MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021721	CTATTA	2	12	1533	1544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021721	TGTTTT	2	12	30045	30056	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021721	AACTGA	2	12	38126	38137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021721	TAATTT	2	12	42329	42340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021721	TTCTTT	2	12	52094	52105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021721	GCTCAC	2	12	78616	78627	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021721	TGATCT	2	12	78905	78916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021721	GGAGAA	2	12	79196	79207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021721	AAAAAT	2	12	80381	80392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021721	AATATA	2	12	87644	87655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021721	ATGAAG	2	12	87683	87694	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021721	CATTCT	2	12	143891	143902	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021721	AACTTT	2	12	145068	145079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021721	TCGCAG	2	12	146246	146257	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021721	GTGAGC	2	12	151347	151358	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021721	GTGATG	2	12	166859	166870	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021721	GAATAA	2	12	172504	172515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021721	TCGCAG	2	12	182219	182230	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021721	TGACAA	2	12	191080	191091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021721	ATCAAA	2	12	195772	195783	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021721	TAAAAA	2	12	196024	196035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021721	GGGCAA	2	12	248950	248961	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021721	TGGAAG	2	12	277127	277138	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021721	CTGCGA	2	12	277216	277227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021721	TAAAAA	2	12	305890	305901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021721	TTAGGT	2	12	324984	324995	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021721	ACAAAA	2	12	343865	343876	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021721	GTCATT	2	12	353617	353628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021721	TTGTAA	2	12	370572	370583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021721	AATTTA	2	12	376044	376055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021721	TGAAAT	2	12	382196	382207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021721	ATATTG	2	12	384367	384378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021721	TCTTTT	2	12	385281	385292	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021721	CATTGC	2	12	397658	397669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021721	ACCTTT	2	12	466325	466336	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021721	TCGCAG	2	12	474791	474802	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021721	TCGCAG	2	12	475035	475046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021721	GCTCAC	2	12	475135	475146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021721	CTCTAT	2	12	502684	502695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021721	TGAAGA	2	12	516152	516163	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021721	ATTTGT	2	12	519767	519778	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021721	ATTGAA	2	12	529069	529080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021721	ACCTGA	2	12	540861	540872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021721	CAACAT	2	12	601517	601528	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021721	AGACCT	2	12	614147	614158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021721	ACCGCT	2	12	649077	649088	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021721	GAAAAA	2	12	658301	658312	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021721	TCTAAA	2	12	668510	668521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021721	TGCGAC	2	12	734788	734799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021721	AAAACA	2	12	773344	773355	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021721	ATGCTC	2	12	789603	789614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021721	TCGCAG	2	12	843518	843529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021721	TCGCAG	2	12	873424	873435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021721	AAAATA	2	12	876344	876355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021721	ATGGCG	2	12	908575	908586	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021721	AACTTT	2	12	913793	913804	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021721	TGGAAG	2	12	938085	938096	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021721	CTGCGA	2	12	938174	938185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021721	TGTTAT	2	12	939192	939203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021721	TATACT	2	12	943923	943934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021721	TGGAAG	2	12	957451	957462	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021721	CGCAGG	2	12	957525	957536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021721	CTGCGA	2	12	957540	957551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021721	TCGCAG	2	12	965854	965865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021721	CTGCGA	2	12	1039235	1039246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021721	TTTAGT	2	12	1177751	1177762	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021721	TGAATT	2	12	1211338	1211349	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021721	ACCGAC	2	12	1220101	1220112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021721	GAAAAG	2	12	1278277	1278288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021721	GCTGGT	2	12	1312128	1312139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021721	AACGAA	2	12	1344405	1344416	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021721	TCCACC	2	12	1365223	1365234	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021721	CCTTGA	2	12	1366779	1366790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021721	AAAAGG	2	12	1367893	1367904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021721	AGATCT	2	12	1375878	1375889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021721	CGGCCT	2	12	1378286	1378297	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021721	ATGAAA	2	12	1379460	