MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 1353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021721	AAAC	2	8	1443	1450	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021721	TAAT	2	8	3230	3237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021721	TTTG	2	8	9615	9622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021721	GCAA	2	8	10431	10438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021721	AAAT	2	8	12721	12728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021721	AAGG	2	8	15395	15402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021721	TGTT	2	8	16337	16344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021721	AAGC	2	8	16396	16403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021721	TAAT	2	8	17163	17170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021721	CGTT	2	8	17823	17830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021721	AGCT	2	8	19262	19269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021721	GGTA	2	8	19683	19690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021721	GGTT	2	8	26447	26454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021721	CATA	2	8	26493	26500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021721	AGTG	2	8	26639	26646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021721	AACA	2	8	27446	27453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021721	ATAA	2	8	30256	30263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021721	AAGC	2	8	35090	35097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021721	AGCA	2	8	36596	36603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021721	ATTT	2	8	36644	36651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021721	AAGG	2	8	38505	38512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021721	GCCG	2	8	39075	39082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021721	AGAA	2	8	39414	39421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021721	CTTT	2	8	42837	42844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021721	TCTT	2	8	42930	42937	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021721	TCAT	2	8	47101	47108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021721	AATC	2	8	47417	47424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021721	GTCA	2	8	47933	47940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021721	AAAG	2	8	48842	48849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021721	CAAA	2	8	49167	49174	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021721	GGAG	2	8	53151	53158	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021721	TGAA	2	8	54965	54972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021721	TGAA	2	8	55007	55014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021721	AAAG	2	8	57710	57717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021721	TTCA	2	8	67905	67912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021721	ACAA	2	8	68257	68264	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021721	TTGT	2	8	68295	68302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021721	GACT	2	8	68369	68376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021721	TACT	2	8	73912	73919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021721	ATGA	2	8	78933	78940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021721	GAGG	2	8	83313	83320	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021721	ACAG	2	8	84287	84294	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021721	ATTA	2	8	84320	84327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021721	TCCC	2	8	88741	88748	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_021721	AGTA	2	8	88776	88783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021721	AAGC	2	8	89819	89826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021721	GCTT	2	8	91351	91358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021721	TTTG	2	8	96901	96908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021721	CAAA	2	8	96918	96925	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021721	GTTG	2	8	97103	97110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021721	AAAT	2	8	97160	97167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021721	GTCT	2	8	97307	97314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021721	GTGA	2	8	101779	101786	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021721	TCAT	2	8	103319	103326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021721	AAAT	2	8	103438	103445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021721	GCTT	2	8	105780	105787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021721	ATCA	2	8	106422	106429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021721	TTGT	2	8	109722	109729	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021721	AAGA	2	8	111235	111242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021721	TATC	2	8	112756	112763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021721	GCAA	2	8	112787	112794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021721	CTTT	2	8	115822	115829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021721	TCGT	2	8	123320	123327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021721	AAAT	2	8	131027	131034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021721	CCGG	2	8	131201	131208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021721	AAAC	2	8	133595	133602	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021721	GGTG	2	8	139595	139602	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021721	ATTA	2	8	139821	139828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021721	TTAG	2	8	139870	139877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021721	TGAC	2	8	141296	141303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021721	TGGT	2	8	143792	143799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021721	TGTT	2	8	144004	144011	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021721	CAGA	2	8	144088	144095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021721	AAAT	2	8	145197	145204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021721	ATTA	2	8	147545	147552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021721	TTAA	2	8	147685	147692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021721	GATT	2	8	151021	151028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021721	TTTC	2	8	153537	153544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021721	TTCC	2	8	163828	163835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021721	TTTC	2	8	163966	163973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021721	TTTA	2	8	164014	164021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021721	TTCC	2	8	164289	164296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021721	AGCA	2	8	164350	164357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021721	AGTA	2	8	165554	165561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021721	ACAT	2	8	171340	171347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021721	GAAT	2	8	172579	172586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021721	AAAT	2	8	179603	179610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021721	TAAC	2	8	190913	190920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021721	GCAG	2	8	190948	190955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021721	CAGA	2	8	195860	195867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021721	TGAA	2	8	196059	196066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021721	AGTG	2	8	201324	201331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021721	AAGG	2	8	203721	203728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021721	AAAC	2	8	208983	208990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021721	AGAA	2	8	212417	212424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021721	AGTA	2	8	212761	212768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021721	TTAA	2	8	213245	213252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021721	AAAG	2	8	213403	213410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021721	TGCT	2	8	218055	218062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021721	GTTT	2	8	219514	219521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021721	GAAA	2	8	219558	219565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021721	CAGC	2	8	220133	220140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021721	TGTT	2	8	220279	220286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021721	AGGC	2	8	220313	220320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021721	CTTT	2	8	226164	226171	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021721	AAGA	2	8	234998	235005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021721	TCAA	2	8	235068	235075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021721	TACT	2	8	235077	235084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021721	TAAA	2	8	236058	236065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021721	CCTT	2	8	236990	236997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021721	TATT	2	8	237075	237082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021721	TGAA	2	8	237134	237141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021721	GTTT	2	8	250069	250076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021721	ATAA	2	8	252800	252807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021721	GGAT	2	8	254264	254271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021721	ATCA	2	8	267579	267586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021721	TATG	2	8	267610	267617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021721	AGCA	2	8	269533	269540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021721	GTGC	2	8	272165	272172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021721	TGAG	2	8	272214	272221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021721	GTCA	2	8	272247	272254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021721	TGGA	2	8	272732	272739	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021721	GTGA	2	8	272911	272918	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021721	AGCG	2	8	273081	273088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021721	ATGG	2	8	273746	273753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021721	GAGC	2	8	273965	273972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021721	TAAG	2	8	274360	274367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021721	AGAA	2	8	274490	274497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021721	GCGA	2	8	274519	274526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021721	GCTT	2	8	274551	274558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021721	TTGC	2	8	274905	274912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021721	ATGT	2	8	275053	275060	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021721	GAGC	2	8	275961	275968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021721	TAGG	2	8	276407	276414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021721	CTGC	2	8	277400	277407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021721	TAAG	2	8	277474	277481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021721	GACT	2	8	279317	279324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021721	AACC	2	8	279509	279516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021721	CCGA	2	8	279624	279631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021721	AAAG	2	8	286821	286828	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021721	ATGG	2	8	292379	292386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021721	TAGA	2	8	292590	292597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021721	CTTG	2	8	299843	299850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021721	GTTA	2	8	299856	299863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021721	ACAT	2	8	299874	299881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021721	CCGG	2	8	299952	299959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021721	TTTA	2	8	301427	301434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021721	TTGC	2	8	301458	301465	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021721	TGCT	2	8	301492	301499	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021721	ATGA	2	8	304550	304557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021721	TGGT	2	8	305950	305957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021721	ATGA	2	8	309237	309244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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