MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16D

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021526	TGGC	2	8	64	71	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021526	TGTT	2	8	5104	5111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021526	AAGT	2	8	8044	8051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021526	GTTT	2	8	12415	12422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021526	TTAA	2	8	13417	13424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021526	TAAT	2	8	13431	13438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021526	TAGT	2	8	13727	13734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021526	TAAT	2	8	13834	13841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021526	AGGT	2	8	13881	13888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021526	CAGC	2	8	14477	14484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021526	CAAC	2	8	14511	14518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021526	AGTA	2	8	17319	17326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021526	TAAA	2	8	17341	17348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021526	TAAT	2	8	17464	17471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021526	TAGA	2	8	17569	17576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021526	TAAG	2	8	17664	17671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021526	TGGC	2	8	18438	18445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021526	TAGT	2	8	18622	18629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021526	GAAA	2	8	18726	18733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021526	TGTT	2	8	24904	24911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021526	AGTT	2	8	25534	25541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021526	TGGT	2	8	28007	28014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021526	CTAG	2	8	28083	28090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021526	AATA	3	12	28195	28206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021526	TTGA	2	8	28350	28357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021526	GCAC	2	8	29785	29792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021526	CTTG	2	8	30159	30166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021526	AAAG	2	8	30366	30373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021526	AAAG	2	8	31943	31950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021526	TGAT	2	8	35607	35614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021526	TTTA	2	8	35732	35739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021526	ACTT	2	8	36638	36645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021526	TAAT	2	8	36748	36755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021526	CCAA	2	8	36810	36817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.