MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 8378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021723	CCG	2	6	316075	316080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_021723	GC	3	6	316108	316113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_021723	TTACGA	2	12	316225	316236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1004	NC_021723	A	6	6	316287	316292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021723	CAAGC	2	10	316322	316331	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1006	NC_021723	CGC	2	6	316423	316428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_021723	AAG	2	6	316602	316607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021723	TGA	2	6	316615	316620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021723	TTG	2	6	316625	316630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021723	CAT	2	6	316646	316651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021723	TCA	2	6	316761	316766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021723	GTTTG	2	10	316864	316873	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021723	ACC	2	6	317076	317081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_021723	ATG	2	6	317098	317103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021723	GCTCAC	2	12	317136	317147	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_021723	AGG	2	6	317155	317160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021723	TCA	2	6	319471	319476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_021723	T	6	6	319953	319958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021723	GT	3	6	319980	319985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021723	TCGAT	2	10	320973	320982	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_021723	GAA	2	6	320983	320988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021723	T	6	6	321072	321077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021723	TCC	2	6	321976	321981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_021723	AATTT	2	10	321985	321994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021723	CCT	2	6	323379	323384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_021723	TA	3	6	323387	323392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021723	A	6	6	323405	323410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021723	AAC	2	6	323460	323465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021723	TGA	2	6	323471	323476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021723	ATG	2	6	323498	323503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021723	T	7	7	323512	323518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021723	TA	3	6	323551	323556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021723	TAAA	2	8	323573	323580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021723	ATA	2	6	323597	323602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021723	ATG	2	6	323640	323645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021723	AAC	2	6	323655	323660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021723	TTA	2	6	324563	324568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021723	TGA	2	6	324612	324617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021723	A	6	6	324622	324627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021723	A	6	6	324629	324634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021723	T	7	7	324649	324655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021723	C	6	6	325582	325587	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1043	NC_021723	GA	3	6	325622	325627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021723	TTA	2	6	325650	325655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021723	AGAA	2	8	325682	325689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021723	ATT	2	6	325737	325742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021723	GATT	2	8	325821	325828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021723	GGCG	2	8	329203	329210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_021723	ATCA	2	8	330501	330508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_021723	A	7	7	330539	330545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021723	GT	4	8	330566	330573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021723	T	6	6	332967	332972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021723	CTC	2	6	334332	334337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_021723	CTT	2	6	335089	335094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021723	GTGG	2	8	335106	335113	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021723	T	6	6	335123	335128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021723	GTG	2	6	335148	335153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021723	GGT	2	6	338186	338191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021723	AAT	2	6	338357	338362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021723	AAC	2	6	338458	338463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021723	TGT	2	6	338488	338493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021723	TAA	2	6	338631	338636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021723	GAA	2	6	338681	338686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021723	TGA	2	6	339998	340003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021723	AATATT	2	12	340008	340019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021723	ATT	2	6	340075	340080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021723	A	7	7	341739	341745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021723	CATT	2	8	341799	341806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_021723	ACT	2	6	342492	342497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_021723	A	6	6	342538	342543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021723	TGA	2	6	342751	342756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021723	CGT	2	6	343033	343038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_021723	CGG	2	6	343048	343053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_021723	TGCT	2	8	343059	343066	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_021723	GAC	2	6	343104	343109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_021723	A	6	6	343111	343116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021723	GAT	2	6	343124	343129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021723	TTCC	2	8	343204	343211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_021723	CGG	2	6	343220	343225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_021723	CGT	2	6	343291	343296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021723	TGCT	2	8	343317	343324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_021723	GAT	2	6	343384	343389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021723	TTCA	2	8	343438	343445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_021723	CTGC	2	8	343509	343516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_021723	CTT	2	6	345282	345287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021723	A	8	8	345367	345374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021723	ATA	2	6	345431	345436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021723	T	6	6	345552	345557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021723	CA	3	6	345610	345615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_021723	GTCT	2	8	345655	345662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_021723	GAA	2	6	345670	345675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021723	T	6	6	345684	345689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021723	GGT	2	6	348277	348282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021723	CG	3	6	348283	348288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_021723	CCGC	2	8	348318	348325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1096	NC_021723	ACA	2	6	348344	348349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021723	AAT	2	6	349572	349577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021723	AGG	2	6	349582	349587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021723	TCA	2	6	351949	351954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021723	T	6	6	351970	351975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021723	AAC	2	6	352015	352020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021723	TAT	2	6	352064	352069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021723	CAG	2	6	353756	353761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_021723	T	8	8	353801	353808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021723	GAA	2	6	353814	353819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021723	A	6	6	353845	353850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021723	TGAT	2	8	353882	353889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021723	CA	3	6	353962	353967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_021723	GAC	2	6	353978	353983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021723	CAA	2	6	354018	354023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021723	TGATT	2	10	354067	354076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021723	AGG	3	9	355208	355216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021723	CAC	2	6	355873	355878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_021723	GCAG	2	8	358376	358383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_021723	GTTG	2	8	358408	358415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021723	AGG	2	6	358451	358456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021723	ATGCT	2	10	359431	359440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_021723	CG	3	6	359454	359459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_021723	A	6	6	359471	359476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021723	GAA	2	6	360479	360484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021723	TC	3	6	360877	360882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_021723	GT	3	6	360901	360906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021723	GAA	2	6	362964	362969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021723	CGG	2	6	364614	364619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021723	GTT	2	6	364661	364666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021723	GGA	2	6	364667	364672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021723	TAA	2	6	364686	364691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021723	A	6	6	364699	364704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021723	ATA	2	6	364715	364720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021723	A	6	6	364770	364775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021723	AGA	2	6	364822	364827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021723	CATT	2	8	364838	364845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_021723	A	6	6	364856	364861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021723	AGA	2	6	364886	364891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021723	GAA	2	6	366448	366453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021723	AT	3	6	366654	366659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_021723	T	6	6	366826	366831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_021723	ATT	2	6	462877	462882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_021723	AAATG	2	10	462914	462923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_021723	TCAA	2	8	462931	462938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1414	NC_021723	AT	3	6	462947	462952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_021723	TTC	2	6	462980	462985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_021723	CGTCA	2	10	463113	463122	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1426	NC_021723	ATG	2	6	463384	463389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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