MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 4933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021725	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021725	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021725	TCC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021725	ATT	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021725	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021725	GAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021725	TGG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021725	GAG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021725	GAG	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021725	CAT	2	6	9670	9675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021725	CTG	3	9	9800	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021725	AAC	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021725	GTT	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021725	TTA	2	6	10091	10096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021725	TAT	2	6	10109	10114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021725	TTA	2	6	10151	10156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021725	TAA	2	6	10237	10242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021725	GTA	2	6	12030	12035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021725	AGA	2	6	12084	12089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021725	AAT	2	6	12164	12169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021725	TAA	2	6	12243	12248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021725	ACT	2	6	13756	13761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021725	CTT	2	6	13904	13909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021725	GGT	2	6	14226	14231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021725	ATT	2	6	14283	14288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021725	AGT	2	6	14974	14979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021725	TTA	2	6	15039	15044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021725	AGG	2	6	15084	15089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021725	AGG	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021725	AGG	2	6	17401	17406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021725	ATA	2	6	19949	19954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021725	AGG	2	6	19969	19974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021725	GGT	2	6	20409	20414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021725	GAA	2	6	20427	20432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021725	ACA	2	6	20626	20631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021725	TTC	2	6	20670	20675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021725	GTA	2	6	20697	20702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021725	TGA	2	6	20715	20720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021725	ATT	2	6	20730	20735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021725	ACG	2	6	20898	20903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021725	GTT	2	6	20997	21002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021725	ATT	2	6	21234	21239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021725	ATA	2	6	21240	21245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021725	AAG	2	6	21299	21304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021725	CAG	2	6	22429	22434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021725	TTA	2	6	24567	24572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021725	GAT	2	6	24712	24717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021725	GAC	2	6	24724	24729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021725	TCT	2	6	25938	25943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021725	AAT	2	6	25945	25950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021725	TCA	2	6	25958	25963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021725	GGC	2	6	26008	26013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021725	AAT	3	9	26038	26046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021725	AAC	2	6	26065	26070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021725	CTG	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021725	CAA	2	6	26148	26153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021725	TCC	2	6	26195	26200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021725	ATG	2	6	26218	26223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021725	CAA	2	6	26226	26231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021725	TTG	2	6	26351	26356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021725	GGC	2	6	26439	26444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021725	AGG	2	6	28711	28716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021725	GTT	2	6	28822	28827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021725	CCT	2	6	33655	33660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021725	GTT	2	6	33709	33714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021725	TAA	2	6	33719	33724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021725	TGT	2	6	33773	33778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021725	GCC	2	6	34380	34385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021725	ATG	2	6	35610	35615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021725	CGC	2	6	35660	35665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021725	GCG	2	6	35686	35691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021725	TGC	2	6	36507	36512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021725	TCA	2	6	36609	36614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021725	AAG	2	6	36655	36660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021725	ACG	2	6	37274	37279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021725	TGA	2	6	37329	37334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021725	ATC	2	6	37348	37353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021725	CAA	2	6	38534	38539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021725	GAT	2	6	38542	38547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021725	TCA	2	6	40246	40251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021725	TCT	2	6	40307	40312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021725	TTG	2	6	41139	41144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021725	CAG	2	6	41177	41182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021725	AAG	2	6	41235	41240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021725	AAT	2	6	41389	41394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021725	TGA	2	6	41566	41571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021725	ATG	2	6	41615	41620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021725	CTT	3	9	41699	41707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021725	TCC	2	6	41727	41732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021725	GAA	2	6	41759	41764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021725	TCA	2	6	41778	41783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021725	TAT	2	6	41858	41863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021725	TGC	3	9	41917	41925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021725	TCT	2	6	41931	41936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021725	TGT	2	6	41994	41999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021725	GTT	2	6	42099	42104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021725	TCG	2	6	42105	42110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021725	TGA	2	6	42240	42245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021725	AAC	2	6	42294	42299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021725	ATT	2	6	42482	42487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021725	AAG	2	6	42525	42530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021725	GTT	2	6	43019	43024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021725	AAT	2	6	43186	43191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021725	TCG	2	6	43263	43268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021725	GAA	2	6	43506	43511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021725	CCT	2	6	46308	46313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021725	CAA	2	6	46349	46354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021725	TAT	2	6	46389	46394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021725	AAT	2	6	46540	46545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021725	AGC	2	6	47717	47722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021725	CAG	2	6	49748	49753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021725	TAA	2	6	49765	49770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021725	GTT	2	6	49775	49780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021725	ATT	2	6	49999	50004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021725	GTT	2	6	50005	50010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021725	AAC	2	6	54841	54846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021725	GTT	2	6	55625	55630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021725	GAA	2	6	55658	55663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021725	ATG	2	6	60851	60856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021725	CCT	2	6	60859	60864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021725	CAA	2	6	61007	61012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021725	GTT	2	6	61024	61029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021725	CAA	2	6	62668	62673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021725	CCT	2	6	64064	64069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021725	AGC	2	6	64307	64312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021725	TGT	2	6	65084	65089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021725	TAT	2	6	68915	68920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021725	TTG	2	6	68938	68943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021725	ATG	2	6	69386	69391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021725	CAA	2	6	69968	69973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021725	TGA	2	6	71548	71553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021725	GAG	2	6	71609	71614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021725	TAA	2	6	73005	73010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021725	GTC	2	6	74453	74458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021725	CTT	2	6	74502	74507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021725	TTC	2	6	74528	74533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021725	AGC	2	6	74540	74545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021725	TCA	2	6	74564	74569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021725	CCA	2	6	74614	74619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021725	TAC	2	6	74641	74646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021725	CAT	2	6	74677	74682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021725	AGA	2	6	74686	74691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021725	GGT	2	6	74910	74915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021725	TGA	2	6	75609	75614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_021725	CGA	2	6	80440	80445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_021725	GTT	2	6	83373	83378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_021725	TCC	2	6	87410	87415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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158	NC_021725	AGG	2	6	89923	89928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021725	AAT	2	6	91249	91254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021725	AAC	2	6	92566	92571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_021725	TTA	2	6	92734	92739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021725	GGA	2	6	98225	98230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_021725	GAG	2	6	100721	100726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_021725	CCT	2	6	105652	105657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_021725	TTG	2	6	105662	105667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021725	GTT	2	6	105677	105682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021725	CTT	2	6	105700	105705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_021725	GGA	2	6	167245	167250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_021725	CAT	2	6	167511	167516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_021725	TAT	2	6	168739	168744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021725	CAT	2	6	168908	168913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_021725	AGA	2	6	169301	169306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_021725	ATA	2	6	169343	169348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_021725	GCC	2	6	169349	169354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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281	NC_021725	TAA	2	6	169417	169422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_021725	TTG	2	6	169515	169520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_021725	ACA	2	6	187278	187283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_021725	GGT	2	6	189321	189326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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308	NC_021725	GTT	2	6	193468	193473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
309	NC_021725	GAA	2	6	193484	193489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_021725	CAA	2	6	247767	247772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_021725	CTC	2	6	254520	254525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_021725	AGA	2	6	254586	254591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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