MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919 plasmid pLOCK919

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021722	TAA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021722	AGC	2	6	2186	2191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021722	TGC	2	6	2259	2264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021722	ATG	2	6	2540	2545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021722	GCC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021722	TGC	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021722	GGT	2	6	2824	2829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021722	GTC	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021722	TTA	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021722	CAT	2	6	3005	3010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021722	CAT	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021722	AAG	2	6	3999	4004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021722	AGG	2	6	4014	4019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021722	AGC	2	6	4202	4207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021722	TTA	2	6	5463	5468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021722	AGG	2	6	5614	5619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021722	GGT	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021722	AAG	2	6	10331	10336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021722	ACC	2	6	10377	10382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021722	CAA	2	6	11290	11295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021722	GGT	2	6	11378	11383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021722	TAT	2	6	11389	11394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021722	GAG	2	6	11429	11434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021722	TAA	2	6	15871	15876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021722	TAA	2	6	17098	17103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021722	TTA	2	6	17120	17125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021722	TCA	2	6	17198	17203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021722	GAT	2	6	17256	17261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021722	TTC	2	6	17452	17457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021722	GAT	2	6	18187	18192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021722	ACG	2	6	18212	18217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021722	AAT	2	6	18225	18230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021722	TGT	2	6	18231	18236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021722	CTT	2	6	18286	18291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021722	AAG	2	6	18954	18959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021722	TAA	2	6	19938	19943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021722	ACA	2	6	20295	20300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021722	TGT	2	6	21917	21922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021722	ATC	2	6	21954	21959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021722	ATT	2	6	21962	21967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021722	ACG	2	6	25125	25130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021722	CTC	2	6	25445	25450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021722	CAG	2	6	25479	25484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021722	CAA	2	6	25507	25512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021722	GAA	2	6	25566	25571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021722	TCC	2	6	25905	25910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021722	TGT	2	6	25977	25982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021722	TCC	2	6	29361	29366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021722	CGA	2	6	29706	29711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.