309	NC_021825	ATAAA	2	10	2555711	2555720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_021825	AAGCC	2	10	2771034	2771043	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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335	NC_021825	TTACC	2	10	2828757	2828766	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
336	NC_021825	CACGA	2	10	2830227	2830236	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
337	NC_021825	AATTA	2	10	2831386	2831395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
338	NC_021825	CTATT	2	10	2833272	2833281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
339	NC_021825	AAGAA	2	10	2836920	2836929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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342	NC_021825	TTATA	2	10	2861100	2861109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_021825	TTTTG	2	10	2868842	2868851	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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345	NC_021825	TCTAT	2	10	2874733	2874742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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347	NC_021825	CATAT	2	10	2907488	2907497	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
348	NC_021825	TTCTA	2	10	2908571	2908580	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
349	NC_021825	CTTAT	2	10	2914467	2914476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
350	NC_021825	CTACT	2	10	2917857	2917866	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
351	NC_021825	TCATA	2	10	2920028	2920037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
352	NC_021825	ACTTT	2	10	2939563	2939572	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
353	NC_021825	AGTAA	2	10	2941804	2941813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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357	NC_021825	AATAA	2	10	2976014	2976023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.