1379471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021721	AGCGCA	2	12	1426105	1426116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021721	TGAAAA	2	12	1493388	1493399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021721	GATAGT	2	12	1511730	1511741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021721	TCGCAG	2	12	1542034	1542045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021721	AGGATG	2	12	1544168	1544179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021721	TCGCAG	2	12	1574910	1574921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021721	CGAAAA	2	12	1574963	1574974	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021721	GATCAG	2	12	1575197	1575208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021721	TCGCAG	2	12	1601438	1601449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021721	AAACGG	2	12	1605750	1605761	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021721	TTTTGA	2	12	1665553	1665564	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021721	GCACGC	2	12	1679332	1679343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021721	AATGCT	2	12	1683871	1683882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021721	ACAGGT	2	12	1688817	1688828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021721	CCTGCC	2	12	1782826	1782837	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021721	ATTAAA	2	12	1825767	1825778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021721	ATATGG	2	12	1873276	1873287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021721	TCGCCA	2	12	1890167	1890178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021721	ATCAAA	2	12	1892723	1892734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021721	TTGTTT	2	12	1904883	1904894	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021721	TTACGA	2	12	1918231	1918242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021721	TCGCAG	2	12	1966496	1966507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021721	CACTTC	2	12	1966659	1966670	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021721	ATTGTT	2	12	1975258	1975269	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021721	TCGCAG	2	12	1978644	1978655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021721	GACATG	2	12	2023269	2023280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021721	TAACCT	2	12	2034761	2034772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021721	CTTTCA	2	12	2036776	2036787	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021721	ACGATT	2	12	2036879	2036890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021721	GGACAA	2	12	2042706	2042717	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021721	TTTTTC	2	12	2048393	2048404	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021721	GATCTT	2	12	2139596	2139607	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021721	CATAAC	2	12	2150838	2150849	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021721	CTCGCA	2	12	2215991	2216002	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021721	CTGCGA	2	12	2258870	2258881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021721	ATTTTA	2	12	2279301	2279312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021721	TCATTT	2	12	2286427	2286438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021721	GATATG	2	12	2291889	2291900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021721	ATTTAA	2	12	2301378	2301389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021721	AAATTG	2	12	2309011	2309022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021721	GTGAGC	2	12	2385255	2385266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021721	TTCGCA	2	12	2399782	2399793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021721	ACTGGA	2	12	2414376	2414387	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021721	CCACAT	2	12	2449191	2449202	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021721	TCCTAT	2	12	2458549	2458560	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021721	GATACC	2	12	2461666	2461677	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021721	TAACAA	2	12	2482650	2482661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021721	CATGAA	2	12	2491862	2491873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021721	AATTTA	2	12	2494193	2494204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021721	GTCTTC	2	12	2521067	2521078	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021721	TAGGCA	2	12	2543911	2543922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021721	TTTAGA	2	12	2554042	2554053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021721	ACATAT	2	12	2595441	2595452	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021721	AACGGC	2	12	2665746	2665757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021721	TCGCAG	2	12	2675464	2675475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021721	TTTGAC	2	12	2686275	2686286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021721	TCGCAG	2	12	2687371	2687382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021721	ACCTGC	2	12	2687385	2687396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021721	CACTTC	2	12	2687458	2687469	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021721	CTGCGA	2	12	2711292	2711303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021721	ATGACC	2	12	2779016	2779027	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021721	CTGCGA	2	12	2785217	2785228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021721	CTGCGA	2	12	2820673	2820684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021721	TTTCAG	2	12	2824118	2824129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_021721	TTCAAT	2	12	2834869	2834880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_021721	TCGCAG	2	12	2936341	2936352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021721	TGATTC	2	12	2962575	2962586	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_021721	TTCCTA	2	12	2984922	2984933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021721	ATTTCC	2	12	2999177	2999188	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021721	TCGCAG	2	12	3006328	3006339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021721	TCGCAG	2	12	3024638	3024649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021721	GTGAGC	2	12	3025640	3025651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_021721	ATATCG	2	12	3079052	3079063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_021721	TTTCTA	2	12	3095197	3095208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_021721	TACTGC	2	12	3095279	3095290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.