MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	CGAC	2	8	339	346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021527	AAAG	2	8	486	493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021527	TCAT	2	8	4542	4549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021527	CTCG	2	8	4553	4560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021527	AAAG	2	8	4816	4823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021527	ACAA	2	8	7388	7395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021527	GCTA	2	8	7540	7547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021527	CATA	2	8	7645	7652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021527	TTTG	2	8	7703	7710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021527	TAAA	2	8	7778	7785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021527	TTGG	2	8	9640	9647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021527	AGGA	2	8	12554	12561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021527	AGAA	2	8	17807	17814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021527	TTGT	2	8	18172	18179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021527	GTTA	2	8	18495	18502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021527	CTGA	2	8	18516	18523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021527	TGGC	2	8	21787	21794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021527	GGGA	2	8	22746	22753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021527	AAAT	2	8	26071	26078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021527	TGAG	2	8	26433	26440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021527	TGGT	2	8	27647	27654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021527	CAGC	2	8	27715	27722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021527	AGAT	2	8	28553	28560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021527	CAAT	2	8	28734	28741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021527	GTGC	2	8	28928	28935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021527	ATTA	2	8	31252	31259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021527	CTTA	2	8	41755	41762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021527	ATTT	2	8	41794	41801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021527	TTGG	2	8	42802	42809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021527	ATTA	2	8	42864	42871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021527	ACTT	2	8	43621	43628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021527	TATT	2	8	43752	43759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021527	AGTT	2	8	43849	43856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021527	CAAA	2	8	47095	47102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021527	TAAG	2	8	48102	48109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021527	GGTG	2	8	50123	50130	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021527	TAAA	2	8	51705	51712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021527	CACC	2	8	51800	51807	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.