MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	ACG	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021527	CGAC	2	8	339	346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021527	GTCAA	2	10	471	480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021527	AAAG	2	8	486	493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021527	TGG	2	6	495	500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021527	GATTT	2	10	816	825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021527	TC	3	6	3183	3188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021527	AATTT	2	10	3247	3256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021527	TTAAA	2	10	3269	3278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021527	AT	3	6	4427	4432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021527	AGC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021527	TCAT	2	8	4542	4549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021527	CTCG	2	8	4553	4560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021527	ACC	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021527	AAT	2	6	4646	4651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021527	ATT	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021527	GAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021527	ATT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021527	AAAG	2	8	4816	4823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021527	GAA	2	6	5814	5819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021527	TAA	2	6	5820	5825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021527	GCT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021527	ATT	2	6	5870	5875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021527	CTA	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021527	CTC	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021527	CAG	2	6	7236	7241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021527	AT	3	6	7249	7254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021527	ACAA	2	8	7388	7395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021527	A	9	9	7438	7446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021527	AAT	2	6	7469	7474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021527	GCTA	2	8	7540	7547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021527	ACT	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021527	AGT	2	6	7565	7570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021527	CATA	2	8	7645	7652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021527	GGC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021527	TTTG	2	8	7703	7710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021527	TAAA	2	8	7778	7785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021527	A	6	6	7787	7792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021527	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021527	ATG	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021527	T	6	6	8025	8030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021527	TTGG	2	8	9640	9647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021527	GTT	2	6	9692	9697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021527	TTA	2	6	9701	9706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021527	GTC	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021527	CTC	2	6	9741	9746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021527	AGT	2	6	9835	9840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021527	TGA	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021527	AGT	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021527	AGGA	2	8	12554	12561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021527	TAT	2	6	12564	12569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021527	AGG	2	6	13818	13823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021527	TGG	3	9	15955	15963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021527	GGT	2	6	15979	15984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021527	AGAA	2	8	17807	17814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021527	TAAAAA	2	12	17837	17848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021527	TGG	2	6	17894	17899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021527	TAA	2	6	17999	18004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021527	AGTATT	2	12	18107	18118	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021527	TTA	2	6	18125	18130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021527	AAG	2	6	18131	18136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021527	TTGT	2	8	18172	18179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021527	TG	3	6	18233	18238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021527	A	6	6	18245	18250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021527	AAG	2	6	18310	18315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021527	CT	3	6	18342	18347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021527	TAC	2	6	18353	18358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021527	CAG	2	6	18366	18371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021527	AGG	2	6	18402	18407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021527	CGT	2	6	18444	18449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021527	T	6	6	18489	18494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021527	GTTA	2	8	18495	18502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021527	CTGA	2	8	18516	18523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021527	TAG	2	6	18529	18534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021527	AAC	2	6	18546	18551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021527	GTT	2	6	18562	18567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021527	T	6	6	18571	18576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021527	AGG	2	6	18604	18609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021527	GGT	2	6	21678	21683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021527	TGG	2	6	21688	21693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021527	TGG	2	6	21721	21726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021527	A	6	6	21737	21742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021527	TGGC	2	8	21787	21794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021527	CTT	2	6	21836	21841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021527	ATT	2	6	21919	21924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021527	GAG	2	6	21928	21933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021527	GTT	2	6	21934	21939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021527	GGGA	2	8	22746	22753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021527	AAAT	2	8	26071	26078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021527	CA	3	6	26417	26422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021527	TGAG	2	8	26433	26440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021527	AGCGAT	2	12	26449	26460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021527	A	8	8	26834	26841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021527	TGGT	2	8	27647	27654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021527	AGA	2	6	27673	27678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021527	CAGC	2	8	27715	27722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021527	A	6	6	28273	28278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021527	AAAGCT	2	12	28286	28297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021527	TAA	2	6	28352	28357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021527	TAT	2	6	28432	28437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021527	GGGCT	2	10	28491	28500	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021527	AGAT	2	8	28553	28560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021527	TGT	2	6	28588	28593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021527	A	7	7	28599	28605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021527	A	6	6	28650	28655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021527	TA	3	6	28666	28671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021527	CAAT	2	8	28734	28741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021527	ATT	2	6	28884	28889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021527	AAT	2	6	28897	28902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021527	GTGC	2	8	28928	28935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021527	CAT	2	6	28947	28952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021527	A	6	6	28960	28965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021527	ATTAA	2	10	29017	29026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021527	CA	3	6	31227	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021527	ATTA	2	8	31252	31259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021527	AGT	2	6	31282	31287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021527	AGG	2	6	31306	31311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021527	T	6	6	31314	31319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021527	AGG	2	6	34952	34957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021527	TAC	2	6	35327	35332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021527	AAC	2	6	35369	35374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021527	GAG	2	6	38268	38273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021527	TGG	2	6	38274	38279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021527	AGT	2	6	41194	41199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021527	TCA	2	6	41218	41223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021527	TGG	2	6	41244	41249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021527	AAT	2	6	41259	41264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021527	AGG	2	6	41325	41330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021527	TTC	2	6	41656	41661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021527	CAA	2	6	41721	41726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021527	A	6	6	41725	41730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021527	CTTA	2	8	41755	41762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021527	ATTT	2	8	41794	41801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021527	ATA	2	6	41811	41816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021527	TTGG	2	8	42802	42809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021527	CTA	2	6	42816	42821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021527	ATTA	2	8	42864	42871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021527	TCA	2	6	42908	42913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021527	T	6	6	42949	42954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021527	ACTT	2	8	43621	43628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021527	AAT	2	6	43664	43669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021527	TGG	2	6	43730	43735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021527	ATT	2	6	43737	43742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021527	TATT	2	8	43752	43759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021527	ATT	2	6	43808	43813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021527	AGTT	2	8	43849	43856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021527	ATA	2	6	43908	43913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021527	TAA	2	6	44004	44009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021527	TAT	2	6	44070	44075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_021527	ATT	2	6	46237	46242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_021527	AAT	2	6	46952	46957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_021527	GAA	2	6	46982	46987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_021527	CA	3	6	51827	51832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.