MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 1190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021823	TCAT	2	8	291	298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021823	CTTT	2	8	5848	5855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021823	TCCT	2	8	13695	13702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021823	ATGT	2	8	13777	13784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021823	TATT	2	8	21122	21129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021823	CAAA	2	8	21143	21150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021823	AGAA	2	8	27236	27243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021823	CTTA	2	8	28479	28486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021823	AAAT	2	8	32840	32847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021823	AGAA	2	8	33945	33952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021823	AACG	2	8	46065	46072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021823	TAAA	2	8	46167	46174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021823	TAAA	2	8	46189	46196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021823	GAAA	2	8	48622	48629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021823	TGCT	2	8	53897	53904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021823	AATT	2	8	55423	55430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021823	CAAA	2	8	58199	58206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021823	TTAG	2	8	59423	59430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021823	AATA	2	8	59562	59569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021823	GGAA	2	8	60433	60440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021823	TGAT	2	8	65502	65509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021823	AAAT	2	8	72852	72859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021823	TGAA	2	8	79426	79433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021823	TCCC	2	8	81730	81737	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_021823	TTAG	2	8	81848	81855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021823	TTTG	2	8	85951	85958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021823	TTTG	2	8	88151	88158	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021823	AGCA	2	8	88975	88982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021823	AATT	2	8	91376	91383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021823	AACC	2	8	97192	97199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021823	CTAG	2	8	100636	100643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021823	AGAA	2	8	106448	106455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021823	AGTA	2	8	106512	106519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021823	TGTT	2	8	115968	115975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021823	GTTA	2	8	116885	116892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021823	TTAA	2	8	117197	117204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021823	AAAT	2	8	117233	117240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021823	GAAA	2	8	124616	124623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021823	GAAA	2	8	131427	131434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021823	AGAA	2	8	132648	132655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021823	AATA	2	8	134710	134717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021823	ATTT	2	8	146960	146967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021823	TCTT	2	8	147034	147041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021823	TCCT	2	8	147472	147479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021823	ATAA	2	8	147714	147721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021823	TAAA	2	8	147723	147730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021823	GAAT	2	8	147882	147889	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021823	GTAT	2	8	149502	149509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021823	GAAA	2	8	149530	149537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021823	GGGC	2	8	149797	149804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021823	TTAT	2	8	151482	151489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021823	AGAT	2	8	153500	153507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021823	ACTT	2	8	158575	158582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021823	AATG	2	8	158626	158633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021823	ATTT	2	8	166480	166487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021823	TACC	2	8	166507	166514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021823	TATT	2	8	166594	166601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021823	AGAA	2	8	170563	170570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021823	TAAA	2	8	172121	172128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021823	TTAC	2	8	178404	178411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021823	ATAG	2	8	178620	178627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021823	ATAA	2	8	178708	178715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021823	GGAT	2	8	178963	178970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021823	ATTT	2	8	179154	179161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021823	ATTT	2	8	181110	181117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021823	GGGA	2	8	186474	186481	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021823	ATAA	2	8	194811	194818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021823	AGAA	2	8	212601	212608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021823	TTTG	2	8	221489	221496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021823	TAAA	2	8	223374	223381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021823	GCTC	2	8	226336	226343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021823	TGCA	2	8	226620	226627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021823	CTTA	2	8	226638	226645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021823	CAAT	2	8	228628	228635	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021823	ATTT	2	8	230980	230987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021823	ATTT	2	8	231004	231011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021823	CAAA	2	8	231051	231058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021823	AAAG	2	8	233615	233622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021823	TAAA	2	8	233667	233674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021823	GAAA	2	8	233816	233823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021823	TATT	2	8	235539	235546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021823	TAAA	2	8	235593	235600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021823	GACA	2	8	241965	241972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021823	AACA	2	8	246360	246367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021823	ATTT	2	8	246587	246594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021823	ACAA	2	8	247219	247226	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021823	CTAT	2	8	248642	248649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021823	GAAT	2	8	250392	250399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021823	TTAC	2	8	253851	253858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021823	TAGT	2	8	253907	253914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021823	ACAA	2	8	253930	253937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021823	AAAT	2	8	257223	257230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021823	AAGC	2	8	257266	257273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021823	AAAG	2	8	260593	260600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021823	TAAT	2	8	260674	260681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021823	TCAC	2	8	267231	267238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021823	ATTA	2	8	267260	267267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021823	TAAT	2	8	272882	272889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021823	ATTG	2	8	272976	272983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021823	TAAA	2	8	273067	273074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021823	AATA	2	8	273208	273215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021823	TCAC	2	8	274258	274265	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021823	TCCC	2	8	276639	276646	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_021823	ACAT	2	8	277918	277925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021823	TTTA	2	8	280937	280944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021823	ATTT	2	8	281673	281680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021823	AGCA	2	8	283234	283241	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021823	TGCT	2	8	283269	283276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021823	GAGT	2	8	283376	283383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021823	ACTC	2	8	283384	283391	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021823	TACA	2	8	283451	283458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021823	AGTG	2	8	288073	288080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021823	GTTG	2	8	288446	288453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021823	TTTA	2	8	288541	288548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021823	AATT	2	8	289320	289327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021823	TACT	2	8	294349	294356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021823	ATGA	2	8	294953	294960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021823	GGAA	2	8	297655	297662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021823	GATG	2	8	298882	298889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021823	GTAA	2	8	302152	302159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021823	GAAA	2	8	302217	302224	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021823	TGAG	2	8	307188	307195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021823	TTTC	2	8	308298	308305	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021823	AACT	2	8	312125	312132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021823	TAAA	2	8	314156	314163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021823	CTCG	2	8	315025	315032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021823	ACAA	2	8	316690	316697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021823	CTTT	2	8	317658	317665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021823	AGTA	2	8	319464	319471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021823	GAAT	2	8	333767	333774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021823	TATT	2	8	337019	337026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021823	AAAG	2	8	337426	337433	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021823	AATT	2	8	337471	337478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021823	TACA	2	8	338036	338043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021823	ATCT	3	12	346700	346711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021823	TGTT	2	8	346790	346797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021823	TTAT	2	8	349868	349875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021823	AAAT	2	8	356142	356149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021823	AAAC	2	8	356521	356528	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021823	AAAG	2	8	356558	356565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021823	AAAT	2	8	356962	356969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021823	TTAA	2	8	359650	359657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021823	TTAT	2	8	363849	363856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021823	GTTA	2	8	365500	365507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021823	TATT	2	8	371292	371299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021823	TAGT	2	8	379912	379919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021823	ACAA	2	8	380130	380137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021823	ATAG	2	8	381801	381808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021823	TTCA	2	8	382188	382195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021823	CAAG	2	8	393218	393225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021823	AGAT	2	8	393241	393248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021823	TTTA	2	8	394679	394686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_021823	TTTC	2	8	1256299	1256306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
496	NC_021823	TTGT	2	8	1257107	1257114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_021823	TCCC	2	8	1258774	1258781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
498	NC_021823	ATTT	2	8	1267100	1267107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_021823	GTTT	2	8	1268497	1268504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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