MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919 plasmid pLOCK919

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021722	TTTG	2	8	1851	1858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021722	CTTA	2	8	1888	1895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021722	CGTG	2	8	2546	2553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021722	CTCC	2	8	2597	2604	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_021722	CTTG	2	8	2816	2823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021722	AGGA	2	8	5493	5500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021722	GTTA	2	8	5579	5586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021722	TGGC	2	8	5686	5693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021722	GAAG	2	8	7149	7156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021722	CAAA	2	8	7166	7173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021722	AGAA	2	8	7182	7189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021722	GATG	2	8	10213	10220	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021722	CAAG	2	8	15888	15895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021722	ATGA	2	8	17174	17181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021722	TGCT	2	8	17390	17397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021722	AGTA	2	8	17934	17941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021722	TTAG	2	8	18054	18061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021722	TCCG	2	8	20181	20188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021722	TTTA	2	8	20212	20219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021722	AAAT	2	8	25548	25555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021722	TGGC	2	8	25572	25579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021722	ACGT	2	8	26043	26050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021722	AAGG	2	8	26075	26082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.