MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 8671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021725	A	6	6	1791317	1791322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021725	T	6	6	1791341	1791346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021725	TGC	2	6	1792043	1792048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_021725	TCA	2	6	1792085	1792090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_021725	TAC	2	6	1792101	1792106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_021725	T	6	6	1792247	1792252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021725	CAA	2	6	1792268	1792273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_021725	TCA	2	6	1792280	1792285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021725	GCTC	2	8	1792724	1792731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_021725	GTATA	2	10	1792766	1792775	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021725	GCG	2	6	1792791	1792796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_021725	AAT	2	6	1792813	1792818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021725	ATG	2	6	1792826	1792831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021725	TAA	2	6	1792894	1792899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021725	TAA	2	6	1792913	1792918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021725	ATC	2	6	1792960	1792965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_021725	TCC	2	6	1793716	1793721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_021725	GCC	2	6	1793737	1793742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_021725	AAG	2	6	1793743	1793748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021725	TAA	2	6	1793753	1793758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021725	GGT	2	6	1793766	1793771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021725	TGC	2	6	1794313	1794318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021725	CCA	2	6	1794375	1794380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_021725	TCA	3	9	1797296	1797304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021725	ATA	2	6	1797403	1797408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021725	GC	3	6	1797670	1797675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_021725	TTTG	2	8	1797691	1797698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021725	TCT	2	6	1799541	1799546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_021725	TTG	2	6	1799584	1799589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021725	GCTA	2	8	1799597	1799604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_021725	T	6	6	1799610	1799615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021725	GCA	2	6	1799635	1799640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_021725	ACC	2	6	1799650	1799655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_021725	GCG	3	9	1799657	1799665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_021725	TAT	2	6	1800434	1800439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021725	TAG	2	6	1800451	1800456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021725	GAT	2	6	1803202	1803207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021725	CTGGG	2	10	1804719	1804728	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5039	NC_021725	CTTT	2	8	1814763	1814770	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_021725	CAA	2	6	1814798	1814803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_021725	ATT	2	6	1814835	1814840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021725	A	7	7	1814897	1814903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021725	ATCTC	2	10	1814918	1814927	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5044	NC_021725	A	7	7	1815596	1815602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021725	AAG	2	6	1815628	1815633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021725	TAAT	2	8	1815740	1815747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021725	AGC	2	6	1816080	1816085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_021725	CCT	2	6	1816100	1816105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_021725	AC	3	6	1816211	1816216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_021725	CTA	2	6	1817713	1817718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_021725	CAAA	2	8	1818218	1818225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_021725	A	6	6	1818223	1818228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021725	CTT	2	6	1818255	1818260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_021725	TG	3	6	1820321	1820326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021725	T	7	7	1820365	1820371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021725	CCTCA	2	10	1820609	1820618	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5057	NC_021725	GTT	2	6	1820872	1820877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021725	AATC	2	8	1820895	1820902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_021725	AGG	2	6	1820940	1820945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021725	TTG	2	6	1823055	1823060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021725	T	7	7	1823154	1823160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021725	GCA	2	6	1823221	1823226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_021725	TCA	2	6	1823315	1823320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_021725	AAT	2	6	1823328	1823333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021725	ATT	2	6	1823334	1823339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021725	T	6	6	1823338	1823343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021725	TAA	2	6	1823358	1823363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021725	GA	3	6	1823374	1823379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021725	A	6	6	1823811	1823816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021725	T	6	6	1823835	1823840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021725	TTCC	2	8	1825438	1825445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_021725	A	8	8	1826866	1826873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021725	TCT	2	6	1828115	1828120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_021725	AAG	2	6	1828159	1828164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021725	CAA	2	6	1828187	1828192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021725	TCA	2	6	1828212	1828217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_021725	TGATT	2	10	1828618	1828627	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021725	A	7	7	1828644	1828650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021725	GTAA	2	8	1829859	1829866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021725	CGG	2	6	1829873	1829878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_021725	GGCTG	2	10	1829948	1829957	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5082	NC_021725	GTG	2	6	1829962	1829967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021725	CAC	2	6	1830055	1830060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_021725	A	6	6	1830165	1830170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021725	CCT	2	6	1830236	1830241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_021725	CAG	2	6	1830248	1830253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_021725	CT	3	6	1831084	1831089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_021725	GTTAT	2	10	1831103	1831112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021725	AT	3	6	1831124	1831129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021725	TCC	2	6	1833055	1833060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_021725	TA	3	6	1834523	1834528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021725	ATC	2	6	1834561	1834566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021725	ATC	2	6	1834578	1834583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_021725	A	6	6	1835086	1835091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021725	AATT	2	8	1835134	1835141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021725	ATT	2	6	1836913	1836918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021725	GTCATT	2	12	1837034	1837045	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5098	NC_021725	TAA	2	6	1837061	1837066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021725	TCAA	2	8	1837070	1837077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_021725	ACTG	2	8	1837078	1837085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_021725	GTTC	2	8	1837097	1837104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_021725	CGG	2	6	1837175	1837180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_021725	CTT	2	6	1837228	1837233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_021725	CA	3	6	1837353	1837358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_021725	A	6	6	1837358	1837363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021725	GAA	2	6	1841461	1841466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021725	AAAAC	2	10	1841547	1841556	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5108	NC_021725	CCT	2	6	1842873	1842878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_021725	GTGAGC	2	12	1843482	1843493	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5110	NC_021725	TGA	2	6	1843533	1843538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021725	GC	3	6	1843615	1843620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_021725	GCC	2	6	1843775	1843780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_021725	AC	3	6	1843784	1843789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_021725	GCT	2	6	1844799	1844804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_021725	ATT	2	6	1846079	1846084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021725	CCT	2	6	1846730	1846735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_021725	ACGTTT	2	12	1846768	1846779	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5118	NC_021725	CTG	2	6	1846796	1846801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_021725	TCAA	2	8	1846810	1846817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_021725	TTGC	2	8	1846878	1846885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_021725	GC	3	6	1847143	1847148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_021725	TCT	2	6	1847297	1847302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_021725	CAT	2	6	1847309	1847314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021725	CAA	2	6	1847328	1847333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_021725	T	6	6	1847355	1847360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021725	TCA	2	6	1848454	1848459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_021725	T	6	6	1848503	1848508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021725	CCTTT	2	10	1851321	1851330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5129	NC_021725	T	6	6	1851328	1851333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021725	A	7	7	1851378	1851384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021725	ACCT	2	8	1851475	1851482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_021725	TCC	2	6	1851533	1851538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_021725	TGA	2	6	1851552	1851557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021725	CT	3	6	1852057	1852062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5135	NC_021725	CCT	2	6	1854774	1854779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5136	NC_021725	TCTT	2	8	1854780	1854787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5137	NC_021725	CAG	2	6	1854822	1854827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5149	NC_021725	AGCA	2	8	1860436	1860443	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5155	NC_021725	CTT	2	6	1865292	1865297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5160	NC_021725	CTT	2	6	1865504	1865509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_021725	ATT	2	6	1872392	1872397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_021725	TAA	2	6	1872419	1872424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_021725	GAC	2	6	1893559	1893564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_021725	GCAG	2	8	1893638	1893645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5265	NC_021725	ACT	2	6	1893656	1893661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5272	NC_021725	ATCTC	2	10	1894046	1894055	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5304	NC_021725	AAGC	2	8	1896561	1896568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5391	NC_021725	AGA	2	6	1914276	1914281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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