MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 8196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021824	A	6	6	2883460	2883465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_021824	ATT	2	6	2883494	2883499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_021824	ATT	2	6	2885166	2885171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_021824	T	7	7	2885206	2885212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_021824	TAA	2	6	2885222	2885227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_021824	ATATA	2	10	2885228	2885237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_021824	ATT	2	6	2885245	2885250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_021824	TAT	2	6	2885285	2885290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_021824	ATA	2	6	2885302	2885307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021824	A	6	6	2887587	2887592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_021824	T	6	6	2888796	2888801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021824	TCC	2	6	2889437	2889442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_021824	T	6	6	2889509	2889514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_021824	A	6	6	2889518	2889523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_021824	AAT	2	6	2889526	2889531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_021824	A	6	6	2889582	2889587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_021824	AC	3	6	2889596	2889601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8018	NC_021824	T	6	6	2890935	2890940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_021824	AGA	2	6	2890971	2890976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_021824	GA	3	6	2890975	2890980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_021824	AAG	2	6	2891282	2891287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_021824	CTT	2	6	2891309	2891314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_021824	TCC	2	6	2891847	2891852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_021824	TTA	2	6	2891887	2891892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_021824	ATT	2	6	2891894	2891899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_021824	AGA	2	6	2891911	2891916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_021824	A	7	7	2891918	2891924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_021824	CAT	2	6	2891955	2891960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_021824	ATGA	2	8	2892019	2892026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_021824	AAT	2	6	2892032	2892037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_021824	TAA	2	6	2892146	2892151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_021824	A	6	6	2892211	2892216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_021824	TAAA	2	8	2892222	2892229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_021824	T	6	6	2892236	2892241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_021824	AAGA	2	8	2892253	2892260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_021824	TAT	2	6	2892565	2892570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_021824	GAAA	2	8	2892654	2892661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_021824	TTATTT	2	12	2893967	2893978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_021824	CCT	2	6	2894301	2894306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_021824	AT	3	6	2894335	2894340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_021824	TTA	2	6	2895132	2895137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_021824	TG	3	6	2895193	2895198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_021824	AACC	2	8	2895229	2895236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8044	NC_021824	TCT	2	6	2897054	2897059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_021824	T	6	6	2897064	2897069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_021824	TAACA	2	10	2897075	2897084	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8047	NC_021824	T	6	6	2897113	2897118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_021824	ATT	2	6	2897119	2897124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_021824	T	7	7	2897123	2897129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_021824	TTTA	2	8	2905573	2905580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_021824	T	6	6	2905612	2905617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_021824	T	6	6	2905625	2905630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_021824	A	7	7	2905655	2905661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_021824	AT	3	6	2905692	2905697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_021824	TTA	2	6	2905959	2905964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_021824	A	6	6	2905993	2905998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_021824	A	6	6	2906069	2906074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_021824	TAAC	2	8	2906082	2906089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_021824	TTA	2	6	2906122	2906127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_021824	TCT	2	6	2906145	2906150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_021824	TGAA	2	8	2906178	2906185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021824	ATA	2	6	2906822	2906827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021824	TCACT	2	10	2907207	2907216	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8064	NC_021824	AAT	2	6	2907239	2907244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_021824	CTC	2	6	2910880	2910885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_021824	TTTC	2	8	2910910	2910917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8067	NC_021824	TTCA	2	8	2910931	2910938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8068	NC_021824	CA	3	6	2910947	2910952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_021824	ATTC	2	8	2910960	2910967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8070	NC_021824	ATT	2	6	2911003	2911008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_021824	AGA	2	6	2911059	2911064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_021824	AGG	2	6	2911078	2911083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_021824	CCT	2	6	2912866	2912871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_021824	ATTT	2	8	2912882	2912889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_021824	A	6	6	2912896	2912901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_021824	TAT	2	6	2915016	2915021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_021824	AT	3	6	2915020	2915025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_021824	CTTT	2	8	2915033	2915040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8079	NC_021824	A	6	6	2915049	2915054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_021824	CTT	2	6	2915065	2915070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_021824	AGGA	2	8	2915074	2915081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_021824	T	7	7	2915810	2915816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_021824	A	7	7	2915830	2915836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_021824	TC	3	6	2919931	2919936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8085	NC_021824	CCCT	2	8	2920666	2920673	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8086	NC_021824	CTC	2	6	2922048	2922053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_021824	ACTT	2	8	2922628	2922635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8088	NC_021824	CTATA	2	10	2922652	2922661	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8089	NC_021824	A	7	7	2922688	2922694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_021824	TAATAC	2	12	2922712	2922723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8091	NC_021824	ATT	2	6	2922740	2922745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_021824	TAA	2	6	2922765	2922770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_021824	A	6	6	2922813	2922818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_021824	T	6	6	2923761	2923766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_021824	TTC	2	6	2925772	2925777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_021824	A	7	7	2925793	2925799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_021824	T	6	6	2928719	2928724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_021824	GAAAA	2	10	2928749	2928758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_021824	TCA	2	6	2928762	2928767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_021824	A	6	6	2928767	2928772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_021824	TGG	2	6	2928791	2928796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_021824	TAA	2	6	2928798	2928803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_021824	CCT	2	6	2929508	2929513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_021824	TC	3	6	2929535	2929540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8105	NC_021824	ATA	2	6	2929547	2929552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_021824	A	9	9	2929552	2929560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_021824	TCT	2	6	2929587	2929592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_021824	CTT	2	6	2929595	2929600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_021824	TTA	2	6	2929635	2929640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_021824	A	6	6	2929677	2929682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_021824	TCC	2	6	2930972	2930977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_021824	T	6	6	2931004	2931009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021824	TAA	2	6	2931902	2931907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_021824	A	6	6	2931929	2931934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_021824	TTA	2	6	2934760	2934765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_021824	CTT	2	6	2934771	2934776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_021824	TCC	2	6	2935271	2935276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8118	NC_021824	ATT	2	6	2935285	2935290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_021824	TA	3	6	2935324	2935329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_021824	T	8	8	2935341	2935348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_021824	T	6	6	2935361	2935366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021824	A	6	6	2935378	2935383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021824	AAC	2	6	2935411	2935416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_021824	A	7	7	2935452	2935458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_021824	AAT	2	6	2935463	2935468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_021824	AAAC	2	8	2935475	2935482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_021824	CAA	2	6	2935504	2935509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_021824	AGG	2	6	2935520	2935525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_021824	TGA	2	6	2935544	2935549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_021824	A	7	7	2935556	2935562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_021824	ATTA	2	8	2935574	2935581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_021824	CAT	2	6	2935584	2935589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_021824	CAAA	2	8	2935626	2935633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8134	NC_021824	A	6	6	2935631	2935636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_021824	TAC	2	6	2935645	2935650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8136	NC_021824	A	6	6	2937182	2937187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8196	NC_021824	CT	3	6	2943145	2943150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.